1-(2-O-acetyl-3,5-di-O-benzyl-4-C-(p-toluenesulphonyloxymethyl)-α-D-ribofuranosyl)thymine | 209968-87-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-(2-O-acetyl-3,5-di-O-benzyl-4-C-(p-toluenesulphonyloxymethyl)-α-D-ribofuranosyl)thymine
• 英文别名: [(2R,3R,4S,5S)-2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-5-[(4-methylphenyl)sulfonyloxymethyl]-4-phenylmethoxy-5-(phenylmethoxymethyl)oxolan-3-yl] acetate
• CAS: 209968-87-6
• 化学式: C₃₄H₃₆N₂O₁₀S
• 分子量: 664.733
• InChiKey: KRVXKWTTWCQKMY-JFULRSNISA-N

物化性质

• 密度：
  1.38±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2-O-acetyl-3,5-di-O-benzyl-4-C-(p-toluenesulphonyloxymethyl)-α-D-ribofuranosyl)thymine 在 吡啶 、 10 wt% Pd(OH)2 on carbon 、 potassium hydrogencarbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 反应 28.0h， 生成 ((1R,3R,4R,7S)-7-hydroxy-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl)methyl isobutyrate
  参考文献：
  名称：

  糖和核苷类似物的合成及其抗癌和镇痛潜力的评价

  摘要：

  糖和核苷的化学修饰在生产具有更高选择性和功效的化合物方面有着悠久的历史。在这项研究中，由 α- d-葡萄糖通过总共 21 个步骤合成了几种修饰糖 (2-3 )和核糖核苷类似物 ( 4-8 ) 。在乙酸诱导的小鼠扭体试验中测试了化合物的外周抗伤害特性，其中化合物2、7和8显示扭伤次数分别显着减少了 56%、62% 和 63%。还通过台盼蓝染料排除试验和细胞计数试剂盒 8 (CCK-8) 测定法测试了这些化合物对人 HeLa 细胞系的细胞毒性潜力。化合物6表现出显着的细胞毒活性，IC 50值为 54 µg/mL。分子对接模拟显示化合物2、7和8对环氧合酶 1 ( COX-1) 和环氧合酶 2 (COX-2) 酶具有相当的结合亲和力。此外，桥接核苷类似物7和8也有效抑制腺苷激酶，这表明其抗伤害作用背后的替代机制途径。细胞毒性化合物6与抗癌药物靶点人胞苷脱氨酶、原癌基因酪氨酸蛋白激酶 Src、人胸苷激酶

  DOI：

  10.3390/molecules27113499
• 作为产物：
  描述：

  1,2:5,6-二-o-异亚丙基-alpha-d-ribo-3-己呋喃核糖 在 4-二甲氨基吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 sodium periodate 、 硫酸 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 68.0h， 生成 1-(2-O-acetyl-3,5-di-O-benzyl-4-C-(p-toluenesulphonyloxymethyl)-α-D-ribofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  糖和核苷类似物的合成及其抗癌和镇痛潜力的评价

  摘要：

  糖和核苷的化学修饰在生产具有更高选择性和功效的化合物方面有着悠久的历史。在这项研究中，由 α- d-葡萄糖通过总共 21 个步骤合成了几种修饰糖 (2-3 )和核糖核苷类似物 ( 4-8 ) 。在乙酸诱导的小鼠扭体试验中测试了化合物的外周抗伤害特性，其中化合物2、7和8显示扭伤次数分别显着减少了 56%、62% 和 63%。还通过台盼蓝染料排除试验和细胞计数试剂盒 8 (CCK-8) 测定法测试了这些化合物对人 HeLa 细胞系的细胞毒性潜力。化合物6表现出显着的细胞毒活性，IC 50值为 54 µg/mL。分子对接模拟显示化合物2、7和8对环氧合酶 1 ( COX-1) 和环氧合酶 2 (COX-2) 酶具有相当的结合亲和力。此外，桥接核苷类似物7和8也有效抑制腺苷激酶，这表明其抗伤害作用背后的替代机制途径。细胞毒性化合物6与抗癌药物靶点人胞苷脱氨酶、原癌基因酪氨酸蛋白激酶 Src、人胸苷激酶

