1,3,6',3''-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-6''-amino-6''-deoxy-kanamycin A | 1203669-89-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1,3,6',3''-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-6''-amino-6''-deoxy-kanamycin A
• CAS: 1203669-89-9
• 化学式: C₃₈H₆₉N₅O₁₈
• 分子量: 883.989
• InChiKey: XOLUZAXNIUTAEZ-SVNVMMNPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.06
• 重原子数：
  61.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  337.64
• 氢给体数：
  11.0
• 氢受体数：
  19.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,3,6',3''-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-6''-amino-6''-deoxy-kanamycin A 在 oxone 、 N-羟基丁二酰亚胺 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 33.0h， 生成 6''-(2-(decylsulfonyl)acetamide)1,3,6',3''-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)kanamycin
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and antibacterial activity of 6″-decanesulfonylacetamide-functionalised amphiphilic derivatives of amikacin and kanamycin

  摘要：

  氨基糖苷类抗生素是治疗结核病的第一类成功药物；然而，分枝杆菌和其他细菌物种拥有多种抗药性机制，可使这些天然产物失活。在过去的 15 年中，多种两性氨基糖苷类药物被证明对传染性微生物具有更强的活性，并能颠覆耐药机制。在此，我们报告了从现有的两种强效抗结核化合物中衍生出的四种新型合成化合物，并描述了它们对结核分枝杆菌和金黄色葡萄球菌的活性。研究发现，一种基于癸烷磺酰乙酰胺的阿米卡星共轭物显示出良好的初步抗结核活性，值得进一步研究以评估这些独特抗菌素的治疗潜力。

  DOI：

  10.1071/ch23154
• 作为产物：
  描述：

  1,3,6',3''-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-6''-azido-6''-deoxy-kanamycin A 在 palladium hydroxide, 20 wt% on carbon 、 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以71 %的产率得到1,3,6',3''-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-6''-amino-6''-deoxy-kanamycin A
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and antibacterial activity of 6″-decanesulfonylacetamide-functionalised amphiphilic derivatives of amikacin and kanamycin

  摘要：

  氨基糖苷类抗生素是治疗结核病的第一类成功药物；然而，分枝杆菌和其他细菌物种拥有多种抗药性机制，可使这些天然产物失活。在过去的 15 年中，多种两性氨基糖苷类药物被证明对传染性微生物具有更强的活性，并能颠覆耐药机制。在此，我们报告了从现有的两种强效抗结核化合物中衍生出的四种新型合成化合物，并描述了它们对结核分枝杆菌和金黄色葡萄球菌的活性。研究发现，一种基于癸烷磺酰乙酰胺的阿米卡星共轭物显示出良好的初步抗结核活性，值得进一步研究以评估这些独特抗菌素的治疗潜力。

  DOI：

  10.1071/ch23154

文献信息

• Scalable and cost-effective tosylation-mediated synthesis of antifungal and fungal diagnostic 6″-Modified amphiphilic kanamycins
  作者：Yagya Prasad Subedi、Uddav Pandey、Madher N. Alfindee、Heath Montgomery、Paul Roberts、Jeffrey Wight、Gavin Nichols、Michell Grilley、Jon Y. Takemoto、Cheng-Wei Tom Chang

  DOI：10.1016/j.ejmech.2019.111639

  日期：2019.11

  Amphiphilic kanamycins bearing hydrophobic modifications at the 6″ position have attracted interest due to remarkable antibacterial-to-antifungal switches in bioactivity. In this report, we investigate a hurdle that hinders practical applications of these amphiphilic kanamycins: a cost-effective synthesis that allows the incorporation of various connecting functionalities to which the hydrophobic moieties

