2',3'-O-isopropylidene-5'-O-methoxymethyl-5,6-dihydrouridine | 85372-74-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 2',3'-O-isopropylidene-5'-O-methoxymethyl-5,6-dihydrouridine
• CAS: 85372-74-3
• 化学式: C₁₄H₂₂N₂O₇
• 分子量: 330.338
• InChiKey: DLYZEADOFOXPKQ-HJQYOEGKSA-N

物化性质

• 密度：
  1.263±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.21
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  95.56
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3'-O-isopropylidene-5'-O-methoxymethyl-5,6-dihydrouridine 在 吡啶 、 silver nitrate 、 5-(乙硫基)-1H-四唑 、 三氟乙酸 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 33.67h， 生成 ((2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-5-pivaloyltetrahydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl ((2R,3S,4R,5R)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl) hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  通过 C5-嘧啶自由基直接切断双链 RNA

  摘要：

  核碱基自由基是核酸暴露于 γ-辐射分解时产生的反应性中间体的主要家族。5,6-二氢尿苷-5-基自由基 (1) 是氢原子加成的正式产物和羟基自由基加成的模型，是通过单链和双链 RNA 中的 Norrish I 型光裂解从酮前体独立生成的。自由基 1 在 5'-相邻核苷酸处产生直接链断裂，并且在自由基产生的初始位点仅观察到少量的链断裂。链断裂优先发生在双链 RNA 中，并且在没有 O(2) 的情况下发生。断链效率的依赖性来自 5，厌氧条件下二级结构上的 6-dihydrouridin-5-yl 自由基 (1) 表明这种反应性可能有助于从羟基自由基反应中提取额外的 RNA 结构信息。改变 5'-相邻核苷酸的身份对链断裂几乎没有影响。核苷酸间链断裂通过 3'-磷酸的 β-消除发生，随后 C2'-氢原子被 1 提取。随后形成的烯烃阳离子自由基产生含有 3'-磷酸或 3'-脱氧-2'-酮核苷酸末端的 RNA

  DOI：

  10.1021/ja300044e
• 作为产物：
  描述：

  2’,3’邻异亚丙基尿苷 在 rhodium on alumina 甲烷磺酸 、 氢气 作用下， 以 甲醇 、 丙酮 为溶剂， 25.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 2.0h， 生成 2',3'-O-isopropylidene-5'-O-methoxymethyl-5,6-dihydrouridine
  参考文献：
  名称：

  5，6-二氢尿苷的锂化：5-取代尿苷的新途径

  摘要：

  发现在用LDA锂化时，2'，3'-O-异亚丙基-5'-O-甲氧基甲基-5,6-二氢尿苷（2）用作“酰胺α-阴离子”。阴离子与酰氯的反应，然后进行苯硒化和氧化消除，得到5-酰基尿嘧啶核苷。为了制备5-烷基尿苷，在2的C-5处初始引入苯基硒烯基似乎是有效的。其α-硒烯碳负离子的烷基化反应和随后生成的5,6-双键产生了5-烷基尿苷。这些途径构成了5-取代的尿苷的新入口。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)96481-6

文献信息

• A novel and regiospecific route to 5-acyluridines via an amide .ALPHA.-anion derived from 5,6-dihydrouridine.
  作者：Hiroyuki Hayakawa、Hiromichi Tanaka、Tadashi Miyasaka

  DOI：10.1248/cpb.30.4589

  日期：——

  Upon lithiation with LDA, 2', 3'-O-isopropylidene-5'-O-methoxymethyl-5, 6-dihydrouridine has been shown to serve as an "amide α-anion". Thus, acylation of the resulting dianion took place regiospecifically at the C-5 position. The subsequent phenylselenenylation and oxidative elimination afforded 5-acyluridines.

  在与LDA锂化后，2', 3'-O-异丙烯基-5'-O-甲氧基甲基-5, 6-二氢尿苷被证明可以作为“酰胺α-负离子”。因此，最终的双负离子在C-5位点发生了区域特异性酰化。随后的苯硒烯基化和氧化消除生成了5-酰基尿苷。