2,4-dihydroxy-3-(3′-(1′′-sulfamoyl-1′′,2′′,5′′,6′′-tetrahydropyridin-3′′-yl)propanamido)benzoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2,4-dihydroxy-3-(3′-(1′′-sulfamoyl-1′′,2′′,5′′,6′′-tetrahydropyridin-3′′-yl)propanamido)benzoic acid
• 英文别名: 2,4-dihydroxy-3-[3-(1-sulfamoyl-3,6-dihydro-2H-pyridin-5-yl)propanoylamino]benzoic acid
• 化学式: C₁₅H₁₉N₃O₇S
• 分子量: 385.398
• InChiKey: JLSUKFBXWJHUAV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  179
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2,4-二羟基苯甲酸甲酯 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 Hoveyda-Grubbs catalyst second generation 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 palladium on activated charcoal 、 四丁基氟化铵 、 水 、 氢气 、 硝酸 、 potassium carbonate 、 caesium carbonate 、 溶剂黄146 、 苯硫酚 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三苯基膦 、 对苯醌 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 sodium iodide 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 甲基叔丁基醚 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 、 乙腈 为溶剂， 反应 213.91h， 生成 2,4-dihydroxy-3-(3′-(1′′-sulfamoyl-1′′,2′′,5′′,6′′-tetrahydropyridin-3′′-yl)propanamido)benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  Discovery of novel FabF ligands inspired by platensimycin by integrating structure-based design with diversity-oriented synthetic accessibility

  摘要：

  一种设计生物活性小分子的策略已经被开发出来，该策略专注于通过多样性导向的合成方法访问的化学空间区域，采用了从头基于结构的配体设计（SBLD）。该方法被用于设计和合成一个聚焦于板菌霉素类类似物的库，其中复杂的桥接环系统被一系列替代环系统所取代。通过水LOGSY竞争结合测定法，确定了所得化合物对FabF的C163Q突变体的亲和力。与参考配体相比，几种化合物对该蛋白质的亲和力明显提高。将合成可及性与配体设计相结合，使得可以聚焦于与所研究目标蛋白相关的合成可及的化学空间区域。

  DOI：

  10.1039/c3ob41975d

文献信息

• Discovery of novel FabF ligands inspired by platensimycin by integrating structure-based design with diversity-oriented synthetic accessibility
  作者：Martin Fisher、Ramkrishna Basak、Arnout P. Kalverda、Colin W. G. Fishwick、W. Bruce Turnbull、Adam Nelson

  DOI：10.1039/c3ob41975d

  日期：——

  An approach for designing bioactive small molecules has been developed in which de novo structure-based ligand design (SBLD) was focused on regions of chemical space accessible using a diversity-oriented synthetic approach. The approach was exploited in the design and synthesis of a focused library of platensimycin analogues in which the complex bridged ring system was replaced with a series of alternative ring systems. The affinity of the resulting compounds for the C163Q mutant of FabF was determined using a WaterLOGSY competition binding assay. Several compounds had significantly improved affinity for the protein relative to a reference ligand. The integration of synthetic accessibility with ligand design enabled focus to be placed on synthetically-accessible regions of chemical space that were relevant to the target protein under investigation.

  一种设计生物活性小分子的策略已经被开发出来，该策略专注于通过多样性导向的合成方法访问的化学空间区域，采用了从头基于结构的配体设计（SBLD）。该方法被用于设计和合成一个聚焦于板菌霉素类类似物的库，其中复杂的桥接环系统被一系列替代环系统所取代。通过水LOGSY竞争结合测定法，确定了所得化合物对FabF的C163Q突变体的亲和力。与参考配体相比，几种化合物对该蛋白质的亲和力明显提高。将合成可及性与配体设计相结合，使得可以聚焦于与所研究目标蛋白相关的合成可及的化学空间区域。