tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-kanamycin A | 80860-34-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-kanamycin A
• 英文别名: 1,3,6',3''-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)kanamycin A；tert-butyl N-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,5-dihydroxy-2-[(1S,2R,3R,4S,6R)-2-hydroxy-4,6-bis[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-[(2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-[[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methyl]oxan-2-yl]oxycyclohexyl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]carbamate
• CAS: 80860-34-0
• 化学式: C₃₈H₆₈N₄O₁₉
• 分子量: 884.973
• InChiKey: DZVFYGHQJNALHV-SVNVMMNPSA-N

物化性质

• 沸点：
  1006.9±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.36±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  61
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  332
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-kanamycin A 在 吡啶 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 102.25h， 生成 6”-(1-tetradecylamino)-6''-deoxykanamycin A
  参考文献：
  名称：

  可扩展且具有成本效益的甲苯磺酸介导的抗真菌和真菌诊断性6英寸修饰两亲卡那霉素合成。

  摘要：

  由于在生物活性方面的显着的抗菌-抗真菌转换，在6“位置带有疏水修饰的两亲卡那霉素引起了人们的兴趣。在本报告中，我们调查了阻碍这些两亲性卡那霉素实际应用的障碍：一种经济高效的合成方法，该方法可将疏水性部分连接至卡那霉素核心的各种连接功能结合到一起。具有成本效益的甲苯磺酸酯化可在6英寸位置进行多种修饰，可扩展至90克规模。连接功能，例如胺和硫醇，不是生物活性的主要因素。相反，线性链长起决定性作用。与短链（C6-C10）相比，与十四烷基（C14）或十六烷基（C16）连接的两亲卡那霉素显示出较强的抗真菌和适度的抗菌活性。但是，链长的增加与HeLa细胞毒性的增加密切相关。因此，为了两亲卡那霉素的最佳功效，抗微生物活性和细胞毒性之间的折衷可能包含C8和C12之间的链长。最后，所描述的合成方案还允许制备对真菌具有选择性的荧光两亲卡那霉素。对于两亲性卡那霉素的最佳疗效，其链长可能介于C8和C12之间。最后

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.111639
• 作为产物：
  描述：

  卡那霉素二硫酸盐 在 Amberlite IRA-400-OH 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)-kanamycin A
  参考文献：
  名称：

  [EN] COMPOUNDS AND METHODS OF TREATING RNA-MEDIATED DISEASES
  [FR] COMPOSÉS ET MÉTHODES DE TRAITEMENT DE MALADIES MÉDIÉES PAR L'ARN

  摘要：

  公开号：

  WO2017136450A3

文献信息

• Synthesis of new biocarrier–nucleotide systems for cellular delivery in bacterial auxotrophic strains
  作者：Swarup De、Elisabetta Groaz、Mohitosh Maiti、Valérie Pezo、Philippe Marlière、Piet Herdewijn

  DOI：10.1016/j.tet.2014.09.096

  日期：2014.11

  approach for thymidine monophosphate (TMP) in bacterial cells, we have synthesized a series of conjugates of TMP with biotin having an oxymethyleneoxy ester, a carboxy ester, and different carboxamide linkers between the carboxyl group of biotin and the 3′-OH group of TMP. The synthetic strategy starts from 5′-O-(dibenzylphosphate)-thymidine having the linkers already connected at the 3′-position. Likewise

  为寻找细菌细胞中胸苷单磷酸（TMP）的递送方法，我们合成了一系列TMP与生物素结合物，该结合物在生物素的羧基和3'之间具有羟甲基氧酸酯，羧基酯和不同的羧酰胺连接基。 TMP的-OH基。合成策略从具有在3'-位已经连接的接头的5'- O-（磷酸二苄基酯）-胸苷开始。同样，卡那霉素A使用氨基甲酰基或硫代乙基氨基甲酰基在TMP的3'-位连接。这些缀合物均不能维持ΔthyA，ΔphoA大肠杆菌菌株的生长。
• Antibacterial Activities of Aminoglycoside Antibiotics-Derived Cationic Amphiphiles. Polyol-Modified Neomycin B-, Kanamycin A-, Amikacin-, and Neamine-Based Amphiphiles with Potent Broad Spectrum Antibacterial Activity
  作者：Smritilekha Bera、George G. Zhanel、Frank Schweizer

  DOI：10.1021/jm1000437

  日期：2010.5.13

  aminoglycosides neomycin B, kanamycin A, amikacin, and neamine has been uniformly decorated with hydrophobic residues in the form of polycarbamates and polyethers. Our results show that the nature of the polyol modification as well as the nature of the aminoglycoside antibiotics has a strong effect on the antibacterial potency. The most potent antibacterials are polyol-modified neomycin B-based amphiphiles

