9-(2-deoxy-2-fluoro-β-D-arabinofuranosyl)adenine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-(2-deoxy-2-fluoro-β-D-arabinofuranosyl)adenine
• 英文别名: 2'-deoxy-2'-fluoro-9-β-D-arabinofuranosyladenine；(2R,3R,4S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-fluoro-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol；9-(2-Deoxy-2-fluoro-beta-d-arabinofuranosyl)adenine；(2R,3R,4S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-fluoro-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• 化学式: C₁₀H₁₂FN₅O₃
• 分子量: 269.235
• InChiKey: ZGYYPTJWJBEXBC-GQTRHBFLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-(2-deoxy-2-fluoro-β-D-arabinofuranosyl)adenine 在 sodium nitrite 作用下， 以 溶剂黄146 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 9-(2-脱氧-2-氟-beta-D-阿拉伯呋喃糖基)-1,9-二氢-6H-嘌呤-6-酮
  参考文献：
  名称：

  核苷。CXXXV。一些9-（2-脱氧-2-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基）-9H-嘌呤的合成及其生物学活性。

  摘要：

  合成了含有2'-脱氧-2'-氟-β-D-阿拉伯呋喃糖基部分的七个嘌呤核苷，并测试了它们的抗肿瘤活性。3-O-乙酰基-5-O-苯甲酰基-2-脱氧-2-氟-D-阿拉伯呋喃糖基溴化物（1）与N6-苯甲酰腺嘌呤在CH2Cl2中的直接缩合，然后将产物皂化，得到腺嘌呤核苷（I，2 -F-ara-A）。用HOAc中的NaNO 2脱除I，得到次黄嘌呤类似物（II，2'-F-ara-H）。通过汞法将1与6-氯嘌呤缩合，然后进行硫脲处理和产物皂化，制备6-硫嘌呤核苷（III，2'-F-ara-6MP）。III的甲基化得到6-SCH3类似物（IV）。III的阮内镍脱硫得到未取代的嘌呤核苷（V，2'-F-ara-P）。通过甲硅烷基方法将1-与2-乙酰氨基-6-氯嘌呤缩合，得到被保护的2-乙酰氨基-6-氯嘌呤核苷，其可用作鸟嘌呤和6-硫代鸟嘌呤核苷的前体（VI，2'-F-ara- G和VII，分别为2'-F-ara

  DOI：

  10.1248/cpb.37.336
• 作为产物：
  描述：

  克罗拉滨 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 48.0h， 以57%的产率得到9-(2-deoxy-2-fluoro-β-D-arabinofuranosyl)adenine
  参考文献：
  名称：

  发现新型嘌呤核苷衍生物作为磷酸二酯酶2（PDE2）抑制剂：基于结构的虚拟筛选，优化和生物学评估

  摘要：

  磷酸二酯酶2（PDE2）已被广泛用于中枢神经系统（CNS）疾病和肺动脉高压的潜在治疗。在本文中，我们 通过基于结构的虚拟筛选和生物测定法确定了FDA批准的药物clofarabine （4）具有潜在的PDE2抑制活性（IC 50 = 3.12± 0.67μM ）。考虑PDE2，一系列基于结构和结合模式嘌呤核苷衍生物的潜在治疗益处4设计，合成并评价，这导致最佳的化合物的发现14E与抑制效力的显著改善（IC 50 = 0.32±0.04μM）。进一步的分子对接和分子动力学（MD）模拟研究表明，14e的5'-苄基可通过与Leu770，Thr768，Thr805和Leu809等疏水残基形成额外的范德华相互作用，从而与PDE2的独特疏水口袋相互作用。可能有助于增强其对PDE2的抑制作用。本文报道的这些潜在化合物以及有价值的构效关系（SAR）可能为进一步开发有效的PDE2抑制剂带来重要指导。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2017.11.022

文献信息

• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR DELIVERY OF THERAPEUTIC AGENTS<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS PERMETTANT D'ADMINISTRER DES AGENTS THÉRAPEUTIQUES
  申请人：MODERNATX INC

  公开号：WO2017099823A1

  公开（公告）日：2017-06-15

  This disclosure provides improved lipid-based compositions, including lipid nanoparticle compositions, and methods of use thereof for delivering agents in vivo including nucleic acids and proteins. These compositions are not subject to accelerated blood clearance and they have an improved toxicity profile in vivo.

  这项披露提供了改进的基于脂质的组合物，包括脂质纳米粒子组合物，以及它们用于体内传递药剂的方法，包括核酸和蛋白质。这些组合物不受加速血清清除的影响，并且它们在体内具有改进的毒性特性。
• [EN] MODIFIED NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF<br/>[FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE MODIFIÉES ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：MODERNA THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2014093924A1

  公开（公告）日：2014-06-19

  The present disclosure provides modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and methods of using them.

