N-羟基-4-[(1,2,3,4-四氢-2-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-基)甲基]苯甲酰胺 2,2,2-三氟乙酸酯 | 1239262-52-2

• 物质功能分类: 生物化工 - 生化试剂 - 激动剂抑制剂
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: N-羟基-4-[(1,2,3,4-四氢-2-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-基)甲基]苯甲酰胺 2,2,2-三氟乙酸酯
• 中文别名: 盐酸妥巴他汀A；N-羟基-4-[(1,2,3,4-四氢-2-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-基)甲基]苯甲酰胺2,2,2-三氟乙酸酯
• 英文名称: Tubastatin A (trifluoroacetic salt)
• 英文别名: tubastatin A trifluoroacetate salt；N-hydroxy-4-(2-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-pyrido[4,3-b]indol-5-ylmethyl)benzamide trifluoroacetic acid salt；N-Hydroxy-4-((2-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-5(2H)-yl)methyl)benzamide 2,2,2-trifluoroacetate；N-hydroxy-4-[(2-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]benzamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
• CAS: 1239262-52-2
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₂₀H₂₁N₃O₂
• 分子量: 449.43
• InChiKey: AVAOVICSJJIYRZ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 溶解度：
  DMF：5mg/mL； DMSO：5mg/mL； DMSO:PBS (pH 7.2) (1:10)：0.1 mg/ml；乙醇：0.2mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.43
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  94.8
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

制备方法与用途

生物活性

Tubastatin A TFA（三氟乙酸盐）是一种有效的、选择性的HDAC6抑制剂，在无细胞试验中IC50值为15 nM，其对其他同工酶的选择性远高于HDAC6，尤其是HDAC8，后者仅为57倍。Tubastatin A 可促进自噬并增加凋亡。

靶点

Target	Value
HDAC6 (无细胞试验)	15 nM

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-甲基-2,3,4,5-四氢-1H-吡啶并[4,3-b]吲哚 在 盐酸羟胺 、 potassium tert-butylate 、 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 26.25h， 生成 N-羟基-4-[(1,2,3,4-四氢-2-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-基)甲基]苯甲酰胺 2,2,2-三氟乙酸酯
  参考文献：
  名称：

  [EN] HDAC INHIBITORS AND THERAPEUTIC METHODS USING THE SAME
  [FR] INHIBITEURS DE HDAC ET PROCÉDÉS THÉRAPEUTIQUES LES UTILISANT

  摘要：

  公开号：

  WO2011011186A3

文献信息

• Rational Design and Simple Chemistry Yield a Superior, Neuroprotective HDAC6 Inhibitor, Tubastatin A
  作者：Kyle V. Butler、Jay Kalin、Camille Brochier、Guilio Vistoli、Brett Langley、Alan P. Kozikowski

  DOI：10.1021/ja102758v

  日期：2010.8.11

  Structure-based drug design combined with homology modeling techniques were used to develop potent inhibitors of HDAC6 that display superior selectivity for the HDAC6 isozyme compared to other inhibitors. These inhibitors can be assembled in a few synthetic steps, and thus are readily scaled up for in vivo studies. An optimized compound from this series, designated Tubastatin A, was tested in primary cortical neuron cultures in which it was found to induce elevated levels of acetylated a-tubulin, but not histone, consistent with its HDAC6 selectivity. Tubastatin A also conferred dose-dependent protection in primary cortical neuron cultures against glutathione depletion-induced oxidative stress. Importantly, when given alone at all concentrations tested, this hydroxamate-containing HDAC6-selective compound displayed no neuronal toxicity, thus, forecasting the potential application of this agent and its analogues to neurodegenerative conditions.