N2,N2-二甲基鸟苷 | 2140-67-2

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷中间体
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: N2,N2-二甲基鸟苷
• 中文别名: 2-(二甲基氨基)鸟苷
• 英文名称: N2,N2-dimethylguanosine
• 英文别名: m^2,2G；N²,N²-Dimethyl-guanosin；N2,N2-Dimethylguanosine；9-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-(dimethylamino)-1H-purin-6-one
• CAS: 2140-67-2
• 化学式: C₁₂H₁₇N₅O₅
• mdl: MFCD00057049
• 分子量: 311.297
• InChiKey: RSPURTUNRHNVGF-IOSLPCCCSA-N

物化性质

• 熔点：
  249-251°C
• 密度：
  1.83±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于水基（少量），DMSO（少量），甲醇（少量），水（少量，
• 最大波长(λmax)：
  265 (pH 1)；260 (pH 7)；263 (pH 13)
• 物理描述：
  Solid
• 碰撞截面：
  170.6 Ų [M+H]+ [CCS Type: DT, Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.583
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2934999090
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H315,H319,H335
• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

生物活性方面，N2,N2-二甲基鸟苷是一种尿核苷，是tRNA的初级代谢产物。

人类内源性代谢物

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2,N2-二甲基鸟苷 在 三氯氧磷 作用下， 以 various solvent(s) 为溶剂， 反应 4.0h， 以90%的产率得到N,N-dimethylguanosine 5'-phosphate
  参考文献：
  名称：

  Chemical Synthesis of a 5‘-Terminal TMG-Capped Triribonucleotide m₃^2,2,7G^5‘pppAmpUmpA of U1 RNA

  摘要：

  The 5'-terminal TMG-capped triribonucleotide, m(3)(2,2,7)G(5')pppAmpUmpA, has been synthesized by condensation of an appropriately protected triribonucleotide derivative of ppAmpUmpA with a new TMG-capping reagent. During this total synthesis, it was found that the regioselective 2'-O-methylation of 3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-N-(4-monomethoxytrityl)adenosine was achieved by use of MeI/Ag2O without affecting the base moiety. A new route to 2-N,2-N-dimethylguanosine from guanosine via a three-step reaction has also been developed by reductive methylation using paraformaldehyde and sodium cyanoborohydride. These key intermediates were used as starting materials for the construction of a fully protected derivative of pAmpUmpA and a TMG-capping reagent of Im-pm(3)(2,2,7)G. The target TMG-capped tetramer, m(3)(2,2,7)G(5')pppAmpUmpA, was synthesized by condensation of a partially protected triribonucleotide 5'-terminal diphosphate species, pp(AMMTr)mpUmpA, with Im-pm(3)(2,2,7)G followed by treatment with 80% acetic acid. The structure of m(3)(2,2,7)G(5')pppAmpUmpA was characterized by H-1 and P-31 NMR spectroscopy as well as enzymatic assay using snake venom phosphodiesterase, calf intestinal phosphatase, and nuclease P1.

  DOI：

  10.1021/jo952263v
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 在 palladium on activated charcoal 4-二甲氨基吡啶 、 tetrafluoroboric acid 、 四乙基氯化铵 、 氨 、 氢气 、 N,N-二甲基苯胺 、 三乙胺 、 sodium nitrite 、 三氯氧磷 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙腈 、 苯甲醇 为溶剂， 生成 N2,N2-二甲基鸟苷
  参考文献：
  名称：

  Reaction of arylnitrenium ions with guanine derivatives: N¹-methylguanosine and N²,N²-dimethylguanosine

  摘要：

  一项先前的闪光光解研究表明，芳基亚硝基离子与2'-脱氧鸟苷直接反应时产生了第二个中间体，随着瞬态亚硝基离子与核苷反应，这个中间体逐渐增加。这个中间体被确定为亚硝基离子加成到鸟嘌呤的C-8位置形成的产物，在失去C-8质子之前形成的C-8中间体。C-8中间体的一个特征是它存在酸碱形式。这种行为在光谱分析和速率-pH曲线中都很明显，速率-pH曲线显示在pH 4左右出现了从pH无关反应到首级H⁺反应的转变。本研究旨在确定共轭碱形式的结构。这涉及对由2-芴亚硝基离子与N¹-甲基鸟嘌呤和N²,N²-二甲基鸟嘌呤反应产生的C-8中间体衰减的动力学研究。其理论基础是前者无法失去N-1质子，而后者无法在NH₂基团上去质子。速率-pH曲线清楚地显示N-1质子是酸性的。N²,N²-二甲基鸟嘌呤的C-8中间体的速率常数显示与2'-脱氧鸟嘌呤和鸟嘌呤相关的向共轭碱形式转变的下降变化。相比之下，N¹-甲基鸟嘌呤中间体的速率常数与pH无关。还报告了形成C-8中间体的反应速率常数。这些结果表明，芳基亚硝基离子与N²,N²-二甲基鸟嘌呤衍生物的反应速度明显更快（除非反应受扩散控制）。这与芳基亚硝基离子和鸟嘌呤的反应的初始步骤发生在C-8位置的直接加成一致。在这种反应中产生的正电荷可以共轭到C-2位置，π给体如NH₂和NMe₂可以发挥稳定作用。关键词：亚硝基、芳基亚硝基、鸟苷、DNA加合物。

