(4R)-N-(叔-丁基氧羰基)-4-(氰基甲基)-L-谷氨酸1,5-二甲酯 | 328086-57-3

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: (4R)-N-(叔-丁基氧羰基)-4-(氰基甲基)-L-谷氨酸1,5-二甲酯
• 中文别名: 2-叔丁氧基羰基氨基-4-氰甲基-戊二酸二甲酯
• 英文名称: dimethyl (2S,4R)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-4-(cyanomethyl)pentanedioate
• 英文别名: 1,5-dimethyl (2S,4R)-2-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-4-(cyanomethyl)pentanedioate；(2S,4R)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-4-(cyanomethyl)glutaric acid dimethyl ester；(4R)-N-(tert-Butyloxycarbonyl)-4-(cyanomethyl)-L-glutamic Acid 1,5-Dimethyl Ester；dimethyl (2R,4S)-2-(cyanomethyl)-4-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanedioate
• CAS: 328086-57-3
• 化学式: C₁₄H₂₂N₂O₆
• 分子量: 314.338
• InChiKey: QVTOOWHELURIDU-UWVGGRQHSA-N

物化性质

• 沸点：
  460.6±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.151±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于二氯甲烷、乙酸乙酯、甲醇

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 危险性防范说明：
  P501,P270,P264,P280,P302+P352,P337+P313,P305+P351+P338,P362+P364,P332+P313,P301+P312+P330
• 危险性描述：
  H302,H315,H319
• 储存条件：
  室温且干燥

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (4R)-N-(叔-丁基氧羰基)-4-(氰基甲基)-L-谷氨酸1,5-二甲酯 在 sodium tetrahydroborate 、 cobalt(II) chloride hexahydrate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 48.0h， 以46.3%的产率得到(alphaS,3S)-alpha-[(叔-丁基氧羰基)氨基]-2-氧代-3-吡咯烷丙酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  基于结构的 SARS-CoV-2 3C 类蛋白酶拟肽抑制剂设计作为有效的抗病毒候选药物

  摘要：

  严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 作为 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 的病原体，已感染数百万人并夺去数十万人的生命。不幸的是，缺乏预防或治疗 COVID-19 的有效药物。SARS-CoV-2 的3C 样蛋白酶 (3CL Pro ) 对病毒复制和转录至关重要，是开发抗 SARS-CoV-2 药物的有吸引力的靶标。针对3CL Pro，我们筛选了我们的蛋白酶抑制剂库，得到了化合物10a作为弱抑制SARS-CoV-2 3CL Pro的靶标，并确定了10a的共晶结构和蛋白酶。基于对 hit 与 SARS-CoV-2 3CL Pro之间的蛋白配体复合物的深入理解，我们设计了一系列拟肽抑制剂，对 SARS-CoV-2 3CL Pro 具有突出的抑制活性，对 SARS-CoV-2 3CL Pro具有出色的抗病毒效力SARS-CoV-2。X 射线共晶研究明确描述了其他关键抑制剂与

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114458
• 作为产物：
  描述：

  L-谷氨酸 在 氯化亚砜 、 三乙胺 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 9.5h， 生成 (4R)-N-(叔-丁基氧羰基)-4-(氰基甲基)-L-谷氨酸1,5-二甲酯
  参考文献：
  名称：

  基于结构的 SARS-CoV-2 3C 类蛋白酶拟肽抑制剂设计作为有效的抗病毒候选药物

  摘要：

  严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 作为 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 的病原体，已感染数百万人并夺去数十万人的生命。不幸的是，缺乏预防或治疗 COVID-19 的有效药物。SARS-CoV-2 的3C 样蛋白酶 (3CL Pro ) 对病毒复制和转录至关重要，是开发抗 SARS-CoV-2 药物的有吸引力的靶标。针对3CL Pro，我们筛选了我们的蛋白酶抑制剂库，得到了化合物10a作为弱抑制SARS-CoV-2 3CL Pro的靶标，并确定了10a的共晶结构和蛋白酶。基于对 hit 与 SARS-CoV-2 3CL Pro之间的蛋白配体复合物的深入理解，我们设计了一系列拟肽抑制剂，对 SARS-CoV-2 3CL Pro 具有突出的抑制活性，对 SARS-CoV-2 3CL Pro具有出色的抗病毒效力SARS-CoV-2。X 射线共晶研究明确描述了其他关键抑制剂与

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114458

文献信息

• A Quick Route to Multiple Highly Potent SARS‐CoV‐2 Main Protease Inhibitors**
  作者：Kai S. Yang、Xinyu R. Ma、Yuying Ma、Yugendar R. Alugubelli、Danielle A. Scott、Erol C. Vatansever、Aleksandra K. Drelich、Banumathi Sankaran、Zhi Z. Geng、Lauren R. Blankenship、Hannah E. Ward、Yan J. Sheng、Jason C. Hsu、Kaci C. Kratch、Baoyu Zhao、Hamed S. Hayatshahi、Jin Liu、Pingwei Li、Carol A. Fierke、Chien‐Te K. Tseng、Shiqing Xu、Wenshe Ray Liu

