(2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol | 119898-65-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol
• 英文别名: 5'-O-[(tert-butyl)diphenylsilyl]adenosine；5'-(O-tert-butyldiphenylsilyl)adenosine；5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)adenosine；5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)cytidine；5'-O-t-butyldiphenylsilyladenosine；(2R,3R,4S,5R)-2-(6-Amino-9H-purin-9-yl)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol；(2R,3R,4S,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]oxolane-3,4-diol
• CAS: 119898-65-6
• 化学式: C₂₆H₃₁N₅O₄Si
• 分子量: 505.649
• InChiKey: XBWAOGQHAWZSOT-PTGPVQHPSA-N

物化性质

• 沸点：
  682.5±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.33±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol 在 吡啶 、 咪唑 、 sodium azide 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 水 、 碘 、 碳酸氢钠 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 正丁胺 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 sodium hydroxide 、 sodium t-butanolate 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 97.5h， 生成 3'-amino-5'-azido-N⁶-benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3',5'-dideoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  [EN] CYCLIC DINUCLEOTIDE ANALOGS FOR TREATING CONDITIONS ASSOCIATED WITH STING (STIMULATOR OF INTERFERON GENES) ACTIVITY
  [FR] ANALOGUES DE DINUCLÉOTIDES CYCLIQUES POUR TRAITER DES ÉTATS ASSOCIÉS À L'ACTIVITÉ DE LA PIQÛRE (STIMULATEUR DES GÈNES DE L'INTERFÉRON)

  摘要：

  本公开涉及化学实体（例如，调节（例如，激动或部分激动）干扰素基因刺激器（STING）的化合物，或者药物可接受的盐，和/或水合物，和/或共晶体，和/或化合物的药物组合），这些化学实体可用于治疗某些疾病，疾病或疾病，其中STING活性的减少或增加（例如，减少，例如，与受抑或受损的STING信号相关的情况，疾病或障碍）有助于病理学和/或症状和/或病情的进展（例如，癌症）在受试者（例如，人类）中。本公开还涉及组合物以及使用和制备它们的其他方法。

  公开号：

  WO2018045204A1
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2',3'-di-O-(p-toluenesulfonyl)adenosine 在 sodium naphthalenide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以93%的产率得到(2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((tert-butyldiphenylsilyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol
  参考文献：
  名称：

  用萘钠有效去除嘌呤核苷中的糖O-甲苯磺酰基和杂环卤素

  摘要：

  萘二甲酸钠可去除糖中的2 '-，3'-或5'- O-甲苯磺酰基，并去除嘌呤核苷中的2-，6-或8-卤素。开发了一种改进的甲苯磺酰基保护策略，用于从2'，5'-二-O-甲苯磺酰基腺苷合成9-（3-脱氧-3-氟-β-D-木呋喃糖基）腺嘌呤。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(97)00313-x

文献信息

• Synthesis and in vitro growth inhibitory activity of novel silyl- and trityl-modified nucleosides
  作者：Jenny-Lee Panayides、Véronique Mathieu、Laetitia Moreno Y. Banuls、Helen Apostolellis、Nurit Dahan-Farkas、Hajierah Davids、Leonie Harmse、M.E. Christine Rey、Ivan R. Green、Stephen C. Pelly、Robert Kiss、Alexander Kornienko、Willem A.L. van Otterlo

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.04.036

  日期：2016.6

  Seventeen silyl- and trityl-modified (5'-O- and 3',5'-di-O-) nucleosides were synthesized with the aim of investigating the in vitro antiproliferative activities of these nucleoside derivatives. A subset of the compounds was evaluated at a fixed concentration of 100μM against a small panel of tumor cell lines (HL-60, K-562, Jurkat, Caco-2 and HT-29). The entire set was also tested at varying concentrations

  为了研究这些核苷衍生物的体外抗增殖活性，合成了十七个甲硅烷基和三苯甲基修饰的（5'-O-和3'，5'-di-O-）核苷。针对一小组肿瘤细胞系（HL-60，K-562，Jurkat，Caco-2和HT-29）以固定的100μM浓度评估了这些化合物的子集。还以两种人胶质瘤细胞株（U373和Hs683）的不同浓度对整套样品进行了测试，得出GI50值，最好的结果是〜25μM。
• Improved Protocol for the Synthesis of Flexibly Protected Morpholino Monomers from Unprotected Ribonucleosides
  作者：Sankha Pattanayak、Sibasish Paul、Bappaditya Nandi、Surajit Sinha

  DOI：10.1080/15257770.2012.724491

  日期：2012.11

  protected morpholino monomers from unprotected ribonucleosides in high overall yield, using oxidative glycol cleavage and reductive amination strategy. Unlike the previous methods, the present strategy allows installing the exocyclic amine protections at a later stage, and thus avoids the use of expensive, or commercially unavailable, exocyclic amine-protected ribonucleosides as starting materials. To

