3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-O⁶-[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]-2'-deoxyguanosine | 150884-25-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-O⁶-[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]-2'-deoxyguanosine
• 英文别名: 3',5'-bis-O-TBDMS 2'-deoxyguanosine O⁶-mesitylenesulfonate；2-amino-6-mesitylsulfonoxy-9-[3',5'-bis(t-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyribosyl]purine；[2-amino-9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl] 2,4,6-trimethylbenzenesulfonate
• CAS: 150884-25-6
• 化学式: C₃₁H₅₁N₅O₆SSi₂
• 分子量: 678.013
• InChiKey: CMHWWKXQDNEHBQ-RBZQAINGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.8
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-O⁶-[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]-2'-deoxyguanosine 在 三乙烯二胺 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 beta-胸苷 作用下， 以 四氢呋喃 、 aq. phosphate buffer 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 2'-脱氧鸟苷
  参考文献：
  名称：

  2'-脱氧鸟苷-N1-基自由基的独立生成和反应性。

  摘要：

  2'-脱氧鸟苷-N 1-基（dG（N 1 -H）•）是2'-脱氧鸟苷（dG）（最容易氧化的天然核苷）的热力学上优选的单电子氧化产物。dG（N 1 -H）•是通过dG羟基自由基加合物的正式脱水以及相应自由基阳离子的去质子化而产生的。dG（N 1 -H）•是由于电离辐射的间接和直接作用以及其他DNA破坏剂而形成的。dG（N 1 -H）•是从N中以光化学方式产生的（λmax = 350 nm）-芳氧基-萘二甲酰亚胺前体（3）。3的光化学转化的量子产率为〜0.03，在O 2存在下显着降低，表明键断裂从三重激发态发生。dG在过量的β-巯基乙醇存在下定量形成。在不存在还原剂的情况下，dG（N 1 -H）•会被3氧化，从而使dG的收率降至约50％。加入8-氧代-7,8-二氢-2'-脱氧鸟苷（8-oxodGuo）作为牺牲性还原剂可定量获得dG和8-氧代Gugu的两电子氧化产物。N-芳氧基萘二甲酰亚胺3是dG（N

  DOI：

  10.1021/acs.joc.0c01095
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧鸟苷 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 生成 3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-O⁶-[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  DESIGN OF HIGHLY EFFICIENT AND SELECTIVE TRANSFER REACTION OF NITROSYL GROUP TO dC AND d^MC RESULTING IN SPECIFIC DEAMINATION

  摘要：

  Nitric oxide (NO) is an important endogenous regulatory molecule, and S-nitrosothiols are believed to play a significant role in NO storage, transport, and delivery. Based on the ability to generate NO in vivo, S-nitrosothiols can be used as therapeutic drugs. In this study, we have developed an innovative method for sequence- and base-specific delivery of NO to a specific site of DNA followed by specific deamination.

  DOI：

  10.1081/ncn-200060312

文献信息

• Influence of Biaryl Phosphine Structure on C−N and C−C Bond Formation
  作者：Ramendra Pratap、Damon Parrish、Padmaja Gunda、D. Venkataraman、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1021/ja902679b

  日期：2009.9.2

  phosphine ligands affect Pd-catalyzed C-N and C-C bond-forming reactions, a new ligand, 2-(dicyclohexylphosphino)-4'-(N,N-dimethylamino)-1,1'-biphenyl, was synthesized. This compound is isomeric with the commercially available 2-(dicyclohexylphosphino)-2'-(N,N-dimethylamino)-1,1'-biphenyl that has been useful in C-N bond-forming reactions of nucleosides. The new p-dimethylamino biphenyl ligand bears

  为了了解联苯膦配体的电子和其他结构特征如何影响 Pd 催化的 CN 和 CC 键形成反应，一种新的配体，2-(二环己基膦)-4'-(N,N-二甲氨基)-1,1 '-联苯，合成。该化合物与市售的 2-(二环己基膦基)-2'-(N,N-二甲氨基)-1,1'-联苯异构，后者已用于核苷的 CN 键形成反应。新的对二甲氨基联苯配体与邻二甲氨基异构体具有电子相似性，但它也具有与 2-（二环己基膦基）联苯的结构相似性，例如非膦环中未取代的邻位。而 2-（二环己基膦基）联苯可以支持形成 CC 键的催化剂，它不能有效地促进核苷底物的芳基胺化。然而，新的配体被证明可以有效地促进核苷底物的芳基胺化和 CC 键形成反应，一些反应甚至在室温下发生。因此，这种新配体的复合结构元素被认为是由它衍生的催化系统反应性的标准。我们已经通过 X 射线晶体学分析探测了异构 N，N-二甲氨基联苯配体的结构。已通过 (31) P 核磁共振研究了两种配体与
• Facile Cu-free Sonogashira cross-coupling of nucleoside C-6 arylsulfonates with terminal alkynes
  作者：Felix N. Ngassa、Jamie M. Gomez、Brandon E. Haines、Michael J. Ostach、Jared W. Hector、Lindsay J. Hoogenboom、Chelsea E. Page

  DOI：10.1016/j.tet.2010.08.032

  日期：2010.10

  The combination of PdCl2[CH3CN]2 with XPhos is an efficient catalytic system for the Sonogashira-type cross-coupling of 2′-deoxyguanosine O6-arylsulfonates with terminal alkynes. The reactions generally proceed under mild conditions requiring no Cu co-catalyst to give the corresponding C-6-alkynylated deoxynucleosides in moderate to good yields.

