8-N-4-biphenyl-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyadenosine | 1062513-34-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 8-N-4-biphenyl-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: 8-N-4-aminobiphenyl-3’,5’-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2’-deoxyadenosine
• CAS: 1062513-34-1
• 化学式: C₃₄H₅₀N₆O₃Si₂
• 分子量: 646.98
• InChiKey: AJQQBKHUNJKABK-UPRLRBBYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.52
• 重原子数：
  45.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  109.34
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-N-4-biphenyl-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyadenosine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 67.0h， 生成 N⁶-dibenzoyl-8-N-(4-aminobiphenyl)-5’-O-dimethoxytrityl-2’-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  基因毒性 C8-Arylamino-2'-deoxyadenosines 作为潜在的烷基化剂诱导 DNA 链间交联

  摘要：

  DNA 链间交联 (ICL) 极其有害且结构多样，推动了 ICL 修复途径的发展。因此，发现 ICL 诱导剂对于 ICL 修复途径和范可尼贫血（一种由 ICL 修复基因突变引起的遗传病）的表征至关重要。尽管几项研究指出氧化应激是 ICL 的一个原因，但氧化应激诱导的交联事件的特征仍然很差。此外，多环芳香胺，一种强效环境致癌物，与 ICL 的产生有关，但它们的身份和序列尚不清楚。为了缩小这一知识差距，我们测试了 ICL 是否是由 8-arylamino-2'-deoxyadenosine (ArNHdA) 损伤（由芳氨基致癌物产生的加合物）氧化引起的。在此处，我们报告 ArNHdA 作为潜在的交联剂在氧化条件下产生 ICL。由 8-氨基腺嘌呤而非 8-氨基鸟嘌呤形成 ICL，突出了 8-氨基嘌呤介导的 ICL 产生的特异性。在活性氧 (ROS) 亚硝基过氧碳酸酯的影响下，ArNHdA (Ar

  DOI：

  10.1021/jacs.1c07234
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧腺苷 在 咪唑 、 tris-(dibenzylideneacetone)dipalladium(0) 、 bromoisocyanuric acid monosodium salt 、 caesium carbonate 、 R-(+)-1,1'-联萘-2,2'-双二苯膦 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 17.5h， 生成 8-N-4-biphenyl-3',5'-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  基因毒性 C8-Arylamino-2'-deoxyadenosines 作为潜在的烷基化剂诱导 DNA 链间交联

  摘要：

  DNA 链间交联 (ICL) 极其有害且结构多样，推动了 ICL 修复途径的发展。因此，发现 ICL 诱导剂对于 ICL 修复途径和范可尼贫血（一种由 ICL 修复基因突变引起的遗传病）的表征至关重要。尽管几项研究指出氧化应激是 ICL 的一个原因，但氧化应激诱导的交联事件的特征仍然很差。此外，多环芳香胺，一种强效环境致癌物，与 ICL 的产生有关，但它们的身份和序列尚不清楚。为了缩小这一知识差距，我们测试了 ICL 是否是由 8-arylamino-2'-deoxyadenosine (ArNHdA) 损伤（由芳氨基致癌物产生的加合物）氧化引起的。在此处，我们报告 ArNHdA 作为潜在的交联剂在氧化条件下产生 ICL。由 8-氨基腺嘌呤而非 8-氨基鸟嘌呤形成 ICL，突出了 8-氨基嘌呤介导的 ICL 产生的特异性。在活性氧 (ROS) 亚硝基过氧碳酸酯的影响下，ArNHdA (Ar

  DOI：

  10.1021/jacs.1c07234

文献信息

• Synthesis of C8-Modified 2″-Deoxyadenosine with Carcinogenic Arylamines
  作者：M. I. Jacobsen、C. Meier

  DOI：10.1080/15257770701527976

  日期：2007.11.26

  The synthesis of phosphoramidites of C8-modified 2'-deoxyadenosine with carcinogenic arylamines p-anisidine and 4-aminobiphenyl is described. Two different methods were studied related to the glycon and base protection groups.

  描述了C8-修饰的2'-脱氧腺苷与致癌性芳胺对-茴香胺和4-氨基联苯的亚磷酰胺的合成。研究了两种与糖基和碱基保护基有关的不同方法。
• Synthesis of C8-Arylamine-Modified 2′-Deoxyadenosine Phosphoramidites and their Site-Specific Incorporation into Oligonucleotides
  作者：Zita Szombati、Sabrina Baerns、Andreas Marx、Chris Meier

  DOI：10.1002/cbic.201100573

  日期：2012.3.19

  AbstractAdducts of C8‐(N‐acetyl)‐arylamines and 2′‐deoxyadenosine were synthesised by palladium‐catalysed CN cross‐coupling chemistry. These 2′‐dA adducts were converted into the corresponding 3′‐phosphoramidites and site‐specifically incorporated into DNA oligonucleotides, which were characterised by mass spectrometry, UV thermal‐stability assays and circular dichroism. These modified oligonucleotides were also used in EcoRI restriction assays and in primer‐extension studies with three different DNA polymerases. The incorporation of the 2′‐dA lesion close to the EcoRI restriction site dramatically reduced the susceptibility of the DNA strand to cleavage; this indicates a significant local distortion of the DNA double helix. The incorporation of the acetylated C8‐2′‐dA‐phosphoramidites into 20‐mer oligonucleotides failed, however, because the N‐acetyl group was lost during the deprotection process. Instead the corresponding C8‐NH‐2′‐dA‐modified oligonucleotides were obtained. The effect of the C8‐NH‐arylamine‐dA lesion on the replication by DNA polymerases was clearly dependent both on the polymerase used and on the arylamine‐dA damage.