O-TIBS-N-Boc kanamycin A | 953395-49-8

• 分子结构分类: 有机化合物
• 英文名称: O-TIBS-N-Boc kanamycin A
• 英文别名: 6''-(2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl)-1,3,6',3''-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)kanamycin A；6”-(2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl)-1,3,6’,3”-tetra-N-(tert-butoxycarbonyl)kanamycin A
• CAS: 953395-49-8
• 化学式: C₅₃H₉₀N₄O₂₁S
• 分子量: 1151.38
• InChiKey: NNDHIWYOMQWTNS-ABJRKYAHSA-N

物化性质

• 沸点：
  1106.7±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.31±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.76
• 重原子数：
  79.0
• 可旋转键数：
  16.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  354.99
• 氢给体数：
  10.0
• 氢受体数：
  21.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O-TIBS-N-Boc kanamycin A 在 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium iodide 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 6''-(pyridin-1-ium)-6''-deoxykanamycin A trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  6″-修饰的卡那霉素A衍生物的合成及其抗菌性能评价

  摘要：

  氨基糖甙类抗生素是最早应用于临床的一类抗生素，至今仍在使用。它们具有广泛的抗菌活性，使它们能够有效对抗许多不同类型的细菌。尽管它们的使用历史悠久，但氨基糖苷类仍然被认为是开发新型抗菌剂的有前途的支架，特别是当细菌继续对现有抗生素产生耐药性时。我们合成了一系列具有额外可质子化基团（氨基、胍基或吡啶鎓）的 6″-脱氧卡那霉素 A 类似物，并测试了它们的生物活性。我们首次证明了 tetra-N-protected-6″-O-(2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl)kanamycin A 与弱亲核试剂吡啶相互作用的能力，导致形成相应的吡啶鎓衍生物。在卡那霉素 A 的 6”位引入小的二氨基取代基并没有显着改变母体抗生素的抗菌活性，但通过酰化进一步修饰导致抗菌活性完全丧失。然而，引入胍残基导致化合物对金黄色葡萄球菌的活性有所提高。此外，与母体卡那霉素 A 相比，大多数获得的

  DOI：

  10.3390/pharmaceutics15041177
• 作为产物：
  描述：

  卡那霉素碱 在 吡啶 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 O-TIBS-N-Boc kanamycin A
  参考文献：
  名称：

  用于细菌营养缺陷型菌株中细胞递送的新型生物载体-核苷酸系统的合成

  摘要：

  为寻找细菌细胞中胸苷单磷酸（TMP）的递送方法，我们合成了一系列TMP与生物素结合物，该结合物在生物素的羧基和3'之间具有羟甲基氧酸酯，羧基酯和不同的羧酰胺连接基。 TMP的-OH基。合成策略从具有在3'-位已经连接的接头的5'- O-（磷酸二苄基酯）-胸苷开始。同样，卡那霉素A使用氨基甲酰基或硫代乙基氨基甲酰基在TMP的3'-位连接。这些缀合物均不能维持ΔthyA，ΔphoA大肠杆菌菌株的生长。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2014.09.096

文献信息

• Enhanced RNA binding of dimerized aminoglycosides
  作者：Katja Michael、Hai Wang、Yitzhak Tor

  DOI：10.1016/s0968-0896(99)00071-1

  日期：1999.7

  symmetrical and nonsymmetrical dimeric aminoglycosides. These unnatural derivatives were compared to their natural "monomeric" counterparts in their ability to inhibit the Tetrahymena ribozyme. The dimeric aminoglycosides inhibit ribozyme function 20 to 1.2 x 10(3) fold more effectively than their natural parent compounds. The inhibition curves of dimeric aminoglycosides have characteristic shapes suggesting

  氨基糖苷类抗生素最近已成为一个有趣的RNA结合分子家族，它们已成为设计新型RNA配体的主要结构。氨基糖苷-RNA识别现象的去神秘化是开发高级结合剂所必需的。为了探索大RNA分子中多个结合位点的存在，我们合成了共价连接的对称和非对称二聚氨基糖苷。将这些非天然衍生物与它们的天然“单体”对应物在抑制四膜虫核酶方面的能力进行了比较。二聚氨基糖苷比其天然母体化合物更有效地抑制核酶功能20到1.2 x 10（3）倍。二聚氨基糖苷的抑制曲线具有特征性形状，表明在核酶的三维折叠中存在至少两个高亲和力结合位点。提出了二聚氨基糖苷与RNA分子的两个互补位点的相互作用。这种结合基序可能对靶向细菌和病毒病原体的关键RNA分子的新药物的开发有影响。
• Rapid solid-phase syntheses of a peptidic-aminoglycoside library
  作者：Casey Kukielski、Krishnagopal Maiti、Sayantan Bhaduri、Sandra Story、Dev P. Arya

