penta-azidotobramycin | 468065-22-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: penta-azidotobramycin
• 英文别名: tobramycin azide；O-3-azido-3-deoxy-α-D-glucopyranosyl-(1→6)-O-[2,6-diazido-2,3,6-trideoxy-α-D-ribo-hexopyranosyl-(1→4)]-1,3-diazido-1,2,3-trideoxy-D-myo-inositol；(2S,3R,4S,5S,6R)-4-azido-2-(((1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diazido-3-(((2R,3R,5S,6R)-3-azido-6-(azidomethyl)-5-hydroxytetrahydro-2H-pyran-2-yl)oxy)-2-hydroxycyclohexyl)oxy)-6(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-3,5-diol；perazidotobramycin；(2S,3R,4S,5S,6R)-4-azido-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diazido-3-[(2R,3R,5S,6R)-3-azido-6-(azidomethyl)-5-hydroxyoxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxane-3,5-diol
• CAS: 468065-22-7
• 化学式: C₁₈H₂₇N₁₅O₉
• 分子量: 597.507
• InChiKey: BVTUPQPVPDSWNJ-PBSUHMDJSA-N

物化性质

• 溶解度：
  可溶于氯仿、甲醇

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  210
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  penta-azidotobramycin 在 palladium dihydroxide N-碘代丁二酰亚胺 、 硫酸 、 水 、 氢气 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， -78.0~20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 1.33h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Glyco-optimization of aminoglycosides: new aminoglycosides as novel anti-infective agents

  摘要：

  Glyco-optimization (OPopS(TM)) of aminoglycosides has been performed by replacing the existing sugar moiety with a variety of sugar derivatives. Glycosylation of the 6-position of nebramine provided a library of novel 4,6-linked aminoglycosides (AMGs). Among them, compounds 8b,g,i,l, and 8u with 2"-amino, 2",3"-diamino, 2",4"-diamino, 3,4"-diamino, 3"-amino groups, respectively, showed significant antimicrobial activity against Gram-(+) and -(-) bacteria. Several were particularly potent against Pseudomonus aeruginosa with MICs in the 1-2 mug/mL range. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2004.05.004
• 作为产物：
  描述：

  硫酸妥布霉素 在 zinc(II) chloride triflic azide 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 3.0h， 以95%的产率得到penta-azidotobramycin
  参考文献：
  名称：

  胺-叠氮化物相互转化的化学：催化重氮转移和区域选择性叠氮化物还原

  摘要：

  叠氮化物已被证明是有机合成中胺的有用前体。这份报告描述了重氮转移反应的改进和含有多种叠氮化物的化合物的区域选择性叠氮化物还原的第一个例子。使用特定比例的溶剂和氯化锌作为催化剂导致更有效的重氮转移反应，能够以比以前报道的更短的反应时间提供>90% 的转化率/胺。通过在低温下使用三甲基膦对施陶丁格反应进行改进，可以以中等产率以良好的区域选择性还原叠氮化物。电子因素决定叠氮化物还原的选择性，反应可通过起始材料的 NMR 分析进行预测。

  DOI：

  10.1021/ja0264605

文献信息

• Hybrid Antibiotic Overcomes Resistance in <i>P. aeruginosa</i> by Enhancing Outer Membrane Penetration and Reducing Efflux
  作者：Bala Kishan Gorityala、Goutam Guchhait、Sudeep Goswami、Dinesh M. Fernando、Ayush Kumar、George G. Zhanel、Frank Schweizer

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b00867

  日期：2016.9.22

  cytoplasmic membrane in P. aeruginosa. The optimized hybrid protects Galleria mellonella larvae from the lethal effects of MDR P. aeruginosa. Attempts to select for resistance over a period of 25 days resulted in a 2-fold increase in the minimal inhibitory concentration (MIC) for the hybrid, while moxifloxacin or tobramycin resulted in a 16- and 512-fold increase in MIC. Although the hybrid possesses potent

  治疗多药耐药性（MDR）的铜绿假单胞菌感染的治疗措施受到严格限制，通常需要使用粘菌素作为最后的药物。阻碍新型抗假单胞菌药物开发的主要挑战是缺乏细胞渗透和大量外排。我们发现了妥布霉素-莫西沙星混合核心结构，通过耗散铜绿假单胞菌的细胞质膜的质子动力，增强了外膜的通透性并降低了流出。经过优化的杂种可以保护圆屋顶幼虫免受铜绿假单胞菌的致死作用。尝试在25天的时间内选择抗药性会导致杂种的最低抑菌浓度（MIC）增加2倍，而莫西沙星或妥布霉素会使MIC增加16倍和512倍。尽管杂种具有强大的抗MDR活性，但铜绿假单胞菌分离出与其他种类的抗生素联合使用时可以协同作用的活性。
• Adjuvants Based on Hybrid Antibiotics Overcome Resistance in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> and Enhance Fluoroquinolone Efficacy
  作者：Bala Kishan Gorityala、Goutam Guchhait、Dinesh M. Fernando、Soumya Deo、Sean A. McKenna、George G. Zhanel、Ayush Kumar、Frank Schweizer

