N-苄氧羰基-缬氨酰-苯基丙氨酸甲酯 | 19542-51-9

• 物质功能分类: 生物 - 细胞培养 - 添加剂
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: N-苄氧羰基-缬氨酰-苯基丙氨酸甲酯
• 中文别名: 苄氧羰基-L-缬氨酰-L-苯丙氨酸
• 英文名称: N-benzyloxycarbonyl-L-valyl-L-phenylalanine
• 英文别名: (2S)-2-[((2S)-2-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-3-methylbutanoyl)amino]-3-phenylpropanoic acid；((benzyloxy)carbonyl)-L-valyl-L-phenylalanine；calpain inhibitor III；N-Cbz-L-Val-L-Phe；Cbz-Val-Phe-OH；Z-Val-Phe-OH；(2S)-2-[[(2S)-3-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]-3-phenylpropanoic acid
• CAS: 19542-51-9
• 化学式: C₂₂H₂₆N₂O₅
• 分子量: 398.459
• InChiKey: XINBRUNUJFZFGH-OALUTQOASA-N

物化性质

• 熔点：
  150 °C
• 沸点：
  648.6±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.211±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 储存条件：
  室温密封，干燥保存。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-苄氧羰基-缬氨酰-苯基丙氨酸甲酯 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 20.0 ℃ 、172.37 kPa 条件下， 反应 26.0h， 生成 [1-[2',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl]-3-N-[3-N'-[valyl-phenylalanylamino]propyl]thymine]-3'-spiro-5''-[4''-amino-1'',2''-oxathiole-2'',2''-dioxide]
  参考文献：
  名称：

  Design and Discovery of a Novel Dipeptidyl-peptidase IV (CD26)-Based Prodrug Approach

  摘要：

  Here we describe a novel type of enzyme-based prodrug approach in which a dipeptide moiety is linked to a nonpeptidic therapeutic drug through an amide bond which is specifically cleaved by the dipeptidyl-peptidase IV ( DPP IV/CD26) enzyme activity present in plasma and on the surface of certain cells. DPP IV has high substrate selectivity for peptides with a proline ( or an alanine) at the penultimate amino acid position at the N-terminus but tolerates a wide range of natural amino acids at the amino terminal end. A variety of dipeptidyl amide prodrugs of anti-HIV TSAO molecules were synthesized and evaluated for their ability to act as substrates for the enzyme. Our data revealed that DPP IV/CD26 can efficiently recognize such prodrugs as substrates, releasing the parent compound. Moreover, it is possible to modify the half-life and the lipophilicity of the prodrugs by changing the nature of the dipeptide. All conjugates have shown marked in vitro antiviral activities irrespective the the nature of the terminal and/or the penultimate amino acid moiety.

  DOI：

  10.1021/jm0606490
• 作为产物：
  描述：

  L-苯丙氨酸甲酯盐酸盐 在 lithium hydroxide monohydrate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-苄氧羰基-缬氨酰-苯基丙氨酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  多种高效 SARS-CoV-2 主要蛋白酶抑制剂的快速途径**

  摘要：

  COVID-19 病原体 SARS-CoV-2 需要其主要蛋白酶 (SC2M Pro ) 消化其两个翻译的长多肽，以形成许多对病毒复制和发病机制至关重要的成熟蛋白质。抑制这一重要的蛋白水解过程可有效防止病毒在受感染的细胞中复制，因此提供了一种潜在的 COVID-19 治疗选择。以以往关于SARS-CoV-1主要蛋白酶（SC1M Pro）的药物化学研究为指导，我们设计并合成了一系列含有β-（S-2-oxopyrrolidin-3-yl）-丙氨酸（Opal）的SC2M Pro抑制剂用于与 SC2M Pro活性位点半胱氨酸 C145形成可逆共价键。所有抑制剂都显示出高效力K i值等于或低于 100 nM。最有效的化合物 MPI3 的K i值为 8.3 nM。SC2M Pro的晶体学分析与七种抑制剂结合表明与C145形成共价键和脱辅基酶的结构重排以适应抑制剂。病毒抑制试验表明，几种抑制剂在抑制 Vero

  DOI：

  10.1002/cmdc.202000924

文献信息

• Allenone-Mediated Racemization/Epimerization-Free Peptide Bond Formation and Its Application in Peptide Synthesis
  作者：Zhengning Wang、Xuewei Wang、Penghui Wang、Junfeng Zhao

  DOI：10.1021/jacs.1c04614

  日期：2021.7.14

  peptide synthesis (SPPS). The robustness of the allenone-mediated peptide bond formation was showcased incisively by the synthesis of carfilzomib, which involved a rare racemization-/epimerization-free N to C peptide elongation strategy. Furthermore, the successful synthesis of the model difficult peptide ACP (65–74) on a solid support suggested that this method was compatible with SPPS. This method combines

  Allenone 首次被鉴定为一种高效的肽偶联剂。肽键以α-羰基乙烯基酯为关键中间体形成，其形成和随后的氨解以无外消旋/差向异构化的方式自发进行。丙二烯酮偶联试剂不仅对简单酰胺和二肽的合成有效，而且还适用于肽片段缩合和固相肽合成 (SPPS)。卡非佐米的合成充分展示了丙二烯酮介导的肽键形成的稳健性，该合成涉及一种罕见的无消旋化/差向异构化的 N 到 C 肽延伸策略。此外，在固体支持物上成功合成模型困难肽 ACP (65-74) 表明该方法与 SPPS 兼容。该方法结合了传统活性酯和偶联剂的优点，同时克服了两种策略的缺点。因此，这种丙二烯酮介导的肽键形成策略代表了肽合成的颠覆性创新。
• Side-chain protected oligopeptide fragment condensation using subtilisins in organic solvents
  申请人：Quaedflieg Peter Jan Leonard Mario

  公开号：US09598714B2

  公开（公告）日：2017-03-21

  Method for enzymatically synthesizing an oligopeptide, comprising the coupling of an (optionally N-protected) protected oligopeptide ester with an (optionally C-protected) protected oligopeptide nucleophile in an organic solvent or an organic solvent mixture having a water content of 0.1 vol % or less, by a subtilisin in any possible form.