  DOI：10.1016/j.tet.2018.07.012

  日期：2018.8

  kanamycin and neomycin as the model aminoglycosides, was systematically and rapidly synthesized via solid phase peptide synthesis. Aminoglycosides were first converted into N-Boc protected carboxylic acids and fifteen l-amino acids were then used in the diversification of the full library. The approach outlined describes a rapid synthetic procedure where >200 PA compounds can be synthesized in a few months

  通过卡那霉素和新霉素作为模型氨基糖苷，通过固相肽合成系统地快速合成了单氨基酸和二氨基酸肽基氨基糖苷（PAs）文库。氨基糖苷类首先转化成Ñ -Boc保护的羧酸十五升然后，将α-氨基酸用于整个文库的多样化。概述的方法描述了一种快速合成方法，其中可以在几个月内合成纯度超过85-95％的200多种PA化合物。紫外线热变性评估了PA对模型人和细菌A位rRNA序列的结合稳定性。在PA之间的热熔解曲线中发现了显着差异，这归因于特定的氨基酸序列。新霉素功率放大器导致A位rRNA序列的稳定化大得多的变化（ΔT米 相比，卡那霉素的PA = 2.6-17.1℃）（=的ΔTm0.4-4.3℃）。卡那霉素PA对革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌几乎没有活性，而新霉素PA具有显着的抗菌活性，MIC为2至16μM。
• GUANIDINYLATED AMINOGLYCOSIDE-LIPID CONJUGATES
  申请人：Schweizer Frank

  公开号：US20130053337A1

  公开（公告）日：2013-02-28

  Guanadinylated aminoglycoside-lipid conjugates are prepared. Such conjugates may comprise an aminoglycoside such as an aminoglyucoside antibiotic like neomycin or kanamycin, at least one guanidino group attached to a primary or secondary carbon atom of the aminoglyucoside group and at least one lipid group attached through a bond or a linker to a branched carbon atom of the aminoglycoside. These conjugates exhibit improve antibacterial activity and may be used in conjunction with another antibiotic.

  制备了鸟氨酸基氨基糖苷-脂质共轭物。这些共轭物可以包括氨基糖苷，例如新霉素或卡那霉素等氨基糖苷类抗生素，至少一个鸟氨酸基团连接到氨基糖苷基团的一次或二次碳原子上，并且至少一个脂质基团通过键或连接物连接到氨基糖苷的支链碳原子上。这些共轭物表现出改善的抗菌活性，可以与另一种抗生素一起使用。
• Synthesis and antibacterial activity of 6″-decanesulfonylacetamide-functionalised amphiphilic derivatives of amikacin and kanamycin
  作者：Dylan C. Farr、Lendl Tan、Juanelle Furness、I. Darren Grice、Nicholas P. West、Todd A. Houston

  DOI：10.1071/ch23154

  日期：——

  Aminoglycoside antibiotics represent the first class of successful drugs in the treatment of tuberculosis; however, mycobacteria and other bacterial species possess several drug resistance mechanisms to inactivate these natural products. In the past 15 years, a variety of amphiphilic aminoglycosides have been shown to have improved activity against infectious microorganisms and to subvert resistance mechanisms. Here, we report on four novel synthetic compounds derived from two existing potent antitubercular compounds and describe their activity against both Mycobacterium tuberculosis and Staphylococcus aureus. It was found that a decanesulfonylacetamide-based conjugate of amikacin displayed promising preliminary antitubercular activities, warranting further investigation to assess the therapeutic potential of these unique antimicrobials.

  氨基糖苷类抗生素是治疗结核病的第一类成功药物；然而，分枝杆菌和其他细菌物种拥有多种抗药性机制，可使这些天然产物失活。在过去的 15 年中，多种两性氨基糖苷类药物被证明对传染性微生物具有更强的活性，并能颠覆耐药机制。在此，我们报告了从现有的两种强效抗结核化合物中衍生出的四种新型合成化合物，并描述了它们对结核分枝杆菌和金黄色葡萄球菌的活性。研究发现，一种基于癸烷磺酰乙酰胺的阿米卡星共轭物显示出良好的初步抗结核活性，值得进一步研究以评估这些独特抗菌素的治疗潜力。
• [EN] COMPOUNDS AND METHODS FOR MODULATING RNA FUNCTION<br/>[FR] COMPOSÉS ET MÉTHODES PERMETTANT DE MODULER LA FONCTION DE L'ARN
  申请人：ARRAKIS THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2018006074A3

  公开（公告）日：2018-02-15