  DOI：10.1002/anie.201508330

  日期：2016.1.11

  tobramycin–ciprofloxacin hybrid adjuvants that rescue the activity of fluoroquinolone antibiotics against MDR and extremely drug‐resistant Pseudomonas aeruginosa isolates in vitro and enhance fluoroquinolone efficacy in vivo. Structure–activity studies reveal that the presence of both tobramycin and ciprofloxacin, which are separated by a C12 tether, is critical for the function of the adjuvant. Mechanistic studies

  使用挽救抗生素抵抗多药耐药（MDR）病原体的佐剂是克服细菌耐药性的有前途的联合策略。虽然β-内酰胺类抗生素和β-内酰胺酶抑制剂的组合在恢复MDR细菌的抗菌功效方面已经取得了成功，但使用佐剂恢复MDR革兰氏阴性病原体中的氟喹诺酮功效仍然具有挑战性。我们描述了妥布霉素-环丙沙星杂合佐剂，可在体外拯救氟喹诺酮类抗生素对MDR和极度耐药的铜绿假单胞菌分离物的活性，并增强体内氟喹诺酮类药物的疗效。结构活性研究表明，妥布霉素和环丙沙星的存在（通过C12系链分开）对于佐剂的功能至关重要。
• Aminoglycoside antibiotics as novel anti-infective agents
  申请人：——

  公开号：US20040058880A1

  公开（公告）日：2004-03-25

  This invention relates to novel aminoglycoside compounds having antibacterial and anti-infective activity and to pharmaceutical compositions, methods of making and methods of treatment employing the same.

  这项发明涉及具有抗菌和抗感染活性的新型氨基糖苷化合物，以及包括这些化合物的药物组合物、制备方法和治疗方法。
• Effects of 5-<i>O</i>-Ribosylation of Aminoglycosides on Antimicrobial Activity and Selective Perturbation of Bacterial Translation
  作者：Ido M. Herzog、Sivan Louzoun Zada、Micha Fridman

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b00793

  日期：2016.9.8

  We studied six pairs of aminoglycosides and their corresponding ribosylated derivatives synthesized by attaching a β-O-linked ribofuranose to the 5-OH of the deoxystreptamine ring of the parent pseudo-oligosaccharide antibiotic. Ribosylation of the 4,6-disubstituted 2-deoxystreptamine aminoglycoside kanamycin B led to improved selectivity for inhibition of prokaryotic relative to cytosolic eukaryotic

  我们研究了六对通过连接β- O合成的氨基糖苷及其相应的核糖基化衍生物-呋喃核糖连接到母体假寡糖抗生素的脱氧链胺胺环的5-OH。相对于胞质真核生物体外翻译，4,6-二取代的2-脱氧链胺胺氨基糖苷卡那霉素B的核糖基化导致抑制原核生物的选择性提高。对于伪二糖氨基糖苷支架神经酰胺和神经胺，核糖基化衍生物既更有效，又对抑制原核翻译的选择性更高。根据这项研究的结果，我们建议修饰其他天然或半合成的假二糖氨基糖苷支架的链胺环的5-OH位置，该支架在2'糖位置包含赤道胺，并带有β- O连接的呋喃核糖是开发新型氨基糖苷类抗生素的一种有前途的途径，该抗生素具有更高的功效和更低的毒性。
• Differential Effects of Linkers on the Activity of Amphiphilic Tobramycin Antifungals
  作者：Marina Fosso、Sanjib Shrestha、Nishad Thamban Chandrika、Emily Dennis、Keith Green、Sylvie Garneau-Tsodikova

  DOI：10.3390/molecules23040899

  日期：——

  continues to rise and the availability of antifungal drugs remains a concern, it becomes obvious that the need to bolster the antifungal armamentarium is urgent. Building from our previous findings of tobramycin (TOB) derivatives with antifungal activity, we further investigate the effects of various linkers on the biological activity of these aminoglycosides. Herein, we analyze how thioether, sulfone, triazole

  随着与真菌感染有关的威胁继续增加，并且仍然需要关注抗真菌药物的使用，很明显，增强抗真菌武器库的需求迫在眉睫。根据我们先前对具有抗真菌活性的妥布霉素（TOB）衍生物的发现，我们进一步研究了各种接头对这些氨基糖苷类生物活性的影响。本文中，我们分析了硫醚，砜，三唑，酰胺和醚的官能度如何影响烷基化TOB衍生物对22种念珠菌，隐球菌和曲霉菌的抗真菌活性。我们还评估了它们对鼠红细胞的溶血作用和对哺乳动物细胞系的细胞毒性的影响。虽然三唑连接物似乎总体上具有最佳活性，