  PdCl 2 [CH 3 CN] 2与XPhos的结合是2'-脱氧鸟苷O 6-芳基磺酸盐与末端炔烃的Sonogashira型交叉偶联的有效催化体系。反应通常在温和的条件下进行，不需要Cu助催化剂以中等至良好的产率得到相应的C-6-炔基化的脱氧核苷。
• Mild and Room Temperature C−C Bond Forming Reactions of Nucleoside C-6 Arylsulfonates
  作者：Mahesh K. Lakshman、Padmaja Gunda、Padmanava Pradhan

  DOI：10.1021/jo0513764

  日期：2005.12.1

  Palladium catalyzed cross coupling of nucleoside arylsulfonates and arylboronic acids has been accomplished under mild conditions and at room temperature. Among three structurally similar ligands that differ in their steric and electronic properties, one yielded an effective catalyst in conjunction with Pd(OAc)2. Of the nucleoside arylsulfonates evaluated, the O6-(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonate proved

  钯催化的核苷芳基磺酸盐和芳基硼酸的交叉偶联已在温和条件和室温下完成。在三种结构相似，空间和电子性质不同的配体中，一个配体与Pd（OAc）2结合产生了一种有效的催化剂。在所评估的核苷芳基磺酸盐中，O 6-（2,4,6-三甲基苯基）磺酸盐被证明是最佳的，但其他烷基和烷氧基衍生物也具有合理的反应性。另一方面，2-硝基苯基和2-噻吩基衍生物是无效的底物。PhMe和THP适合用作溶剂，尽管在PhMe中某些芳基硼酸的反应更快，但在某些情况下仍能获得良好的结果。相反，带有强吸电子基团的芳基硼酸的反应在THP中更成功地进行。包括核苷芳基磺酸盐上的取代基，配体取代基和溶剂在内的几种因素之间的相互作用是成功进行交叉偶联的原因。使用31 P NMR进行了初步研究，以研究Pd（OAc）2的相互作用与配体。在配体和Pd（OAc）2的化学计量比为1：1的情况下，获得了主要物质，可能是环palpalladation的产
• Nucleoside and DNA Adducts from <i>N</i>-Nitrosotolazoline
  作者：Richard N. Loeppky、Jianzheng Shi

  DOI：10.1021/tx700323k

  日期：2008.2.1

  the detection of 2-phenylacetamidoethyl adducts (adduct, relative %): 7-Gua, 60%; 3-Ade, 30%; O6-Gua, 8%; and 7-Ade, 2%. Comparison of these data with appropriate literature data, as well as our work on the mechanism of N-nitrosotolazoline hydrolytic decomposition, is consistent with the adducts being produced from a 2-phenylacetamidoethyldiazonium intermediate. The results show that N-nitrosotolazoline

  代表性的咪唑啉受体药物托拉唑啉的亚硝化产物N-亚硝基偶氮唑啉与DNA，脱氧鸟苷（dG）或脱氧腺苷（dA）的反应生成包含2-苯基乙酰氨基乙基的加合物。2-苯基乙酰氨基乙基鸟嘌呤衍生物（O6-dG，O6-Gua，N2-Gua和7-Gua）和2-苯基乙酰氨基乙基腺嘌呤衍生物（1-Ade，3-Ade，7-Ade和N6-说明）。除了使用已建立的紫外光谱法确认烷基腺嘌呤的结构外，还提出了一种新的13C NMR方法来确定N-烷基化位点。结合合成的标准品，使用HPLC MS / MS方法确定所生成加合物的性质和数量。N-亚硝基偶氮唑啉与dG反应生成7-（2-苯基乙酰氨基乙基）脱氧鸟苷（主要），O6-（2-苯基乙酰氨基乙基）脱氧鸟苷和5'-O-苯基乙酰基脱氧鸟苷。N-亚硝基偶氮唑啉与dA的反应产生了1-，3-，7-，N6和5-O'-2-苯基乙酰胺基乙基腺嘌呤和dA衍生物以及几种苯基乙酰基加合物。N-亚硝基偶
• Photolabile N-hydroxypyrid-2(1H)-one derivatives of guanine nucleosides: a new method for independent guanine radical generation
  作者：Panagiotis Kaloudis、Cecilia Paris、Despoina Vrantza、Susana Encinas、Raul Pérez-Ruiz、Miguel A. Miranda、Thanasis Gimisis

  DOI：10.1039/b909138f

  日期：——

  variety of methods have been utilized for the abstraction of a single electron from the guanine moiety. In this study, an alternative approach for the site specific, independent generation of the guanine radical, utilizing N-hydroxypyrid-2(1H)-one as a photolabile modifier of guanine, is proposed. Novel photolabile 6-[(1-oxido-2-pyridinyl)oxo]-6-deoxy- and 2′,6-dideoxy-guanosine derivatives capable of

  一电子氧化 鸟嘌呤壳聚糖是在DNA中氧化产生的损伤的形成中的重要反应中间体，并且已采用多种方法从鸟嘌呤部分提取单个电子。在这项研究中，利用鸟嘌呤基团的位点特异性，独立生成的另一种方法是利用N-羟基吡啶-2（1 H）-one 作为...的光不稳定改性剂 鸟嘌呤，建议。新型光不稳定6-[（1-氧化-2-吡啶基）氧代] -6-脱氧- 和 2'，6-二脱氧鸟苷 能够产生中性的衍生物 鸟嘌呤 激进的 （G（-H）˙）经光解合成并表征。的一代G（-H）˙ 通过N–O键的均相分解可以继续进行，并通过连续的光解产物分析和捕集研究以及激光闪光光解实验得到了证实。