(1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonoxymethyl-3-(cytosin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane | 293751-19-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonoxymethyl-3-(cytosin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
• 英文别名: [(1R,3R,4R,7S)-3-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-7-phenylmethoxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methyl methanesulfonate
• CAS: 293751-19-6
• 化学式: C₁₈H₂₁N₃O₇S
• 分子量: 423.447
• InChiKey: QRJQESBONVDDFO-KYHPRHEASA-N

物化性质

• 沸点：
  641.2±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.57±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonoxymethyl-3-(cytosin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane 在 palladium dihydroxide 吡啶 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 (1S,3R,4R,7S)-3-(4-N-benzoylcytosin-1-yl)-7-hydroxy-1-hydroxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  通往2'-O，4'-C-亚甲基连接的双环核糖核苷（锁定核酸）的简便有效途径。

  摘要：

  描述了一种合成锁核酸（LNA）单体的新型有效方法。通过聚合合成制备了含有胸腺嘧啶，4-N-乙酰基和4-N-苯甲酰基胞嘧啶，6-N-苯甲酰腺嘌呤和2-N-异丁酰鸟嘌呤作为核碱基的LNA 5'，3'-二醇。该方法基于使用常见的糖中间体1,2-二-O-乙酰基-3-O-苄基-4-C-甲磺酰氧基甲基-5-O-甲磺酰-D-赤型戊呋喃糖（8）可以从D-葡萄糖以克数制得。使用改良的Vorbrüggen程序将四个不同的核碱基立体选择性地偶联到8个核碱基上，得到相应的4'-C-支链核苷衍生物。随后的闭环提供了受保护的LNA核苷。使用苯甲酸钠通过亲核取代有效地置换了5'-O-甲磺酰基。将5'-苯甲酸酯皂化，然后催化除去3'-O-苄基，得到游离的LNA二醇。腺苷和胞苷的环外氨基被选择性地酰化，得到4-N-乙酰基或4-N-苯甲酰基-LNA-C和6-N-苯甲酰基-LNA-A。在制备2-N-异丁酰基-LNA-G期间，鸟

  DOI：

  10.1021/jo010732p
• 作为产物：
  描述：

  3-O-苄基-4-C-羟甲基-1,2-O-异亚丙基-ALPHA-D-呋喃核糖 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 硫酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 溶剂黄146 、 乙腈 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonoxymethyl-3-(cytosin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  通往2'-O，4'-C-亚甲基连接的双环核糖核苷（锁定核酸）的简便有效途径。

  摘要：

  描述了一种合成锁核酸（LNA）单体的新型有效方法。通过聚合合成制备了含有胸腺嘧啶，4-N-乙酰基和4-N-苯甲酰基胞嘧啶，6-N-苯甲酰腺嘌呤和2-N-异丁酰鸟嘌呤作为核碱基的LNA 5'，3'-二醇。该方法基于使用常见的糖中间体1,2-二-O-乙酰基-3-O-苄基-4-C-甲磺酰氧基甲基-5-O-甲磺酰-D-赤型戊呋喃糖（8）可以从D-葡萄糖以克数制得。使用改良的Vorbrüggen程序将四个不同的核碱基立体选择性地偶联到8个核碱基上，得到相应的4'-C-支链核苷衍生物。随后的闭环提供了受保护的LNA核苷。使用苯甲酸钠通过亲核取代有效地置换了5'-O-甲磺酰基。将5'-苯甲酸酯皂化，然后催化除去3'-O-苄基，得到游离的LNA二醇。腺苷和胞苷的环外氨基被选择性地酰化，得到4-N-乙酰基或4-N-苯甲酰基-LNA-C和6-N-苯甲酰基-LNA-A。在制备2-N-异丁酰基-LNA-G期间，鸟

  DOI：

  10.1021/jo010732p

文献信息

• IMPROVED SYNTHESIS OF ¬2.2.1|BICYCLO NUCLEOSIDES
  申请人：Exiqon A/S

  公开号：EP1163250B1

  公开（公告）日：2006-07-12
• Chemoenzymatic Convergent Synthesis of 2′-<i>O</i>,4′-<i>C</i>-Methyleneribonucleosides
  作者：Vivek K. Sharma、Manish Kumar、Carl E. Olsen、Ashok K. Prasad

  DOI：10.1021/jo5008338

  日期：2014.7.3

  Novozyme-435-catalyzed efficient regioselective acetylation of one of the two diastereotopic hydroxymethyl functions in 3-O-benzyl-4-C-hydroxymethyl-1,2-O-isopropylidene-alpha-D-ribofuranose has been achieved. The enzymatic methodology has been successfully utilized for convergent synthesis of bicyclic nucleosides (LNA monomers) T, U, A, and C. Further, it has been demonstrated that Novozyme-435 can be used for 10 cycles of the acylation reaction without losing selectivity and efficiency.
• A Simplified and Efficient Route to 2‘-<i>O</i>, 4‘-<i>C</i>-Methylene-Linked Bicyclic Ribonucleosides (Locked Nucleic Acid)
  作者：Alexei A. Koshkin、Jef Fensholdt、Henrik M. Pfundheller、Christian Lomholt

  DOI：10.1021/jo010732p

  日期：2001.12.1

  can be prepared from D-glucose in multigram scale. Four different nucleobases were stereoselectively coupled to 8 using a modified Vorbrüggen procedure to give the corresponding 4'-C-branched nucleoside derivatives. Subsequent ring closing furnished the protected LNA nucleosides. The 5'-O-mesyl groups were efficiently displaced by nucleophilic substitution using sodium benzoate. Saponification of the

  描述了一种合成锁核酸（LNA）单体的新型有效方法。通过聚合合成制备了含有胸腺嘧啶，4-N-乙酰基和4-N-苯甲酰基胞嘧啶，6-N-苯甲酰腺嘌呤和2-N-异丁酰鸟嘌呤作为核碱基的LNA 5'，3'-二醇。该方法基于使用常见的糖中间体1,2-二-O-乙酰基-3-O-苄基-4-C-甲磺酰氧基甲基-5-O-甲磺酰-D-赤型戊呋喃糖（8）可以从D-葡萄糖以克数制得。使用改良的Vorbrüggen程序将四个不同的核碱基立体选择性地偶联到8个核碱基上，得到相应的4'-C-支链核苷衍生物。随后的闭环提供了受保护的LNA核苷。使用苯甲酸钠通过亲核取代有效地置换了5'-O-甲磺酰基。将5'-苯甲酸酯皂化，然后催化除去3'-O-苄基，得到游离的LNA二醇。腺苷和胞苷的环外氨基被选择性地酰化，得到4-N-乙酰基或4-N-苯甲酰基-LNA-C和6-N-苯甲酰基-LNA-A。在制备2-N-异丁酰基-LNA-G期间，鸟