Z-缬氨酰-苯丙氨酸甲酯 | 4817-95-2

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 苯丙氨酸类衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: Z-缬氨酰-苯丙氨酸甲酯
• 英文名称: N-(benzyloxycarbonyl)-L-valyl-L-phenylalanine methyl ester
• 英文别名: (Benzyloxycarbonyl)-S-valyl-S-phenylalanine methyl ester；methyl ((benzyloxy)carbonyl)-L-valyl-L-phenylalaninate；N-cbz-L-Val-L-Phe-OMe；N-Cbz-Val-Phe-OMe；Z-L-Val-L-Phe-OMe；Z-Val-Phe-OCH3；Z-Val-phe-ome；methyl (2S)-2-[[(2S)-3-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]-3-phenylpropanoate
• CAS: 4817-95-2
• 化学式: C₂₃H₂₈N₂O₅
• 分子量: 412.486
• InChiKey: LCLXBNDAOUUZSN-PMACEKPBSA-N

物化性质

• 熔点：
  146 °C
• 沸点：
  607.7±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.164±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  93.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Z-缬氨酰-苯丙氨酸甲酯 在 lithium hydroxide monohydrate 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 以76%的产率得到N-苄氧羰基-缬氨酰-苯基丙氨酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  多种高效 SARS-CoV-2 主要蛋白酶抑制剂的快速途径**

  摘要：

  COVID-19 病原体 SARS-CoV-2 需要其主要蛋白酶 (SC2M Pro ) 消化其两个翻译的长多肽，以形成许多对病毒复制和发病机制至关重要的成熟蛋白质。抑制这一重要的蛋白水解过程可有效防止病毒在受感染的细胞中复制，因此提供了一种潜在的 COVID-19 治疗选择。以以往关于SARS-CoV-1主要蛋白酶（SC1M Pro）的药物化学研究为指导，我们设计并合成了一系列含有β-（S-2-oxopyrrolidin-3-yl）-丙氨酸（Opal）的SC2M Pro抑制剂用于与 SC2M Pro活性位点半胱氨酸 C145形成可逆共价键。所有抑制剂都显示出高效力K i值等于或低于 100 nM。最有效的化合物 MPI3 的K i值为 8.3 nM。SC2M Pro的晶体学分析与七种抑制剂结合表明与C145形成共价键和脱辅基酶的结构重排以适应抑制剂。病毒抑制试验表明，几种抑制剂在抑制 Vero

  DOI：

  10.1002/cmdc.202000924
• 作为产物：
  描述：

  CBZ-L-缬氨酸 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 、 三乙胺 为溶剂， 反应 38.0h， 生成 Z-缬氨酰-苯丙氨酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  Effenberger, Franz; Brodt, Werner, Chemische Berichte, 1985, vol. 118, # 2, p. 468 - 482

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Amino acids and peptides. XXVIII. Synthesis of peptide fragments related to eglin c and studies on the relationship between their structure and effects on human leukocyte elastase, cathepsin G and .ALPHA.-chymotrypsin.
  作者：Satoshi TSUBOI、Kazunori NAKABAYASHI、Yoshikazu MATSUMOTO、Naoki TENO、Yuko TSUDA、Yoshio OKADA、Yoko NAGAMATSU、Junichiro YAMAMOTO

  DOI：10.1248/cpb.38.2369

  日期：——

  Various peptide fragments related to eglin c, which consists of 70 amino acid residues, were synthesized by a conventional solution method and their inhibitory effects on leukocyte elastase, cathepsin G and α-chymotrypsin were examined. Among them, H-Arg-Glu-Tyr-Phe-OMe (eglin c 22-25) and H-Ser-Pro-Val-Thr-Leu-Asp-Leu-Arg-Tyr-OMe (eglin c 41-49) inhibited cathepsin G and α-chymotrypsin but not leukocyte elastase, while H-Thr-Asn-Val-Val-OMe (eglin c 60-63) inhibited leukocyte elastase but not cathepsin G or α-chymotrypsin, although eglin c potently inhibited leukocyte elastase, cathepsin G and α-chymotrypsin. These results indicated that the interaction sites of eglin c with leukocyte elastase, cathepsin G and α-chymotrypsin might be different.

  采用常规的溶液法合成了与来自家蚕血淋巴的抗蛋白酶eglin c（由70个氨基酸残基构成）相关的各种肽片段，并检验了它们对白细胞弹性蛋白酶、组织蛋白酶G和α-胰凝乳蛋白酶的抑制效应。其中，H-Arg-Glu-Tyr-Phe-OMe（eglin c 22-25）和H-Ser-Pro-Val-Thr-Leu-Asp-Leu-Arg-Tyr-OMe（eglin c 41-49）能抑制组织蛋白酶G和α-胰凝乳蛋白酶，但不能抑制白细胞弹性蛋白酶，而H-Thr-Asn-Val-Val-OMe（eglin c 60-63）能抑制白细胞弹性蛋白酶，但不能抑制组织蛋白酶G或α-胰凝乳蛋白酶，尽管eglin c对白细胞弹性蛋白酶、组织蛋白酶G和α-胰凝乳蛋白酶都具有强抑制作用。这些结果提示，eglin c与白细胞弹性蛋白酶、组织蛋白酶G和α-胰凝乳蛋白酶的相互作用部位可能各不相同。
• Side-chain protected oligopeptide fragment condensation using subtilisins in organic solvents
  申请人：Quaedflieg Peter Jan Leonard Mario

  公开号：US09598714B2

  公开（公告）日：2017-03-21

  Method for enzymatically synthesizing an oligopeptide, comprising the coupling of an (optionally N-protected) protected oligopeptide ester with an (optionally C-protected) protected oligopeptide nucleophile in an organic solvent or an organic solvent mixture having a water content of 0.1 vol % or less, by a subtilisin in any possible form.