  已经开发了一种廉价且大大改进的方案，使用氧化乙二醇裂解和还原胺化策略从未保护的核糖核苷以高总收率合成受保护的吗啉代单体。与先前的方法不同，本策略允许在稍后的阶段安装环外胺保护剂，从而避免使用昂贵的或市售的环外胺保护的核糖核苷作为起始原料。为了证明本发明方法在选择保护基上的灵活性，已在环外胺位置用几个具有不同解嵌段性质的此类基团保护了单体。
• Nucleic Acid Related Compounds. 105. Synthesis of 2‘,3‘-Didehydro-2‘,3‘-dideoxynucleosides from Ribonucleoside Cyclic 2‘,3‘-(Sulfates or Phosphates) or 2‘,3‘-Dimesylates via Reductive Elimination with Sodium Naphthalenide¹
  作者：Morris J. Robins、Elzbieta Lewandowska、Stanislaw F. Wnuk

  DOI：10.1021/jo981013m

  日期：1998.10.1

  gave the 2',3'-unsaturated nucleosides. Parallel treatment of adenosine cyclic 2',3'-phosphate gave the 2',3'-olefin. The adenine, hypoxanthine, and 2-amino-6-methoxypurine 2',3'-didehydro-2',3'-dideoxynucleosides were prepared efficiently (40-60% overall yields of crystalline, analytically pure products; 3-5 steps, some combined into one-flask procedures) by treatment of 5'-O-protected 2',3'-di-O-mesylribonucleosides

  用亚硫酰氟处理嘌呤核糖核苷导致形成环状2'，3'-亚硫酸酯。5'-羟基的乙酰化和Sharpless氧化（NaIO（4）/ RuCl（3））得到环状2'，3'-硫酸酯衍生物。用亚硫酰氯处理5'-O-甲硅烷基保护的核糖核苷，然后氧化，得到了环状2'，3'-硫酸盐的另一种途径。用萘钠（THF / -50℃）还原消除，得到2′，3′-不饱和核苷。腺苷环2'，3'-磷酸的平行处理得到2'，3'-烯烃。有效地制备了腺嘌呤，次黄嘌呤和2-氨基-6-甲氧基嘌呤2'，3'-二氢-2'，3'-二脱氧核苷（结晶，分析纯产品的总收率为40-60％； 3-5个步骤，通过将5'-O-保护的2'，3'-di-O-甲磺酰基核糖核苷用萘钠处理来将它们合并成一个烧瓶。反应是在环境温度或低于环境温度的条件下使用容易获得的试剂和标准实验室条件进行的。
• An Efficient Synthesis of 3′-Amino-3′-deoxyguanosine from Guanosine
  作者：Lei Zhang、Zhiyong Cui、Biliang Zhang

  DOI：10.1002/hlca.200390069

  日期：2003.3

  3′-Amino-3′-deoxyguanosine was synthesized from guanosine in eight steps and 58% overall yield. The 2′,3′-diol of 5′-O-[(tert-butyl)diphenylsilyl]-2-N-[(dimethylamino)methylidene]guanosine was reacted with α-acetoxyisobutyryl bromide and treated with 0.5n NH3 in MeOH to yield 9-2′-O-acetyl-3′-bromo-5′-O-[(tert-butyl)diphenylsilyl]-3′-deoxy-β-D-xylofuranosyl]-2-N-[(dimethylamino)methylidene]guanine

  由鸟苷经八步合成3'-氨基-3'-脱氧鸟苷，总产率为58％。使5'- O -[（叔丁基）二苯基甲硅烷基] -2- N -[（二甲基氨基）亚甲基]鸟苷的2'，3'-二醇与α-乙酰氧基异丁酰溴反应，并用0.5n NH 3的MeOH溶液处理得到9- 2' - O-乙酰基-3'-溴-5'- O -[（叔丁基）二苯基甲硅烷基] -3'-脱氧-β -D-呋喃呋喃糖基] -2- N -[（二甲基氨基）亚甲基]鸟嘌呤，将其与异氰酸苄酯，NaH，然后与3.0n NaOH反应，最后与Pd / C（10％）和HCO 2 NH 4反应 在EtOH / AcOH中溶解得到3′-氨基-3′-脱氧鸟苷。
• Stereoselective and Divergent Aza-Adenosine and Aza-Guanosine Syntheses from Xylofuranose, the Key Fragments of a STING Cyclic Dinucleotide Agonist
  作者：Changxia Yuan、Adrian Ortiz、Zhongmin Xu、Jason Zhu、Michael A. Schmidt、Amanda Rogers、Martin Eastgate

  DOI：10.1021/acs.joc.1c00984

  日期：2022.2.18

  The stereoselective and divergent synthesis of two aza-nucleosides is reported. Starting from xylofuranose 9, aza-adenosine 2 was prepared in 13 steps and 7% overall yield, and aza-guanosine 3 was prepared in 13 steps and 7.8% overall yield. Compared to the original syntheses, some advantages of these new routes are significant yield improvement, overall step-count reduction, an optimized protecting

  报道了两种氮杂核苷的立体选择性和发散合成。从木呋喃糖9开始，氮杂腺苷2的制备分 13 步，总产率为 7%，氮杂鸟苷3的制备分 13 步，总产率为 7.8%。与原始合成相比，这些新路线的一些优点是显着提高产量、减少整体步数、优化保护基策略、开发用于含氮碱基掺入的多功能平台以及消除有害试剂（例如苄基异氰酸酯，Et 3 N·HF)。