  DOI：

  10.3390/molecules27113499

文献信息

• Design, Synthesis, and Properties of 2‘,4‘-BNA^NC:  A Bridged Nucleic Acid Analogue
  作者：S. M. Abdur Rahman、Sayori Seki、Satoshi Obika、Haruhisa Yoshikawa、Kazuyuki Miyashita、Takeshi Imanishi

  DOI：10.1021/ja710342q

  日期：2008.4.1

  incorporated into oligonucleotides, and their properties were investigated and compared with those of 2',4'-BNA (LNA)-modified oligonucleotides. Compared to 2',4'-BNA (LNA)-modified oligonucleotides, 2',4'-BNA(NC) congeners were found to possess: (i) equal or higher binding affinity against an RNA complement with excellent single-mismatch discriminating power, (ii) much better RNA selective binding, (iii)

  设计并合成了新型桥接核酸类似物 2',4'-BNA(NC)（2'-O,4'-C-氨基亚甲基桥接核酸），包含一个六元桥接结构和 NO 键有效地展示了构建全氢-1,2-恶嗪环的一锅式分子内 NC 键形成关键反应（11 和 12）。合成了 2',4'-BNA(NC) (2',4'-BNA(NC)[NH]、[NMe] 和 [NBn]) 的三种单体并将其掺入寡核苷酸中，并研究了它们的性质并与 2',4'-BNA (LNA) 修饰的寡核苷酸相比。与 2',4'-BNA (LNA) 修饰的寡核苷酸相比，发现 2',4'-BNA(NC) 同源物具有：(i) 对 RNA 补体具有相同或更高的结合亲和力，具有出色的单错配识别能力力量，(ii) 更好的 RNA 选择性结合，(iii) 更强且更具序列选择性的三链体形成特征，以及 (iv) 极高的核酸酶抗性，甚至高于 S(p)-硫代磷酸酯类似物。具有这些优异特性的
• Novel convenient syntheses of LNA [2.2.1]bicyclo nucleosides
  作者：Alexei A. Koshkin、Vivek K. Rajwanshi、Jesper Wengel

  DOI：10.1016/s0040-4039(98)00706-0

  日期：1998.6

  oligonucleotide analogue containing [2.2.1]bicyclo nucleoside monomers. A novel and significantly improved method for convergent synthesis of LNA [2.2.1]bicyclo nucleosides using a 4-C-tosyloxymethyl-1, 2-di-O-acetyl furanose as a key synthon is described. In addition, an alternative, robust linear approach allowing selective formation of the desired [2.2.1]bicyclo LNA nucleosides via a tricyclic nucleoside

  LNA（锁定核酸）是一种新型的寡核苷酸类似物，含有[2.2.1]双环核苷单体。描述了一种新颖且显着改进的方法，该方法使用4-C-甲苯磺酰氧基甲基-1，2-二-O-乙酰基呋喃糖作为关键合成子，聚合合成LNA [2.2.1]双环核苷。此外，介绍了一种替代的，稳健的线性方法，该方法允许通过三环核苷中间体选择性形成所需的[2.2.1]双环LNA核苷。
• Highly Stable Pyrimidine-Motif Triplex Formation at Physiological pH Values by a Bridged Nucleic Acid Analogue
  作者：S. M. Abdur Rahman、Sayori Seki、Satoshi Obika、Sunao Haitani、Kazuyuki Miyashita、Takeshi Imanishi

  DOI：10.1002/anie.200604857

  日期：2007.6.4
• NOVEL ARTIFICIAL NUCLEIC ACIDS OF N-O BOND CROSSLINKAGE TYPE
  申请人：IMANISHI, Takeshi

  公开号：EP1661905B9

  公开（公告）日：2012-12-19