  DOI：10.1002/cmdc.202000924

  日期：2021.3.18

  to seven inhibitors indicated both formation of a covalent bond with C145 and structural rearrangement from the apoenzyme to accommodate the inhibitors. Virus inhibition assays revealed that several inhibitors have high potency in inhibiting the SARS‐CoV‐2‐induced cytopathogenic effect in both Vero E6 and A549/ACE2 cells. Two inhibitors, MPI5 and MPI8, completely prevented the SARS‐CoV‐2‐induced cytopathogenic

  COVID-19 病原体 SARS-CoV-2 需要其主要蛋白酶 (SC2M Pro ) 消化其两个翻译的长多肽，以形成许多对病毒复制和发病机制至关重要的成熟蛋白质。抑制这一重要的蛋白水解过程可有效防止病毒在受感染的细胞中复制，因此提供了一种潜在的 COVID-19 治疗选择。以以往关于SARS-CoV-1主要蛋白酶（SC1M Pro）的药物化学研究为指导，我们设计并合成了一系列含有β-（S-2-oxopyrrolidin-3-yl）-丙氨酸（Opal）的SC2M Pro抑制剂用于与 SC2M Pro活性位点半胱氨酸 C145形成可逆共价键。所有抑制剂都显示出高效力K i值等于或低于 100 nM。最有效的化合物 MPI3 的K i值为 8.3 nM。SC2M Pro的晶体学分析与七种抑制剂结合表明与C145形成共价键和脱辅基酶的结构重排以适应抑制剂。病毒抑制试验表明，几种抑制剂在抑制 Vero
• Protease inhibitors
  申请人：Yang Syaulan

  公开号：US20050143319A1

  公开（公告）日：2005-06-30

  This invention relates to treating an infection with a virus using protease inhibitors. Examples of the protease inhibitors include compounds of formula (I). Each variable is defined in the specification.

  这项发明涉及使用蛋白酶抑制剂治疗病毒感染。蛋白酶抑制剂的示例包括公式(I)的化合物。每个变量在说明书中有定义。
• Improved synthesis of rupintrivir
  作者：DaiZong Lin、WangKe Qian、Rolf Hilgenfeld、HuaLiang Jiang、KaiXian Chen、Hong Liu

  DOI：10.1007/s11426-011-4478-5

  日期：2012.6

  An improved synthesis of rupintrivir (AG7088) was accomplished using three amino acids (l-glutamic acid, d-4-fluorophenylalanine, and l-valine) as the building blocks. The key fragment ketomethylene dipeptide isostere was constructed with the valine derivative and phenylpropionic acid derivative, followed by coupling with a lactam derivative and an isoxazole acid chloride to provide AG7088 totally in eight steps.

  对rupintrivir (AG7088) 的改进合成使用了三种氨基酸（l-谷氨酸、d-4-氟苯丙氨酸和l-缬氨酸）作为构建块。关键片段酮亚甲基二肽异构体通过缬氨酸衍生物和苯丙酸衍生物的构建而成，随后与内酰胺衍生物和异恶唑酸氯化物偶联，最终在八个步骤中合成出AG7088。
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATMENT OF CORONAVIRUS INFECTION<br/>[FR] COMPOSITIONS ET MÉTHODES DE TRAITEMENT D'UNE INFECTION À CORONAVIRUS
  申请人：CORTEXYME INC

  公开号：WO2022066776A1

  公开（公告）日：2022-03-31

  Compounds and methods for the treatment of coronavirus infections are disclosed. Compounds according to Formula I as described herein, containing reactive functional groups for covalent binding to active site residues in target proteases, can be used for treating infection by SARS-CoV-2 and other coronaviruses.

  本文披露了用于治疗冠状病毒感染的化合物和方法。根据本文描述的Formula I的化合物，其中含有可与靶蛋白酶活性位点残基发生共价结合的反应性功能基团，可用于治疗SARS-CoV-2和其他冠状病毒感染。
• Novel CADD-based peptidyl vinyl ester derivatives as potential proteasome inhibitors
  作者：Ke Mou、Bo Xu、Chao Ma、Xiaoming Yang、Xiaomin Zou、Yang Lü、Ping Xu

  DOI：10.1016/j.bmcl.2007.12.077

  日期：2008.3

  A series of peptidyl vinyl ester derivatives bearing three different P1 substitutions as potential proteasome inhibitors were studied. The target molecules were designed based on CADD (computer aided drug design) protocol and synthesized. Their activities toward proteasome and four human cancer cell lines (including hepatoma cell line (Bel-7402), myeloid leukemic cell line (HL-60), gastric cancer cell

  研究了一系列带有三个不同的P1取代基的肽基乙烯基酯衍生物，它们是潜在的蛋白酶体抑制剂。根据CADD（计算机辅助药物设计）协议设计目标分子并进行合成。它们对蛋白酶体和四种人类癌细胞系（包括肝癌细胞系（Bel-7402），髓样白血病细胞系（HL-60），胃癌细胞系（BGC-823）和鼻咽癌细胞系（KB））的活性为使用荧光测定法测试。两种化合物对蛋白酶体具有抑制活性，而四种化合物对HL-60和BGC-823的抗增殖活性较弱。