(11aS,11a'S)-8,8'-(pentane-1,5-diylbis(oxy))bis(7-methoxy-2-methylene-2,3-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one) | 260417-62-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯二氮卓类
• 英文名称: (11aS,11a'S)-8,8'-(pentane-1,5-diylbis(oxy))bis(7-methoxy-2-methylene-2,3-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one)
• 英文别名: (11aS,11a’S)-8,8’-(pentane-1,5-diylbis(oxy))bis(7-methoxy-2-methylene-2,3 -dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one)；Unii-V23HY4W8OB；(6aS)-3-[5-[[(6aS)-2-methoxy-8-methylidene-11-oxo-7,9-dihydro-6aH-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-3-yl]oxy]pentoxy]-2-methoxy-8-methylidene-7,9-dihydro-6aH-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-11-one
• CAS: 260417-62-7
• 化学式: C₃₃H₃₆N₄O₆
• 分子量: 584.672
• InChiKey: KYNCKSRRIFFPJS-GOTSBHOMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

制备方法与用途

SG2057(DRG16)是一种PBD二聚体，含有一个戊基二氧基连接，该连接能够选择性地结合并形成DNA链间和链内交联加合物的DNA小凹槽中的序列。SG2057是一种高活性的抗肿瘤剂。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (11aS,11a'S)-8,8'-(pentane-1,5-diylbis(oxy))bis(7-methoxy-2-methylene-2,3-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one) 在 sodium tetrahydroborate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 二乙二醇二甲醚 为溶剂， 反应 3.08h， 生成 (S)-8-((5-(((S)-10-(3-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)propanoyl)-7-methoxy-2-methylene-5-oxo-2,3,5,10,11,11a-hexahydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)pentyl)oxy)-7-methoxy-2-methylene-2,3-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one
  参考文献：
  名称：

  新規な連結体及び生体分子と薬物との特異的共役におけるその使用

  摘要：

  在这个文本中，描述了一种用于制造连接体和制造均一的共轭体的方法，以及在癌症、感染症和自身免疫性疾病治疗中应用共轭体的方法。通过特异性地交联连接到细胞结合分子上的巯基对，使得每个连接体能够与两个或两个以上的化合物/细胞毒性剂共轭，其中连接体包含2,3-二取代琥珀酸基或2-单取代或2,3-二取代富马酸基或马来酸基（反式（E）-或顺式（Z）-丁烯二酸）基。这些连接体可以用以下通用式来表示。【选择图】无

  公开号：

  JP2021073185A
• 作为产物：
  描述：

  1,5-戊二醇 在 镍 四氢吡咯 、 吡啶 、 sodium hydroxide 、 四(三苯基膦)钯 、 草酰氯 、 potassium tert-butylate 、 四丁基氟化铵 、 乙酸酐 、 copper(II) nitrate 、 一水合肼 、 二甲基亚砜 、 三乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 89.0h， 生成 (11aS,11a'S)-8,8'-(pentane-1,5-diylbis(oxy))bis(7-methoxy-2-methylene-2,3-dihydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-5(11aH)-one)
  参考文献：
  名称：

  Linker Length Modulates DNA Cross-Linking Reactivity and Cytotoxic Potency of C8/C8‘ Ether-Linked C2-exo-Unsaturated Pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine (PBD) Dimers

  摘要：

  A C2/C2'-exo-unsaturated pyrrolo [2, 1-c] [1,4]benzodiazepine (PBD) dimer 4b (DRG-16) with a C8-O(CH2)(n)O-C8' diether linkage (n = 5) has been synthesized that shows markedly superior in vitro cytotoxic potency (e.g., > 3400-fold in IGROV1 ovarian cells) and interstrand DNA cross-linking reactivity (> 10-fold) compared to the shorter homologue 4a (SJG-136; n = 3). In contrast, for the C-ring unsubstituted series, the corresponding n = 5 dimer (3c) is generally less cytotoxic and has a lower interstrand cross-linking reactivity compared to its shorter n = 3 homologue (3a). Dimer 4b cross-links DNA with > 10-fold efficiency compared to 4a, and also inhibits the activity of the restriction endonuclease BamH1 more efficiently than either 3a or 4a. The C2-exo-unsaturated PBD dimers 4a,b are not only more effective than their C-ring saturated counterparts in terms of induced DeltaT(m) shift, but they also exert this effect more rapidly. Thus, while 3a and 3c exert 68 and 35% of their maximum effect immediately upon interaction with DNA, this level increases to 76 and 97% for 4a and 4b, respectively. Molecular modeling shows a rank order of 4b (n = 5) > 4a (n = 3) > 3a (n = 3) > 3c (n = 5) in terms of binding energy toward duplexes containing embedded target 5'-GAT(1-2)C cross-link sequences, reflecting the superior fit of the C2-exo-unsaturated rather than saturated C-rings of the PBD dimers. A novel synthesis of core synthetic building blocks for PBD dimers via stepwise Mitsunobu reaction and nitration with Cu(NO3)(2) is also reported.

