Peptide-Based Probes with an Artificial Anion-Binding Motif for Direct Fluorescence “Switch-On” Detection of Nucleic Acid in Cells
作者:Debabrata Maity、Marija Matković、Shang Li、Martin Ehlers、Junchen Wu、Ivo Piantanida、Carsten Schmuck
DOI:10.1002/chem.201703813
日期:2017.12.6
reports two new peptide‐based fluorescence probes (1 and 2) for the detection of ds‐DNA at physiological pH. Probes 1 and 2 contain a fluorophore, either amino‐naphthalimide or diethyl‐aminocoumarin, respectively, and two identical peptide arms each equipped with a guanidiniocarbonylpyrrole (GCP) anion‐binding motif. These probes show “switch‐on” fluorescence response upon binding to ds‐DNA, whereby
这项工作报告了两种新的基于肽的荧光探针(1和2),用于在生理pH下检测ds-DNA。探针1和2分别含有一个荧光团,即氨基萘二甲酰亚胺或二乙基氨基香豆素,以及两个相同的肽臂,每个肽臂都带有一个胍基羰基吡咯(GCP)阴离子结合基序。这些探针在与ds-DNA结合后显示“开启”荧光响应,从而可以区分各种类型的多核苷酸。例如,与富含GC的多核苷酸相比,它们对富含AT的多核苷酸表现出更明显的荧光反应,而对ds-RNA的响应却微不足道。1的荧光响应与DNA中AT碱基对的含量成正比,而2的荧光对多核苷酸的二级结构敏感。荧光实验,热解链实验和圆二色性研究表明,1与ds-DNA相互作用的结合是插入和小沟结合,而2则主要与DNA / RNA的外表面相互作用。由于1和2的细胞毒性非常低,因此1可以用于细胞核DNA的成像。