  DOI：

  10.1139/v01-179

文献信息

• [EN] COMPOUNDS, COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIS<br/>[FR] COMPOSÉS, COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE
  申请人：WAVE LIFE SCIENCES LTD

  公开号：WO2018237194A1

  公开（公告）日：2018-12-27

  The present disclosure, among other things, provides technologies for synthesis, including reagents and methods for stereoselective synthesis. In some embodiments, the present disclosure provides compounds useful as chiral auxiliaries. In some embodiments, the present disclosure provides reagents and methods for oligonucleotide synthesis. In some embodiments, the present disclosure provides reagents and methods for chirally controlled preparation of oligonucleotides. In some embodiments, technologies of the present disclosure are particularly useful for constructing challenging internucleotidic linkages, providing high yields and stereoselectivity.

  本公开内容提供了合成技术，包括用于立体选择性合成的试剂和方法。在某些实施例中，本公开内容提供了作为手性辅助剂有用的化合物。在某些实施例中，本公开内容提供了用于寡核苷酸合成的试剂和方法。在某些实施例中，本公开内容提供了用于手性控制寡核苷酸制备的试剂和方法。在某些实施例中，本公开内容的技术特别适用于构建具有挑战性的核苷酸间连接，提供高产率和立体选择性。
• [EN] NOVEL PHOSPHOROUS (V)-BASED REAGENTS, PROCESSES FOR THE PREPARATION THEREOF, AND THEIR USE IN MAKING STEREO-DEFINED ORGANOPHOSHOROUS (V) COMPOUNDS<br/>[FR] NOUVEAUX RÉACTIFS À BASE DE PHOSPHORE (V), LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ET LEUR UTILISATION DANS LA FABRICATION DE COMPOSÉS ORGANOPHOSHOREUX (V) STÉRÉODÉFINIS
  申请人：BRISTOL MYERS SQUIBB CO

  公开号：WO2019200273A1

  公开（公告）日：2019-10-17

  The present invention relates to novel phosphorous (V) (P(V)) reagents, methods for preparing thereof, and methods for preparing organophosphorous (V) compounds by using the novel reagents.

  本发明涉及新型磷（V）（P(V)）试剂，其制备方法以及利用这种新型试剂制备有机磷（V）化合物的方法。
• DUPLEX OLIGONUCLEOTIDE COMPLEXES AND METHODS FOR GENE SILENCING BY RNA INTERFERENCE
  申请人：Yamada Christina

  公开号：US20080085869A1

  公开（公告）日：2008-04-10

  Provided herein are duplex oligonucleotide complexes which can be administered to a cell, tissue or organism to silence a target gene without the aid of a transfection reagent(s). The duplex oligonucleotide complexes of the disclosure include a conjugate moiety that facilitates delivery to a cell, tissue or organism.

  本文提供了一种双链寡核苷酸复合物，可以被输送到细胞、组织或生物体中，以沉默目标基因，而无需转染试剂的帮助。本公开的双链寡核苷酸复合物包括一个共轭基团，有助于将其输送到细胞、组织或生物体中。
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR DELIVERY OF THERAPEUTIC AGENTS<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS PERMETTANT D'ADMINISTRER DES AGENTS THÉRAPEUTIQUES
  申请人：MODERNATX INC

  公开号：WO2017099823A1

  公开（公告）日：2017-06-15

  This disclosure provides improved lipid-based compositions, including lipid nanoparticle compositions, and methods of use thereof for delivering agents in vivo including nucleic acids and proteins. These compositions are not subject to accelerated blood clearance and they have an improved toxicity profile in vivo.

  这项披露提供了改进的基于脂质的组合物，包括脂质纳米粒子组合物，以及它们用于体内传递药剂的方法，包括核酸和蛋白质。这些组合物不受加速血清清除的影响，并且它们在体内具有改进的毒性特性。
• [EN] TECHNOLOGIES USEFUL FOR OLIGONUCLEOTIDE PREPARATION<br/>[FR] TECHNOLOGIES UTILES POUR LA PRÉPARATION D'OLIGONUCLÉOTIDES
  申请人：WAVE LIFE SCIENCES LTD

  公开号：WO2020191252A1

  公开（公告）日：2020-09-24

  Among other things, the present disclosure provides technologies for oligonucleotide preparation, particularly chirally controlled oligonucleotide preparation, which technologies provide greatly improved crude purity and yield, and significantly reduce manufacturing costs.

  除其他事项外，本公开提供了寡核苷酸制备技术，特别是手性控制的寡核苷酸制备技术，这些技术大大提高了粗品纯度和产量，并显著降低了制造成本。