  DOI：

  10.1021/jm030897l

文献信息

• [EN] CROSS-LINKED PYRROLOBENZODIAZEPINE DIMER (PBD) DERIVATIVE AND ITS CONJUGATES<br/>[FR] DÉRIVÉ DE DIMÈRE DE PYRROLOBENZODIAZÉPINE RÉTICULÉ (PBD) ET SES CONJUGUÉS
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2020006722A1

  公开（公告）日：2020-01-09

  A novel cross-linked cytotoxic agents, pyrrolobenzo-diazepine dimer (PBD) derivatives, and their conjugates to a cell-binding molecule, a method for preparation of the conjugates and the therapeutic use of the conjugates.

  一种新型的交联细胞毒剂，吡咯苯并二氮杂环二聚体（PBD）衍生物，以及它们与细胞结合分子的结合物，一种制备这些结合物的方法以及这些结合物的治疗用途。
• [EN] CONJUGATION LINKERS CONTAINING 2,3-DIAMINOSUCCINYL GROUP<br/>[FR] LIEURS DE CONJUGAISON CONTENANT UN GROUPE 2,3-DIAMINOSUCCINYLE
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2020073345A1

  公开（公告）日：2020-04-16

  Provided is a conjugate of a cytotoxic drug/molecule to a cell-binding molecule with a bis-linker (adual-linker) containing a 2, 3-diaminosuccinyl group. It also relates to preparation of the conjugate of a cytotoxic drug/molecule to a cell-binding molecule with the bis-linker, particularly when the drug having functional groups of amino, hydroxyl, diamino, amino-hydroxyl, dihydroxyl, carboxyl, hydrazine, aldehyde and thiol for conjugation with the bis-linker in a specific manner, as well as the therapeutic use of the conjugates.

  提供的是将细胞毒性药物/分子与含有双联接剂（双联接剂）的细胞结合分子结合的共轭物。它还涉及将细胞毒性药物/分子与双联接剂的细胞结合分子结合的制备，特别是当药物具有氨基，羟基，二氨基，氨基-羟基，二羟基，羧基，双肼，醛基和硫醇等功能基团以特定方式与双联接剂结合时，以及这些共轭物的治疗用途。
• [EN] CONJUGATION LINKERS, CELL BINDING MOLECULE-DRUG CONJUGATES CONTAINING THE LIKERS, METHODS OF MAKING AND USES SUCH CONJUGATES WITH THE LINKERS<br/>[FR] LIEURS DE CONJUGAISON, CONJUGUÉS MÉDICAMENT-MOLÉCULE DE LIAISON À UNE CELLULE CONTENANT LESDITS LIEURS, PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ET D'UTILISATION DE TELS CONJUGUÉS AVEC LES LIEURS
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2018086139A1

  公开（公告）日：2018-05-17

  The present invention relates to linkers having a group of propiolyl, substituted acryl (acryloyl), or disubstituted propanoyl, and using such linkers for the conjugation of compounds, in particular, cytotoxic agents to a cell-binding molecule.

  本发明涉及具有丙炔基、取代丙烯酰（丙烯酰）或二取代丙酰基的连接剂，并使用这些连接剂将化合物，特别是细胞毒性药剂，与细胞结合分子结合。
• [EN] PYRROLOBENZODIAZEPINE PRODRUGS AND ANTIBODY CONJUGATES THEREOF<br/>[FR] PROMÉDICAMENTS DE PYRROLOBENZODIAZÉPINE ET CONJUGUÉS D'ANTICORPS DE CEUX-CI
  申请人：GENENTECH INC

  公开号：WO2018031662A1

  公开（公告）日：2018-02-15

  The invention relates generally to pyrrolobenzodiazepine monomer and dimer prodrugs having a glutathione-activated disulfide prodrug moiety, a DT-diaphorase-activated quinone prodrug moiety or a reactive oxygen species-activated aryl boronic acid or aryl boronic ester prodrug moiety. The invention further relates to pyrrolobenzodiazepine prodrug dimer-antibody conjugates.

  这项发明涉及具有谷胱甘肽活化二硫键前药基团、DT-二氢呋喃酮酶活化醌前药基团或活化氧化物种的芳基硼酸或芳基硼酯前药基团的吡咯苯并二氮杂环烷单体和二聚体前药。该发明还涉及吡咯苯并二氮杂环烷前药二聚体-抗体共轭物。
• [EN] HINDERED DISULFIDE DRUG CONJUGATES<br/>[FR] CONJUGUÉS MÉDICAMENTEUX À PONT DISULFURE ENCOMBRÉ
  申请人：GENENTECH INC

  公开号：WO2017064675A1

  公开（公告）日：2017-04-20

  The invention relates generally to disulfide drug conjugates wherein a linker comprising a sulfur-bearing carbon atom substituted with at least one hydrocarbyl or substituted hydrocarbyl is conjugated by a disulfide bond to a cysteine sulfur atom of a targeting carrier, and wherein the linker is further conjugated to a drug moiety. The invention further relates to activated linker-drug conjugates suitable for conjugation to a targeting carrier by a disulfide bond. The invention further relates to methods for preparing hindered disulfide drug conjugates.

  该发明一般涉及二硫键药物偶联物，其中含有至少一个被至少一个碳氢化合物或取代碳氢化合物所取代的含硫碳原子的连接剂通过二硫键与靶向载体的半胱氨酸硫原子偶联，并且连接剂进一步与药物部分偶联。该发明进一步涉及适合通过二硫键与靶向载体偶联的活化连接剂-药物偶联物。该发明还进一步涉及制备受阻二硫键药物偶联物的方法。