1-甲基-N-Fmoc-色氨酸 | 1334509-86-2

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 色氨酸类衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: 1-甲基-N-Fmoc-色氨酸
• 中文别名: N-[芴甲氧羰基]-1-甲基-L-色氨酸；Fmoc-1-甲基-L-色氨酸
• 英文名称: Fmoc-1-Me-Trp-OH
• 英文别名: Fmoc-L-Trp(N-Me)-OH；(S)-2-(((9H-Fluoren-9-YL)methoxy)carbonylamino)-3-(1-methyl-1H-indol-3-YL)propanoic acid；(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-(1-methylindol-3-yl)propanoic acid
• CAS: 1334509-86-2
• 化学式: C₂₇H₂₄N₂O₄
• 分子量: 440.499
• InChiKey: GDPXIUSEXJJUGT-DEOSSOPVSA-N

物化性质

• 熔点：
  >160°C (dec.)
• 沸点：
  699.7±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.30±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于DMSO（少许）、甲醇（少许）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  80.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

应用广泛，N-芴甲氧羰基-1-甲基-L-色氨酸是一种有机合成中间体和医药中间体，主要用于实验室研发及化工生产过程。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-甲基-N-Fmoc-色氨酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 四(三苯基膦)钯 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N-甲基苯胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.5h， 生成 O-(Nα-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-1-methyl-L-tryptophyl)-N-((S)-2-azido-4-(tert-butoxy)-4-oxobutanoyl)-L-threonylglycine
  参考文献：
  名称：

  Methylation of Daptomycin Leading to the Discovery of Kynomycin, a Cyclic Lipodepsipeptide Active against Resistant Pathogens

  摘要：

  Increased usage of daptomycin to treat infections caused by Gram-positive bacterial pathogens has resulted in emergence of resistant mutants. In a search for more effective daptomycin analogues through medicinal chemistry studies, we found that methylation at the nonproteinogenic amino acid kynurenine in daptomycin could result in significant enhancement of antibacterial activity. Termed "kynomycin," this new antibiotic exhibits higher antibacterial activity than daptomycin and is able to eradicate methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) strains, including dapto-mycin-resistant strains. The improved antimicrobial activity of kynomycin was demonstrated in in vitro time-killing assay, in vivo wax worm model, and different mouse infection models. The increased antibacterial activity, improved pharmacokinetics, and lower cytotoxicity of kynomycin, compared to daptomycin, showed the promise of the future design and development of next-generation daptomycin-based antibiotics.

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b01957
• 作为产物：
  描述：

  N-叔丁氧羰基-L-色氨酸 在 potassium tert-butylate 、 sodium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 、 甲苯 为溶剂， 反应 23.17h， 生成 1-甲基-N-Fmoc-色氨酸
  参考文献：
  名称：

  逆γ-转角肽：Segetalin A Indole Hemiminal 的合成与分析

  摘要：

  用肽键取代亚胺将肽的不可逆大环化转变为可逆过程。由于相应的线性肽醛具有较高的反应性，因此可以通过醛和亚胺之间的平衡来分析线性肽的固有环化趋势。segetalin A 醛的色氨酸侧链形成 12 元环状吲哚半胺醛，而不是预期的 18 元大环亚胺。在此，我们分析了这种不常见的半缩氨酸，表明环肽的生物合成不一定基于具有高固有大环内酰胺化趋势的线性前体肽。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201501179

文献信息

• Selective Substrates and Activity-Based Probes for Imaging of the Human Constitutive 20S Proteasome in Cells and Blood Samples
  作者：Wioletta Rut、Marcin Poręba、Paulina Kasperkiewicz、Scott J. Snipas、Marcin Drąg

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b00026

  日期：2018.6.28

  the HyCoSuL approach, we designed and synthesized novel and selective fluorogenic substrates for each of these three constitutive 20S proteasome activities and applied them to assess inhibition of proteasome subunits by MG-132 and a clinically used inhibitor bortezomib. Our results confirm the utility of designed substrates in biochemical assays. Furthermore, selective peptide sequences obtained in this

  蛋白酶体是维持蛋白质稳态的关键酶复合物。蛋白酶体功能紊乱导致包括癌症，自身免疫和神经退行性疾病在内的病理。因此，蛋白酶体构成药物开发的极好的分子靶标。在这里，我们使用HyCoSuL方法为这三个20S组成型蛋白酶体活性中的每一个设计和合成了新颖的选择性荧光底物，并将它们应用于评估MG-132和临床使用的硼替佐米对蛋白酶体亚基的抑制作用。我们的结果证实了设计的底物在生化分析中的实用性。此外，以此方式获得的选择性肽序列用于构建荧光团标记的基于活性的探针，然后用于同时检测HEK-293F细胞和红细胞裂解液中的每个20S组成型蛋白酶体亚基。总体而言，我们描述了一种简单而快速的方法，可用于测量全血样本中20S组成型蛋白酶体的活性，该方法可以早期诊断与异常上调的蛋白酶体活性有关的病理状态。
• [EN] BICYCLIC PEPTIDE LIGANDS SPECIFIC FOR TSLP<br/>[FR] LIGANDS PEPTIDIQUES BICYCLIQUES SPÉCIFIQUES DE LA TSLP
  申请人：BICYCLETX LTD

  公开号：WO2021205161A1

  公开（公告）日：2021-10-14

  The present invention relates to polypeptides which are covalently bound to molecular scaffolds such that two or more peptide loops are subtended between attachment points to the scaffold. In particular, the invention describes peptides which are high affinity binders of thymic stromal lymphopoietin (TSLP). The invention also includes pharmaceutical compositions comprising said peptide ligands and to the use of said peptide ligands in preventing, suppressing or treating a disease or disorder mediated by TSLP.

