(1S,3R,4R,7S)-3-(2-amino-6-chloropurin-9-yl)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane | 675848-74-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (1S,3R,4R,7S)-3-(2-amino-6-chloropurin-9-yl)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
• 英文别名: (1R,3R,4R,7S)-3-(2-amino-6-chloropurin-9-yl)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane；[(1R,3R,4R,7S)-3-(2-amino-6-chloropurin-9-yl)-7-phenylmethoxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methyl methanesulfonate
• CAS: 675848-74-5
• 化学式: C₁₉H₂₀ClN₅O₆S
• 分子量: 481.917
• InChiKey: PHFXJDPMVMEAMX-QOIYZWAUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,3R,4R,7S)-3-(2-amino-6-chloropurin-9-yl)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane 在 sodium azide 作用下， 以 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 [(1R,3R,4R,7S)-3-(2-amino-6-azidopurin-9-yl)-7-phenylmethoxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methyl benzoate
  参考文献：
  名称：

  Koshkin, Alexei A., Journal of Organic Chemistry, 2004, vol. 69, # 11, p. 3711 - 3718

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  D-glucose 在 吡啶 、 sodium hypochlorite 、 sodium tetrahydroborate 、 sodium periodate 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 磷酸 、 硫酸 、 四丁基硫酸氢铵 、 碳酸氢钠 、 溶剂黄146 、 potassium bromide 、 sodium hydroxide 、 zinc(II) chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 29.33h， 生成 (1S,3R,4R,7S)-3-(2-amino-6-chloropurin-9-yl)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL PROCESS FOR MAKING ALLOFURANOSE FROM GLUCOFURANOSE
  [FR] NOUVEAU PROCÉDÉ DE FABRICATION D'ALLOFURANOSE À PARTIR DE GLUCOFURANOSE

  摘要：

  本发明涉及从描述和权利要求中定义的葡糖呋喃糖中制备阿洛呋喃糖。阿洛呋喃糖是合成寡核苷酸时的中间体，可用作药物。

  公开号：

  WO2019224172A1

文献信息

• LNA guanine and 2,6-diaminopurine. Synthesis, characterization and hybridization properties of LNA 2,6-diaminopurine containing oligonucleotides
  作者：Christoph Rosenbohm、Daniel Sejer Pedersen、Miriam Frieden、Flemming R. Jensen、Susan Arent、Sine Larsen、Troels Koch

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.02.008

  日期：2004.5

  LNA guanine and 2,6-diaminopurine (D) phosphoramidites have been synthesized as building blocks for antisense oligonucleotides (ON). The effects of incorporating LNA D into ON were investigated. As expected, LNA D containing ON showed increased affinity towards complementary DNA (Delta Tm +1.6 to +3.0 degrees C) and RNA (Delta Tm +2.6 to +4.6 degrees C) ON. To evaluate if LNA D containing ON have an

  LNA鸟嘌呤和2,6-二氨基嘌呤（D）亚磷酰胺已合成为反义寡核苷酸（ON）的构件。研究了将LNA D掺入ON的效果。不出所料，含有ON的LNA D对互补DNA（ΔTm +1.6至+3.0摄氏度）和RNA（ΔTm +2.6至+4.6摄氏度）ON表现出更高的亲和力。为了评估含有ON的LNA D与含有ON的互补LNA A相比是否具有增强的错配敏感性，进行了针对单个错配DNA和RNA ON的热变性实验。在完全LNA修饰的ON中，用LNA D取代一个LNA A残基，导致对DNA ON的错配敏感性更高（Delta Delta Tm -4至> -17摄氏度）。观察到朝向单个错配的RNA ON的相同趋势（Delta Delta Tm Da = -8.7摄氏度，Dg = -4。