  由于在生物活性方面的显着的抗菌-抗真菌转换，在6“位置带有疏水修饰的两亲卡那霉素引起了人们的兴趣。在本报告中，我们调查了阻碍这些两亲性卡那霉素实际应用的障碍：一种经济高效的合成方法，该方法可将疏水性部分连接至卡那霉素核心的各种连接功能结合到一起。具有成本效益的甲苯磺酸酯化可在6英寸位置进行多种修饰，可扩展至90克规模。连接功能，例如胺和硫醇，不是生物活性的主要因素。相反，线性链长起决定性作用。与短链（C6-C10）相比，与十四烷基（C14）或十六烷基（C16）连接的两亲卡那霉素显示出较强的抗真菌和适度的抗菌活性。但是，链长的增加与HeLa细胞毒性的增加密切相关。因此，为了两亲卡那霉素的最佳功效，抗微生物活性和细胞毒性之间的折衷可能包含C8和C12之间的链长。最后，所描述的合成方案还允许制备对真菌具有选择性的荧光两亲卡那霉素。对于两亲性卡那霉素的最佳疗效，其链长可能介于C8和C12之间。最后
• Antibiotic selectivity for prokaryotic vs. eukaryotic decoding sites
  作者：Yun Xie、Andrew V. Dix、Yitzhak Tor

  DOI：10.1039/c0cc00423e

  日期：——

  A FRET assembly reports antibiotic affinities to two different RNA targets. A binder was labeled with a fluorophore that acts both as an acceptor for the emissive nucleoside on the bacterial A-site and a donor fluorophore for the terminally-labeled human A-site. Unlabeled drugs were used to dissociate the labeled antibiotic.

  FRET 组合报告了抗生素对两种不同 RNA 靶点的亲和力。一种粘合剂被荧光团标记，这种荧光团既是细菌 A 位点上发射性核苷的受体，也是末端标记的人类 A 位点的供体荧光团。未标记的药物用于离解标记的抗生素。
• Rapid solid-phase syntheses of a peptidic-aminoglycoside library
  作者：Casey Kukielski、Krishnagopal Maiti、Sayantan Bhaduri、Sandra Story、Dev P. Arya

  DOI：10.1016/j.tet.2018.07.012

  日期：2018.8

  kanamycin and neomycin as the model aminoglycosides, was systematically and rapidly synthesized via solid phase peptide synthesis. Aminoglycosides were first converted into N-Boc protected carboxylic acids and fifteen l-amino acids were then used in the diversification of the full library. The approach outlined describes a rapid synthetic procedure where >200 PA compounds can be synthesized in a few months

  通过卡那霉素和新霉素作为模型氨基糖苷，通过固相肽合成系统地快速合成了单氨基酸和二氨基酸肽基氨基糖苷（PAs）文库。氨基糖苷类首先转化成Ñ -Boc保护的羧酸十五升然后，将α-氨基酸用于整个文库的多样化。概述的方法描述了一种快速合成方法，其中可以在几个月内合成纯度超过85-95％的200多种PA化合物。紫外线热变性评估了PA对模型人和细菌A位rRNA序列的结合稳定性。在PA之间的热熔解曲线中发现了显着差异，这归因于特定的氨基酸序列。新霉素功率放大器导致A位rRNA序列的稳定化大得多的变化（ΔT米 相比，卡那霉素的PA = 2.6-17.1℃）（=的ΔTm0.4-4.3℃）。卡那霉素PA对革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌几乎没有活性，而新霉素PA具有显着的抗菌活性，MIC为2至16μM。
• GUANIDINYLATED AMINOGLYCOSIDE-LIPID CONJUGATES
  申请人：Schweizer Frank

  公开号：US20130053337A1

  公开（公告）日：2013-02-28

  Guanadinylated aminoglycoside-lipid conjugates are prepared. Such conjugates may comprise an aminoglycoside such as an aminoglyucoside antibiotic like neomycin or kanamycin, at least one guanidino group attached to a primary or secondary carbon atom of the aminoglyucoside group and at least one lipid group attached through a bond or a linker to a branched carbon atom of the aminoglycoside. These conjugates exhibit improve antibacterial activity and may be used in conjunction with another antibiotic.

  制备了鸟氨酸基氨基糖苷-脂质共轭物。这些共轭物可以包括氨基糖苷，例如新霉素或卡那霉素等氨基糖苷类抗生素，至少一个鸟氨酸基团连接到氨基糖苷基团的一次或二次碳原子上，并且至少一个脂质基团通过键或连接物连接到氨基糖苷的支链碳原子上。这些共轭物表现出改善的抗菌活性，可以与另一种抗生素一起使用。