  用酶合成寡肽的方法，包括在有机溶剂或含水量为0.1体积%或更低的有机溶剂混合物中，通过任何可能形式的粗蛋白酶将（可选地N-保护的）保护寡肽酯与（可选地C-保护的）保护寡肽亲核试剂偶联。
• Optimization and Anti-Cancer Properties of Fluoromethylketones as Covalent Inhibitors for Ubiquitin C-Terminal Hydrolase L1
  作者：Aaron D. Krabill、Hao Chen、Sajjad Hussain、Chad S. Hewitt、Ryan D. Imhoff、Christine S. Muli、Chittaranjan Das、Paul J. Galardy、Michael K. Wendt、Daniel P. Flaherty

  DOI：10.3390/molecules26051227

  日期：——

  this end a study was carried out to fully characterize and optimize the irreversible covalent UCHL1 inhibitor VAEFMK. Structure-activity relationship studies identified modifications to improve activity versus the target and a full cellular characterization was carried out for the first time with this scaffold. The studies produced a new inhibitor, 34, with an IC50 value of 7.7 µM against UCHL1 and no

  去泛素化酶 (DUB) UCHL1 与多种疾病状态有关，包括神经退行性疾病和癌症。然而，缺乏高质量的探针分子来更好地了解 UCHL1 生物学。为此，我们进行了一项研究，以全面表征和优化不可逆共价 UCHL1 抑制剂 VAEFMK。结构-活性关系研究确定了修饰以提高相对于靶标的活性，并且首次使用该支架进行了完整的细胞表征。研究产生了一种新的抑制剂34，其针对 UCHL1 的 IC 50值为 7.7 µM，与最接近的相关 DUB UCHL3 相比没有可观察到的活性。该分子还能够选择性抑制细胞中的 UCHL1，并且没有表现出任何明显的脱靶毒性。最后，该分子被用于初步探针研究，以评估 UCHL1 在骨髓瘤细胞增殖和小细胞肺癌细胞迁移行为中的作用，从而使34成为用于 UCHL1 生物学评估的新工具。
• Kinetics of the alkaline hydrolysis of several n-benzyloxycarbonyldipeptide methyl and ethyl esters
  作者：D.A. Hoogwater、M. Peereboom

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)87839-x

  日期：1990.1

  The reaction rates of the alkaline hydrolysis of synthesized -protected dipeptide methyl and ethyl esters were studied systematically. From the kinetic data the energies of activation, the pre-exponential factors and the reference values at 40°C were calculated. The rate of hydrolysis shows to be strongly dependent on the C-terminal amino acid in the sequence Gly ⪢ Ala/Met/Phe ⪢ Leu ⪢ Val/Pro. Surprisingly

  系统地研究了合成保护的二肽甲酯和乙酯的碱水解反应速率。从动力学数据计算出活化能，指数前因子和40°C时的参考值。水解速率显示出强烈依赖于序列Gly⪢Ala / Met / Phe⪢Leu⪢Val / Pro的C末端氨基酸。令人惊讶地，N-末端氨基酸也发挥作用，但是顺序不同。N端苯丙氨酸尤其显示出相对加速作用。值得注意的是，与相应的甲酯/甲醇/水相比，乙醇/水中的含甘氨酸的二肽乙酯的酯水解明显更快。
• Fully Enzymatic N→C-Directed Peptide Synthesis Using C-Terminal Peptide α-Carboxamide to Ester Interconversion
  作者：Timo Nuijens、Elena Piva、John A. W. Kruijtzer、Dirk T. S. Rijkers、Rob M. J. Liskamp、Peter J. L. M. Quaedflieg

  DOI：10.1002/adsc.201000943

  日期：2011.5.9

  Chemoenzymatic peptide synthesis is potentially the most cost‐efficient technology for the synthesis of short and medium‐sized peptides with some important advantages. For instance, stoichiometric amounts of expensive coupling reagents are not required and racemisation does not occur rendering purification easier compared to chemical peptide synthesis. In this paper, a novel interconversion reaction

  化学酶促肽合成可能是合成短和中型肽的最具成本效益的技术，具有一些重要的优势。例如，与化学肽合成相比，不需要化学计算量的昂贵的偶联剂，并且不发生外消旋化，从而使得纯化更容易。本文研究了肽C的新型互变反应将末端带有α-羧酰胺的α-羧酰胺与alcalase一起用于开发完全酶促的肽合成策略。对于每个延伸步骤，都使用了具有成本效益的氨基酸羧酰胺结构单元，然后将细长的肽羧酰胺相互转化为相应的伯烷基酯。这些肽酯是下一步酶促肽延伸步骤的原料。