(1R,3R,4R,7S)-1-benzoyloxymethyl-7-benzyloxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane | 552856-43-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (1R,3R,4R,7S)-1-benzoyloxymethyl-7-benzyloxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
• 英文别名: [(1R,3R,4R,7S)-3-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-7-phenylmethoxy-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methyl benzoate
• CAS: 552856-43-6
• 化学式: C₂₅H₂₅N₃O₆
• 分子量: 463.49
• InChiKey: PXSLOAOGZWYULC-BVVSVSJTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  106
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,3R,4R,7S)-1-benzoyloxymethyl-7-benzyloxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane 在 palladium dihydroxide 氨 、 氢气 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-7-hydroxy-1-hydroxymethyl-3-(thymin-1-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  合成2'-氨基-LNA：一种新策略。

  摘要：

  在本文中，我们提出了经过修订和显着改进的合成途径，以合成2'-氨基LNA（锁定核酸）。最佳途径与通过普通中间体合成LNA单体（“ 2'-氧基-LNA”）收敛，该中间体是通过轻度脱乙酰作用而释放出2'-羟基而得到的化合物23，而没有伴随的闭环提供2'-氧-LNA骨架。在颠倒C2'处的立体化学并在2'-羟基处形成三氟甲磺酸酯后，获得了新的通用中间体16，该中间体可轻松进入一系列其他类似物，例如通过引入导致2'-硫基的硫亲核试剂-LNA结构。用叠氮化物取代三氟甲磺酸酯后，碱性还原得到所需的2'-氨基-LNA结构，即化合物18。

  DOI：

  10.1039/b208864a
• 作为产物：
  描述：

  1,2-O-(1-甲基亚乙基)-4-C-[[(甲基磺酰基)氧基]甲基]-3-O-(苯基甲基)-alpha-D-赤式-呋喃戊糖 5-甲烷磺酸酯 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 18-冠醚-6 、 三氟甲磺酸酐 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 硫酸 、 氨 、 三氟乙酸 、 sodium hydroxide 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 丙酮 、 乙腈 为溶剂， 反应 105.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-1-benzoyloxymethyl-7-benzyloxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  2'-氨基-LNA胸腺嘧啶和5-甲基胞嘧啶核苷的大规模合成

  摘要：

  从起始糖1分十五步以几克级（50 g，70 mmol）合成了胸腺嘧啶中间体17，总收率为73％，仅需5个纯化步骤。关键的胸腺嘧啶中间体18从一步17中以96％的产率获得，而关键的5-甲基胞嘧啶中间体20从17中分两步以58％的产率获得。这种高效的大规模路线仅需要2个和3个新步骤即可分别从这些关键中间体获得N2'-官能化的胸腺嘧啶和5-甲基胞嘧啶氨基-LNA亚磷酰胺。

  DOI：

  10.1021/jo302036h

文献信息

• Large Scale Synthesis of 2′-Amino-LNA Thymine and 5-Methylcytosine Nucleosides
  作者：Andreas Stahl Madsen、Anna Søndergaard Jørgensen、Troels Bundgaard Jensen、Jesper Wengel

  DOI：10.1021/jo302036h

  日期：2012.12.7

  Thymine intermediate 17 has been synthesized on a multigram scale (50 g, 70 mmol) from starting sugar 1 in 15 steps in an overall yield of 73%, with only 5 purification steps. The key thymine intermediate 18 was obtained from 17 in a single step in 96% yield, whereas the key 5-methylcytosine intermediate 20 was obtained from 17 in 2 steps in 58% yield. This highly efficient large scale route necessitates

  从起始糖1分十五步以几克级（50 g，70 mmol）合成了胸腺嘧啶中间体17，总收率为73％，仅需5个纯化步骤。关键的胸腺嘧啶中间体18从一步17中以96％的产率获得，而关键的5-甲基胞嘧啶中间体20从17中分两步以58％的产率获得。这种高效的大规模路线仅需要2个和3个新步骤即可分别从这些关键中间体获得N2'-官能化的胸腺嘧啶和5-甲基胞嘧啶氨基-LNA亚磷酰胺。
• Synthesis of 2′-amino-LNA: a new strategyElectronic supplementary information (ESI) available: further experimental details and the structure of compound S11 (.pdb file). See http://www.rsc.org/suppdata/ob/b2/b208864a/
  作者：Christoph Rosenbohm、Signe M. Christensen、Mads D. Sørensen、Daniel Sejer Pedersen、Lotte-Emilie Larsen、Jesper Wengel、Troels Koch

  DOI：10.1039/b208864a

  日期：2003.2.11

  significantly improved synthetic routes to 2'-amino-LNA (locked nucleic acid). The optimal route is convergent with the synthesis of LNA monomers ("2'-oxy-LNA") via a common intermediate obtained by a mild deacetylation for the liberation of the 2'-hydroxy group to give compound 23 without the concomitant ring closure that affords the 2'-oxy-LNA skeleton. After inversion of the stereochemistry at C2' and triflate

  在本文中，我们提出了经过修订和显着改进的合成途径，以合成2'-氨基LNA（锁定核酸）。最佳途径与通过普通中间体合成LNA单体（“ 2'-氧基-LNA”）收敛，该中间体是通过轻度脱乙酰作用而释放出2'-羟基而得到的化合物23，而没有伴随的闭环提供2'-氧-LNA骨架。在颠倒C2'处的立体化学并在2'-羟基处形成三氟甲磺酸酯后，获得了新的通用中间体16，该中间体可轻松进入一系列其他类似物，例如通过引入导致2'-硫基的硫亲核试剂-LNA结构。用叠氮化物取代三氟甲磺酸酯后，碱性还原得到所需的2'-氨基-LNA结构，即化合物18。