6-amino-2-chloro-9-(2'-deoxy-2'-fluoro-3',5'-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-9H-purine | 355138-50-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 6-amino-2-chloro-9-(2'-deoxy-2'-fluoro-3',5'-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-9H-purine
• 英文别名: 2-chloro-9-(3',5'-di-O-benzoyl-2'-deoxy-2'-fluoro-β-D-arabinofuranosyl)adenine；2-Chloro-9-(2-deoxy-2-fluoro-3,5-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-9H-purin-6-amine；2-chloro-9-(3',5'-di-O-benzoyl-2'-deoxy-2'-fluoro-β-D-arabinofuranosyl)-adenine；[(2R,3R,4S,5R)-5-(6-amino-2-chloropurin-9-yl)-3-benzoyloxy-4-fluorooxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 355138-50-0
• 化学式: C₂₄H₁₉ClFN₅O₅
• 分子量: 511.897
• InChiKey: DAPNQNURTIIUNF-VWFIUDSGSA-N

物化性质

• 熔点：
  159-162 °C
• 沸点：
  659.6±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.58±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于乙腈、氯仿、甲醇

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-amino-2-chloro-9-(2'-deoxy-2'-fluoro-3',5'-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-9H-purine 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 5.0h， 以64%的产率得到克罗拉滨
  参考文献：
  名称：

  氯法拉滨工艺中杂质和降解物的分离，合成和表征

  摘要：

  介绍了氯法拉滨工艺杂质的鉴定及其随后的分离，合成和表征。发现了由氟代阿拉伯糖的N 6-附着至氯法拉滨产生的两种异构过程杂质。还合成并表征了与工艺杂质不同的氯法拉滨的碱降解产物。这些化合物是由糖部分，嘌呤环或两者的修饰产生的。提供了用于形成各种工艺杂质和降解产物的机械原理。

  DOI：

  10.1021/op800182x
• 作为产物：
  描述：

  9-Trimethylsilyl-2,6-dichlorpurin 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 氨 作用下， 以 乙二醇二甲醚 、 乙腈 为溶剂， 反应 72.33h， 生成 6-amino-2-chloro-9-(2'-deoxy-2'-fluoro-3',5'-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-9H-purine
  参考文献：
  名称：

  Oligonucleotides Containing 9-(2-Deoxy-2-Fluoro-β-D-Arabinofuranosyl)-Adenine and -Guanine: Synthesis, Hybridization and Antisense Properties

  摘要：

  Synthesis of 9-(2-deoxy-2-fluoro-beta -D-arabinofuranosyl)-adenine (7, ara-A(2'F)) and -guanine (12, ara-G(2'F)) was accomplished via the condensation of 2,6-dichloropurine (1) with 2-deoxy-2-fluoro-1,3,5-tri-O-benzoyl-alpha -D-arabinofuranose (2) as a key chemical step. Condensation of silylated N-6-benzoyladenine (6) with 2 gave, after deblocking and chromatographic separation, ara-A(2'F) (7) (14%), it's alpha -anomer 8 (14%) and N-7-alpha -isomer 9 (25%). The PSEUROT analysis of N-9-beta -D-arabinosides 7 and 12 manifested slight preference for the S rotamer (64%) for the former, and an equal population of the N and S rotamers for the latter. The arabinosides 7 and 12 were used for the preparation of the respective phosphoamidite building blocks 13 and 14 for automated oligonucleotide synthesis. Four 15-mer oligonucleotides (ONs) complementary to the initiation codon region of firefly luciferase mRNA were prepared: unmodified 2'-deoxy-ON (AS1) and containing (i) ara-A(2'F) instead of the only A (AS2), (ii) ara-G(2'F) vs. 3-G from the 5'-terminus (AS3), and (iii) both arabinosides at the same positions (AS4). All these ONs display practically the same (i) affinity to both complementary DNA and RNA, and (ii) ability to inhibit a luciferase gene expression in a cell-free transcription-translation system.

