neglected. In this study we computationally extended, chemically synthesized, and experimentally assayed new ligands for the β2-adrenergic receptor (β2AR) by growing fragment-sized ligands. In order to address the synthetic tractability issue, our in silico workflow aims at derivatized products based on robust organic reactions. The study started from the predicted binding modes of five fragments. We suggested
基于片段的药物发现与片段扩展方法密切相关,可以使用从头设计软件加速片段扩展方法。尽管计算机允许轻松生成数以百万计的建议,但综合可行性却经常被忽略。在这项研究中,我们计算延长,
化学合成,和实验测定的β新
配体2
肾上腺素能受体(β 2AR)通过增加片段大小的
配体来实现。为了解决合成易处理性问题,我们的计算机模拟工作流程旨在基于稳健的有机反应衍生化产品。该研究从五个片段的预测结合模式开始。我们提出了总共八种易于合成的不同延伸序列,进一步的分析表明,与它们各自的初始片段相比,四种产物具有更高的亲和力(最高40倍)。所描述的工作流程(我们称其为“通过合并增长”)及其关键工具可在线使用,可以改进基于片段的早期药物发现项目,使其成为药物
化学家在结构与活性关系(
SAR)研究期间有用的创新工具。