新制癌菌素载色体 | 81604-85-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 新制癌菌素载色体
• 中文别名: 2-苯并噻唑羧酸,乙基酯,3-氧化
• 英文名称: neocarzinostatin chromophore
• 英文别名: neocarzinostatin；NCS；[(4S,6R,9E,11R,12R)-11-[(2R,3R,4R,5R,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyl-3-(methylamino)oxan-2-yl]oxy-4-[(4R)-2-oxo-1,3-dioxolan-4-yl]-5-oxatricyclo[8.3.0.04,6]trideca-1(13),9-dien-2,7-diyn-12-yl] 2-hydroxy-7-methoxy-5-methylnaphthalene-1-carboxylate
• CAS: 81604-85-5
• 化学式: C₃₅H₃₃NO₁₂
• 分子量: 659.647
• InChiKey: QZGIWPZCWHMVQL-UIYAJPBUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  175
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  新制癌菌素载色体 以 甲醇 、 溶剂黄146 为溶剂， 生成 2-hydroxy-7-methoxy-5-methylnaphthalene-1-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  关于新carcarinostatin发色团的光不稳定性的起源

  摘要：

  10元环类似物9的光化学分解的中心途径被证明是萘甲酸酯的碎裂反应，是Norrish II型分裂的类似物，导致不稳定的富烯衍生物10和2-羟基-7-甲氧基-5的形成。 -甲基-1-萘甲酸4，暗示新carzinostatin chrornophore 1的光分解机理。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)73852-4
• 作为产物：
  描述：

  2-羟基-7-甲氧基-5-甲基萘-1-羧酸甲酯 在 咪唑 、 2,6-二甲基吡啶 、 sodium hydroxide 、 双[Α,Α-双(三氟甲基)苯甲醇合]二苯硫 、 3 A molecular sieve 、 碘 、 对甲苯磺酸 、 氟化氢吡啶 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 19.98h， 生成 新制癌菌素载色体
  参考文献：
  名称：

  新制癌素发色团的对映选择性合成路线的开发及其在多种放射性同位素掺入中的应用

  摘要：

  描述了天然产物新制癌素发色团 (1) 的收敛、对映选择性合成路线。最初的目标是合成发色团苷元 (2)。先前为合成新制癌素核心模型 (4) 开发的化学方法在使用更高氧化的底物 27 和 54 用于制备 2 时，在烯丙基甲硅烷基醚的必要 1,3-转位中失败。 替代合成因此，基于环氧醇 58 还原形成苷元 2 的提议制定了计划，这是一种以新颖方式实现的转化，使用试剂三苯基膦、碘和咪唑的组合。1 和 2 的成功路线始于环氧二炔 15 的会聚偶联，由 D-甘油醛缩​​醛分 9 步获得（43% 总产率），环戊烯酮（+）-14 一步（75-85% 产率）由前列腺素中间体 (+)-16 制备，得到醇 22 80% 的产率和 > 或 = 20:1 的非对映选择性。然后将醇22分17步转化为环氧醇58，平均产率为92%，总产率为22%。该序列的主要特征包括烯丙醇 81 的非对映选择性 Sharpless 不对称环氧化（产率

  DOI：

  10.1021/ja012487x

文献信息

• DNA Cleavage by Neocarzinostatin Chromophore.Establishing the Intermediacy of Chromophore-Derived Cumulene and Biradical Species and Their Role in Sequence-Specific Cleavage
  作者：Andrew G. Myers、Scott B. Cohen、Byoung-Mog Kwon

  DOI：10.1021/ja00084a007

  日期：1994.3

  thecumulene intermediate. The experimental evidence suggests that the cumulene intermediate undergoes cycloaromatization while bound to DNA and that the biradical formed in this cycloaromatization reaction is a highly reactive and poorly selective intermediate. The yield-determining step in the production of thiol adducts from 1 is found to be the quenching of the biradical intermediate by hydrogen