  用酶合成寡肽的方法，包括在有机溶剂或含水量为0.1体积%或更低的有机溶剂混合物中，通过任何可能形式的粗蛋白酶将（可选地N-保护的）保护寡肽酯与（可选地C-保护的）保护寡肽亲核试剂偶联。
• Design and synthesis of new tripeptide-type SARS-CoV 3CL protease inhibitors containing an electrophilic arylketone moiety
  作者：Sho Konno、Pillaiyar Thanigaimalai、Takehito Yamamoto、Kiyohiko Nakada、Rie Kakiuchi、Kentaro Takayama、Yuri Yamazaki、Fumika Yakushiji、Kenichi Akaji、Yoshiaki Kiso、Yuko Kawasaki、Shen-En Chen、Ernesto Freire、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1016/j.bmc.2012.11.017

  日期：2013.1

  We describe here the design, synthesis and biological evaluation of a series of molecules toward the development of novel peptidomimetic inhibitors of SARS-CoV 3CLpro. A docking study involving binding between the initial lead compound 1 and the SARS-CoV 3CLpro motivated the replacement of a thiazole with a benzothiazole unit as a warhead moiety at the P1′ site. This modification led to the identification

  我们在此描述了一系列分子的设计、合成和生物学评估，以开发新型 SARS-CoV 3CL pro的拟肽抑制剂。一项涉及初始先导化合物1与 SARS-CoV 3CL pro之间结合的对接研究促使用苯并噻唑单元取代噻唑作为 P1' 位点的弹头部分。这种修饰导致鉴定出更有效的衍生物，包括2i、2k、2m、2o和2p，其 IC 50或K i值在亚微摩尔至纳摩尔范围内。特别是，化合物2i和2p表现出最有效的抑制活性，K i值分别为 4.1 和 3.1 nM。通过这一过程鉴定出的拟肽化合物对于开发针对 SARS 的潜在治疗剂来说是有吸引力的线索。对SARS-CoV 3CL pro具有强效抑制活性的拟肽的结构要求可概括如下：（i）S1'位存在苯并噻唑弹头；(ii) S1位点环状内酰胺的氢键结合能力；(iii) S2 位点的适当立体化学和疏水部分大小，以及 (iv) S4 位点的苯氧基乙酰基部分呈现的独特折叠构象。
• Novel Peptide Mimetics Based on N-protected Amino Acids Derived from Isomannide as Potential Inhibitors of NS3 Serine Protease of Hepatitis C Virus
  作者：Thalita G. Barros、Bruna C. Zorzanelli、Sergio Pinheiro、Monique A. de Brito、Amilcar Tanuri、Vitor F. Ferreira、Estela M.F. Muri

  DOI：10.2174/157017812800233787

  日期：2012.4.24

  important flaviviruses. It has a serine protease which is important for viral replication and this enzyme constitutes a suitable target for new anti-retroviral drugs. Herein we disclose a series of amide and ester peptide mimetic inhibitors of serine proteases, all of them obtained via coupling reactions of isomannide derivatives with N-protected amino acids. The arginine derivative 19 showed 45% of inhibition

  丙型肝炎病毒（HCV）是最重要的黄病毒之一。它具有丝氨酸蛋白酶，这对于病毒复制很重要，并且该酶构成新的抗逆转录病毒药物的合适靶标。本文中，我们公开了一系列丝氨酸蛋白酶的酰胺和酯肽模拟物抑制剂，它们都是通过异甘露糖衍生物与N-保护的氨基酸的偶联反应而获得的。精氨酸衍生物19在100μM浓度下抑制了NS3 / 4A丝氨酸蛋白酶的45％，分子模型研究表明19与该酶的活性位点相互作用。
• Highly Diastereoselective Peptide Chain Extensions of Unprotected Amino Acids with<i>N</i>-(Z-α-Aminoacyl)benzotriazoles
  作者：Alan R. Katritzky、Kazuyuki Suzuki、Sandeep K. Singh

  DOI：10.1055/s-2004-831255

  日期：——

  Coupling an unprotected amino acid or dipeptide in partially aqueous solution with a readily available N-(Z-α-amino­acyl)benzotriazole or N-(Z-α-aminopetidoyl)benzotriazole affords N-terminal-protected di-, tri-, and tetrapeptides in yields of 85-98% (average 95% for 2a-i, 93% for 4a-f and 4a′, 86% for 5a-b) with minimal epimerization.

  在部分含水溶液中，将未保护的氨基酸或二肽与易得的N-(Z-α-氨基酰基)苯并三唑或N-(Z-α-氨基肽酰基)苯并三唑结合，可以以85-98%的产率（平均产率分别为2a-i的95%，4a-f和4a′的93%，5a-b的86%）获得N端保护的二肽、三肽和四肽，且消旋化程度最小。