  本发明涉及与分子支架共价结合的多肽，使得两个或更多的肽环被支架的附着点夹在其中。具体而言，本发明描述了高亲和力结合到胸腺基质淋巴细胞生成素（TSLP）的肽。本发明还包括包含所述肽配体的药物组合物，以及使用所述肽配体在预防、抑制或治疗由TSLP介导的疾病或紊乱中的用途。
• Synthesis and Activity of Thioether-Containing Analogues of the Complement Inhibitor Compstatin
  作者：Patrick J. Knerr、Apostolia Tzekou、Daniel Ricklin、Hongchang Qu、Hui Chen、Wilfred A. van der Donk、John D. Lambris

  DOI：10.1021/cb2000378

  日期：2011.7.15

  essential for the structural stability and biological activity of many bioactive peptides. However, these bonds are labile to reducing agents, which can limit the therapeutic utility of such peptides. Substitution of a disulfide bond with a reduction-resistant cystathionine bridge is an attractive means of improving stability while imposing minimal structural perturbation to the peptide. We have applied

  二硫键对于许多生物活性肽的结构稳定性和生物活性至关重要。然而，这些键对还原剂不稳定，这会限制这些肽的治疗效用。用抗还原的胱硫醚桥取代二硫键是提高稳定性同时对肽施加最小结构扰动的有吸引力的方法。我们已将这种方法应用于治疗性补体抑制剂坎普他汀，这是一种含二硫键的肽，目前正处于年龄相关性黄斑变性的临床试验中，以努力保持其有效活性，同时提高其生物稳定性。含硫醚的坎普他汀类似物是通过利用正交保护的胱硫醚氨基酸构建块和固体支持的肽环化进行固相肽合成。总体而言，与母体含二硫键的肽相比，这些类似物对其生物靶标的亲和力和补体激活的有效抑制在很大程度上得以保持。因此，硫醚键赋予的对还原稳定性的改善使这种新型坎普他汀肽成为治疗应用的有希望的替代品。此外，这种合成的多功能性允许在各种其他治疗性肽中探索二硫键到硫醚的取代。
• Discovery of a Human Neuromedin U Receptor 1-Selective Hexapeptide Agonist with Enhanced Serum Stability
  作者：Kentaro Takayama、Kenji Mori、Akiko Tanaka、Erina Nomura、Yuko Sohma、Miwa Mori、Akihiro Taguchi、Atsuhiko Taniguchi、Toshiyasu Sakane、Akira Yamamoto、Naoto Minamino、Mikiya Miyazato、Kenji Kangawa、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b00694

  日期：2017.6.22

  Neuromedin U (NMU) activates two NMU receptors (NMUR1 and NMUR2) and is a useful antiobesity drug lead. We report discovery of a hexapeptide agonist, 2-thienylacetyl-Trp1-Phe(4-F)2-Arg3-Pro4-Arg5-Asn6-NH2 (4). However, the NMUR1 selectivity and serum stability of this agonist were unsatisfactory. Through a structure–activity relationship study focused on residue 2 of agonist 4, serum stability, and

  Neuromedin U（NMU）激活两个NMU受体（NMUR1和NMUR2），是一种有用的抗肥胖药。我们报告发现六肽激动剂，2-噻吩基乙酰基-Trp 1 -Phe（4-F）2 -Arg 3 -Pro 4 -Arg 5 -Asn 6 -NH 2（4）。但是，该激动剂的NMUR1选择性和血清稳定性不能令人满意。通过针对激动剂4的残基2 ，血清稳定性和药代动力学特性的结构-活性关系研究，我们在这里报告了抑制小鼠体重增加的新型NMUR1选择性六肽激动剂7b的发现。
• [EN] FLUORESCENTLY LABELED MOLECULES CONTAINING MODIFIED TRYPTOPHAN<br/>[FR] MOLÉCULES MARQUÉES PAR FLUORESCENCE CONTENANT DU TRYPTOPHANE MODIFIÉ
  申请人：SEED RES AND DEV LLC

  公开号：WO2016133913A1

  公开（公告）日：2016-08-25

  The present disclosure relates to new fluorescent molecules that contain N-alkylated or N-acylated tryptophan and do not substantially quench fluorescent labels attached to the molecules, and the use of such molecules in preparing and studying various compounds, such as substrates and inhibitors for assays of enzymes (e.g., caspases, such as caspase-1 which is an important enzyme in inflammation). An enzyme substrate or enzyme inhibitor that contains a modified tryptophan and fluorescent label as disclosed herein can be studied without loss of signal by Förster quenching. By reducing or eliminating this quenching, more useful labeled molecules with improved properties for assay development can be prepared.

  本公开涉及含有N-烷基化或N-酰化色氨酸的新荧光分子，这些分子不会显着猝灭连接到分子上的荧光标记，并且利用这些分子在制备和研究各种化合物（例如用于酶（如半胱氨酸蛋白酶，如炎症中的重要酶半胱氨酸蛋白酶-1）的测定的底物和抑制剂）中的应用。根据本公开的含有经修改的色氨酸和荧光标记的酶底物或酶抑制剂可以通过Förster猝灭进行研究，而不会丢失信号。通过减少或消除这种猝灭作用，可以制备更有用的带标记分子，具有改进的性质用于测定方法的开发。