  描述了在新制癌素发色团 (1) 和巯基乙酸甲酯 (2) 切割双链 DNA 中建立 cumulene 3 和双基 4 中间体的实验。结果表明，在毫摩尔浓度为 2 的情况下，≥95% 的 DNA 裂解是通过 cumulene 3 产生的；不涉及 3 的 DNA 切割途径充其量只是次要的。DNA裂解反应的详细机制如下。在生理相关浓度和 pH 值下，新制癌素发色团和硫醇谷胱甘肽 (GSH)、半胱氨酸 (CySH) 或巯基乙酸甲酯对 DNA 损伤的决定速率步骤是向发色团添加硫醇。有证据支持将硫醇加到 1 上的观点，无论 1 在溶液中是游离的还是与 DNA 结合，是一个本质上有效的过程。显示 GSH 或 CySH 的添加是通过 DNA、硫醇和生色团的三元复合物进行的。在这两种情况下，DNA 都不会加速（催化）硫醇加成反应；相反，发现与缺乏 DNA 的对照溶液相比，它会导致硫醇添加速率的适度降低。与溶液中游离的发色团相比，DNA
• Recognition of Bulged DNA by a Neocarzinostatin Product via an Induced Fit Mechanism
  作者：Catherine F. Yang、Patricia J. Jackson、Zhen Xi、Irving H. Goldberg

  DOI：10.1016/s0968-0896(01)00432-1

  日期：2002.5

  The binding of the wedge-shaped isostructural analogue of the biradical species of the chromphore of antitumor antibiotic neocarzinostatin to sequence-specific bulged DNAs results in alterations in ellipticity of the DNAs. Circular dichroism (CD) spectroscopic results suggest that the drug specifically recognizes bulges of DNA via a combination of conformational selection and induced fit, not by binding

  抗肿瘤抗生素新carcarinostatin的荧光团的双自由基种类的楔形同构类似物与序列特异性凸起的DNA的结合导致DNA椭圆度的改变。圆二色性（CD）光谱结果表明，该药物通过构象选择和诱导拟合的组合而不是通过结合预先组织的位点来特异性识别DNA凸起。圆二色性光谱的分析表明，观察到的感应配合程度主要是优化范德华与凸腔壁接触的结果。有效识别双链体DNA上的凸起位点很大程度上取决于弯曲的凹槽空间是否足够柔韧性，以使其能够采用与楔形药物分子兼容的几何最佳构象，而不是涉及“锁和钥匙”的认可。光谱结果表明DNA构象的变化，与变构结合模型一致。用各种凸起的DNA进行的光谱研究还表明，结合强度与凸起结构的稳定性直接相关。
• Stereochemical assignment of neocarzinostatin chromophore. Structures of neocarzinostatin chromophore-methyl thioglycolate adducts
  作者：Andrew G. Myers、Philip J. Proteau、Tracy M. Handel

  DOI：10.1021/ja00229a045

  日期：1988.10
• Activation of neocarzinostatin-chromophore by 4-hydroxythiophenol: Intramolecular radical trapping of biradical intermediate
  作者：Hiroshi Sugiyama、Tsuyoshi Fujiwara、Isao Saito

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)78508-x

  日期：1994.11

  The reaction of neocarzinostatin chromphore (1) with 4-hydroxythiophenol under DNA-cleaving conditions was investigated. It was found that a novel cyclization product (5) is formed as a major product together with a minor amount of normal cyclization product 4b. Tritium was incorporated into 4b and 5 from [H-3]-labeled poly(dA-dT), implying that both processes giving 4b and 5 are actually involved in the DNA cleavage reaction.
• Evidence for aminoglycoside participation in thiol activation of neocarzinostatin chromophore. Synthesis and reactivity of the epoxy dienediyne core
  作者：Andrew G. Myers、Philip M. Harrington、Byoung Mog Kwon

  DOI：10.1021/ja00029a046

  日期：1992.1