  DOI：

  10.1080/15257770008045466

文献信息

• METHOD FOR THE SYNTHESIS OF CLOFARABINE
  申请人：SYNBIAS PHARMA AG

  公开号：US20170044204A1

  公开（公告）日：2017-02-16

  The present invention relates to a method for the high yield production of the anticancer nucleoside clofarabine, the method comprising the preparation of 2-chloroadenosine by enzymatic transglycosylation between 2-chloroadenine and nucleosides, benzoylation, isomerization, sulfonate ester formation, fluorination, and deprotection.

  本发明涉及一种高产抗癌核苷类药物克洛法滨的生产方法，该方法包括通过酶促转糖基反应在2-氯腺苷和核苷类化合物之间制备2-氯腺苷，然后进行苯甲酰化、异构化、磺酸酯形成、氟化和去保护等步骤。
• Preparation of 2-chloro-9-(2'-deoxy-2'-fluoro-Beta-D-arabinofuranosyl)-adenine
  申请人：Henschke Julian Paul

  公开号：US20120010397A1

  公开（公告）日：2012-01-12

  A process for making clofarabine comprising: fluorinating a compound of formula VII wherein each R 4 is independently a hydroxy protecting group, OR 6 is a leaving group, with a fluorinating agent in the presence of guanidine carbonate to give a compound of formula VIII: wherein R 4 is as defined above; and deprotecting the compound of formula VIII to give the clofarabine.

  制备克洛法宾的过程包括：在氰基碳酸盐存在下，用氟化剂氟化化学式VII的化合物，其中每个R4分别是一个羟基保护基，OR6是一个脱离基，以得到化学式VIII的化合物：其中R4如上定义；然后去保护化学式VIII的化合物以获得克洛法宾。
• 一种氯法拉滨的合成方法
  申请人：武汉百科药物开发有限公司

  公开号：CN106397518B

  公开（公告）日：2019-05-17

  本发明公开了一种氯法拉滨的合成方法，合成路线如下：式Ⅲ和式Ⅳ中，R1和R2为相同或不同的酰基基团；包括如下步骤：1)氨化：将式Ⅲ化合物溶于有机溶剂中，通入氨气，密闭反应，反应完毕后得式Ⅳ化合物；其中所述有机溶剂为乙腈、乙酸乙酯、二氯甲烷和四氢呋喃中的一种或其两种以上任意组合，氨气溶于所述有机溶剂中的浓度为0.1～20wt％，密闭反应时间为10～40小时，反应温度为0～100℃；2)脱保护基：取步骤1)制得的式Ⅳ化合物溶于醇中，加入醇钠的醇溶液，反应后，调节pH值至6～7，冷却结晶，即得氯法拉滨粗品。
• Stereoselective synthesis of 2′-modified nucleosides by using ortho-alkynyl benzoate as a gold(<scp>i</scp>)-catalyzed removable neighboring participation group
  作者：Haixin Ding、Chuang Li、Yirong Zhou、Sanguo Hong、Ning Zhang、Qiang Xiao

  DOI：10.1039/c6ra27790j

  日期：——

  In the present paper, we report a novel strategy for highly efficient stereoselective synthesis of 2′-modified nucleosides by using ortho-alkynyl benzoate as neighboring participation group. Subsequently, ortho-alkynyl benzoate can be removed smoothly in the presence of 5 mol% Ph3PAuCl–AgOTf in dichloromethane with H2O (1 eq.) and ethanol (6 eq.) to afford 2′-OH nucleosides in high yields and selectivity

  在本文中，我们报告了一种新的策略，该方法通过使用邻炔基苯甲酸酯作为邻域参与基团来高效立体选择性合成2'-修饰的核苷。随后，可以在含有5 mol％Ph 3 PAuCl-AgOTf的二氯甲烷中，以H 2 O（1当量）和乙醇（6当量）存在下，平稳地除去邻炔基苯甲酸，以高收率得到2'-OH核苷和选择性。
• 一种绿色合成氯法拉滨医药中间体的方法
  申请人：扬州工业职业技术学院

  公开号：CN109320567A

  公开（公告）日：2019-02-12

  本发明涉及一种绿色合成氯法拉滨医药中间体的方法，具体包括如下步骤：将式II化合物溶于有机溶剂中，冰浴下加入40％的氢溴酸、四丁基氟化铵，搅拌反应3小时后，加入三乙胺三氢氟酸盐，继续搅拌反应2‑3小时，即得式I化合物。