  本公开提供了经修改的核苷、核苷酸和核酸，以及它们的使用方法。
• Syntheses of 2′-deoxy-2′-fluoro-β-d-arabinofuranosyl purine nucleosides via selective glycosylation reactions of potassium salts of purine derivatives with the glycosyl bromide
  作者：Grigorii G. Sivets

  DOI：10.1016/j.tetlet.2015.11.091

  日期：2016.1

  Syntheses of 9-(2-deoxy-2-fluoro-β-d-arabinofuranosyl)-guanine (1) and -adenine (2) were accomplished from readily available 1,3,5-tri-O-benzoyl-2-deoxy-2-fluoro-α-d-arabinofuranose (3). A new and efficient approach for the synthesis of 1-α-bromide was developed using the mild bromination of α-1-O-benzoate (3). Selective coupling reactions of the bromosugar with purine potassium salts followed by derivatization/and

  9-（2-脱氧-2-氟-β - d-阿拉伯呋喃糖基）-鸟嘌呤（1）和-腺嘌呤（2）的合成是由容易获得的1,3,5-三-O-苯甲酰基-2-脱氧完成的-2-氟-α - d-阿拉伯呋喃糖（3）。利用α-1- O-苯甲酸酯的轻度溴化作用，开发了一种新的高效合成1-α-溴化物的方法（3）。溴糖与嘌呤钾盐的选择性偶联反应，然后对中间体封闭的2'-氟β-阿拉伯糖核苷进行衍生化和/或去保护，导致形成具有高总收率的目标化合物。
• 6-叔丁基-8-二苯基磷氧基-2′-氟阿糖嘌呤核苷及其制备方法和应用
  申请人：新乡学院

  公开号：CN105399789A

  公开（公告）日：2016-03-16

  本发明提供了6-叔丁基-8-二苯基磷氧基-2′-氟阿糖嘌呤核苷的制备方法及应用。发明人在大量的化合物合成和活性筛选中发现，6-叔丁基-8-二苯基磷氧基-2′-氟阿糖嘌呤核苷具有很好的抗HL-60细胞活性。这种化合物的结构式如式I：同时，我们对其合成方法也进行了研究。解决了现有的合成方法存在着步骤多、收率低、操作繁琐等缺点，如：(1)金属催化偶联反应；(2)6-氢嘌呤核苷的自由基反应。这两类方法均使用到过渡金属催化剂(如钯、镍、钌等)或者难以获得的原料(如格利雅试剂、有机锌试剂等)。同时提供一种高效的6-叔丁基-8-二苯基磷氧基-2′-氟阿糖嘌呤核苷的方法。
• Role of the stereochemistry of 3′-fluoro-3′-deoxy analogues of 2-5A in binding to and activation of mouse RNase L
  作者：Elena N. Kalinichenko、Tatjana L. Podkopaeva、Nicolai E. Poopeiko、Merike Kelve、Mart Saarma、Igor A. Mikhailopulo、Jacquelien E. van den Boogaart、Cornelis Altona

  DOI：10.1002/recl.19951140202

  日期：——

  with p3(A2′p)3A3′[32P]pC3′p for binding to RNase L in L929 cell extracts, and (ii) to activate the partially purified RNase L from L929 cell extracts to hydrolyze poly(U)[3H], was compared to that of the related 3′-deoxy analogue [Torrence et al., J. Biol. Chem. 263, 1131 (1988)] and the parent trimer, p3A3, using radiobinding and RNase L-(2′,5′)pentaadenylate(core)-agarose assays, respectively. Evidence

  两套2-5A类似物的三聚体的含9-（3-氟-3-脱氧β-d木-呋喃糖基）腺嘌呤（A合成˚F）或3'-氟-3'-脱氧腺苷（A ˚F）描述了在链的不同位置上的）以及相应的5'-单磷酸盐和5'-二磷酸化（核心）三聚体的制备。2-5A（i）的每个核糖和木糖异构体对的氟脱氧类似物与p 3（A2'p）3 A3'[ 32 P] pC3'p竞争结合L 929细胞提取物中RNase L的能力，和（ii）从L 929激活部分纯化的RNase L将用于水解聚（U）[ 3 H]的细胞提取物与相关的3'-脱氧类似物[ Torrence等人，J。化学 263，1131（1988）]和三聚体母体，第3阿3，分别使用radiobinding和RNase L-（2'，5'）pentaadenylate（芯） -琼脂糖测定，。证据表明三聚体的立体化学起着重要作用，特别是在第二步过程中。最惊人的发现是，与2-5A相比，p 3 A（A