  包含多个带正电荷的氨基官能团的阳离子两亲物定义了具有广谱活性和不同作用方式的一类结构多样的抗菌剂。寡阳离子两亲物已被用作治疗感染的抗生素以及用作抗菌剂和消毒剂达数十年之久，很少或根本没有产生抗药性。我们制备了一类称为氨基糖苷类抗生素的两亲性阳离子两亲物，其中氨基糖苷类新霉素B，卡那霉素A，阿米卡星和神经胺的多元醇骨架被聚氨基甲酸酯和聚醚形式的疏水残基均匀修饰。我们的结果表明，多元醇修饰的性质以及氨基糖苷类抗生素的性质对抗菌效力具有很强的影响。最有效的抗菌剂是含有未取代的芳香环的多元醇改性的新霉素B型两亲物。与新霉素B相比，这些类似物对耐药菌株的抗菌活性提高了256倍，同时保留了对新霉素B敏感菌株的大部分活性。
• Enhanced RNA binding of dimerized aminoglycosides
  作者：Katja Michael、Hai Wang、Yitzhak Tor

  DOI：10.1016/s0968-0896(99)00071-1

  日期：1999.7

  symmetrical and nonsymmetrical dimeric aminoglycosides. These unnatural derivatives were compared to their natural "monomeric" counterparts in their ability to inhibit the Tetrahymena ribozyme. The dimeric aminoglycosides inhibit ribozyme function 20 to 1.2 x 10(3) fold more effectively than their natural parent compounds. The inhibition curves of dimeric aminoglycosides have characteristic shapes suggesting

  氨基糖苷类抗生素最近已成为一个有趣的RNA结合分子家族，它们已成为设计新型RNA配体的主要结构。氨基糖苷-RNA识别现象的去神秘化是开发高级结合剂所必需的。为了探索大RNA分子中多个结合位点的存在，我们合成了共价连接的对称和非对称二聚氨基糖苷。将这些非天然衍生物与它们的天然“单体”对应物在抑制四膜虫核酶方面的能力进行了比较。二聚氨基糖苷比其天然母体化合物更有效地抑制核酶功能20到1.2 x 10（3）倍。二聚氨基糖苷的抑制曲线具有特征性形状，表明在核酶的三维折叠中存在至少两个高亲和力结合位点。提出了二聚氨基糖苷与RNA分子的两个互补位点的相互作用。这种结合基序可能对靶向细菌和病毒病原体的关键RNA分子的新药物的开发有影响。
• Deoxygenation of amino-glycoside antibiotics via anhydro intermediates. II. Improved syntheses of 3',4'-dideoxykanamycin A and 4'-deoxykanamycin A.
  作者：TOSHIO YONETA、TOMIO MATSUNO、SHUNZO FUKATSU

  DOI：10.1248/cpb.29.3464

  日期：——

  A new deoxygenation of kanamycin A leading to 3', 4'-dideoxykanamycin A and 4'-deoxykanamycin A is described. The key stage in the syntheses involves the formation of the 3', 4'-anhydro-4'-epi derivative (5) followed by its conversion to the 3'Δ and 4'-deoxy derivative through the iodohydrin. Compound 5 was prepared by the treatment of 2', 3', 2"-tri-O-benzoyl-4", 6"-O-cyclohexylidene-4'-O-methylsulfonyl-tetra-N-tert-butyloxycar-bonylkanamycin A (4) with sodium methoxide.

  描述了一种新的去氧化方法，将卡那霉素A转化为3', 4'-二去氧卡那霉素A和4'-去氧卡那霉素A。合成中的关键阶段涉及3', 4'-氨基-4'-表衍生物（5）的形成，随后通过碘氢醇将其转化为3'Δ和4'-去氧衍生物。化合物5是通过将2', 3', 2"-三-O-苯甲酰-4", 6"-O-环己基亚烯基-4'-O-甲基磺酰基四-N-叔丁氧羰基卡那霉素A（4）与氢氧化钠甲醇反应制备的。
• Rapid solid-phase syntheses of a peptidic-aminoglycoside library
  作者：Casey Kukielski、Krishnagopal Maiti、Sayantan Bhaduri、Sandra Story、Dev P. Arya

  DOI：10.1016/j.tet.2018.07.012

  日期：2018.8

  kanamycin and neomycin as the model aminoglycosides, was systematically and rapidly synthesized via solid phase peptide synthesis. Aminoglycosides were first converted into N-Boc protected carboxylic acids and fifteen l-amino acids were then used in the diversification of the full library. The approach outlined describes a rapid synthetic procedure where >200 PA compounds can be synthesized in a few months

  通过卡那霉素和新霉素作为模型氨基糖苷，通过固相肽合成系统地快速合成了单氨基酸和二氨基酸肽基氨基糖苷（PAs）文库。氨基糖苷类首先转化成Ñ -Boc保护的羧酸十五升然后，将α-氨基酸用于整个文库的多样化。概述的方法描述了一种快速合成方法，其中可以在几个月内合成纯度超过85-95％的200多种PA化合物。紫外线热变性评估了PA对模型人和细菌A位rRNA序列的结合稳定性。在PA之间的热熔解曲线中发现了显着差异，这归因于特定的氨基酸序列。新霉素功率放大器导致A位rRNA序列的稳定化大得多的变化（ΔT米 相比，卡那霉素的PA = 2.6-17.1℃）（=的ΔTm0.4-4.3℃）。卡那霉素PA对革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌几乎没有活性，而新霉素PA具有显着的抗菌活性，MIC为2至16μM。