13-acetoxy-13-desmethylretinal 15,15-dimethyl acetal | 160193-82-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: 13-acetoxy-13-desmethylretinal 15,15-dimethyl acetal
• 英文别名: 13-Acetoxy-13-desmethylretinal dimethyl acetal
• CAS: 160193-82-8
• 化学式: C₂₃H₃₄O₄
• 分子量: 374.521
• InChiKey: MNHANYQJDPIFLS-ZFGHOIONSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.64
• 重原子数：
  27.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  44.76
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  13-acetoxy-13-desmethylretinal 15,15-dimethyl acetal 在 Bio-Rad AG 50W-X₁ 作用下， 以 丙酮 为溶剂， 生成 cis-1-Acetoxy-7-methyl-9-(2',6',6'-trimethyl-1-cyclohexen-1-yl)-1,4E,6E,8E-nonatetraen-3-one 、 all-trans-13-acetoxy-13-desmethylretinal 、 All-trans-13-Acetoxy-13-desmethylretinal
  参考文献：
  名称：

  13-Acetoxy-13-desmethylretinal：合成、掺入细菌视紫红质及其明显的灭活作用

  摘要：

  细菌视紫红质 (bR) 是紫色膜 (PM) 光驱动质子泵的蛋白质色素，是一条由 248 个氨基酸组成的多肽链。它穿过膜形成七个具有高α-螺旋特征的杆。PM 的颜色是由视黄醛的等效物在赖氨酸 216 处结合为质子化希夫碱 (PRSB) 及其与蛋白质的相互作用而产生的。光启动光循环，其中第一步是全反式-视黄醛光异构化为 13-顺式异构体。循环中的所有后续步骤都是热暗反应。我们在本文中报告了一种新型类似物 13-乙酰氧基-13-去甲基视黄醛的合成和并入细菌视紫红质中，旨在探索暗顺反异构化的机制。24 参考，1 图。

  DOI：

  10.1021/ja00099a087
• 作为产物：
  描述：

  4,4-二甲氧基-2-丁酮 在 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydride 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 13-acetoxy-13-desmethylretinal 15,15-dimethyl acetal
  参考文献：
  名称：

  13-Acetoxy-13-desmethylretinal：合成、掺入细菌视紫红质及其明显的灭活作用

  摘要：

  细菌视紫红质 (bR) 是紫色膜 (PM) 光驱动质子泵的蛋白质色素，是一条由 248 个氨基酸组成的多肽链。它穿过膜形成七个具有高α-螺旋特征的杆。PM 的颜色是由视黄醛的等效物在赖氨酸 216 处结合为质子化希夫碱 (PRSB) 及其与蛋白质的相互作用而产生的。光启动光循环，其中第一步是全反式-视黄醛光异构化为 13-顺式异构体。循环中的所有后续步骤都是热暗反应。我们在本文中报告了一种新型类似物 13-乙酰氧基-13-去甲基视黄醛的合成和并入细菌视紫红质中，旨在探索暗顺反异构化的机制。24 参考，1 图。

  DOI：

  10.1021/ja00099a087

文献信息

• Synthesis of 13-Acetoxy-13-demethylretinal, Its Pigment Formation with Bacteriopsin, and Apparent Dark-Inactivating Effect on the Pigment
  作者：Stanley Seltzer

  DOI：10.1021/jo00110a022

  日期：1995.3

  The title compound was designed to test for the involvement of nucleophilic catalysis, presumably by aspartate-212, in the dark cis-trans isomerizations of retinal in bacteriorhodopsin. beta-Ionylidenacetaldehyde was condensed with acetylacetaldehyde dimethyl acetal in the presence of NaH in THF forming 1,1-dimethoxy-7-methyl-9-(2',6',6'-trimethyl-1-cyclohexen-1-yl)-4E,6E,8E-nonatrien-3-one (4) in good yield. 4 treated with LDA in THF followed by Ac2O/DMAP yields 13-acetoxy-13-desmethylretinal dimethyl acetal (5). Careful, controlled hydrolysis of 5 in acetone, catalyzed by Bio-Rad AG 50W-X1, leads to 13-cis- and all-trans-13-acetoxy-13-desmethylretinal (1), and cis-1-acetoxy- 7-methyl-9-(2',6',6'-trimethyl-1-cyclohexen-1-yl)-1,4E,6E,8E-nonatetraen-3-one (6). Both 13-cis-1 and all-trans-1 are highly unstable in the presence of weakly acidic material such as silica gel. Both are converted to 6 in the presence of acid. AM1 calculations indicate that 6 is 4.8 kcal/mol more stable than all-trans-1. 13-cis-1 can be purified by HPLC on a cyano column and shown to form a pigment with bacterioopsin. The bacteriorhodopsin analogue, kept in the dark, slowly loses its absorption at 573 nm and in place develops absorption at 406 nm, signaling an alteration in the chromophore's binding to the protein as a protonated Schiff base (PSB). After a substantial drop in the 573 nm absorption, the retinal analogue can not be removed by the standard ethanol-delipidation method which would otherwise remove retinal, bound as a PSB, from native purple membrane or retinal oxime from photobleached purple membrane.