解旋酶分为六个超家族,是利用
ATP 水解产生的能量重塑 DNA 和 RNA 底物的机械酶。这些酶在不同的细胞过程中起关键作用,例如翻译、
核糖体组装和
基因组维护。已经确定了在某些癌细胞中具有基本功能的解旋酶,并且许多病毒表达的解旋酶是其致病性所必需的。因此,解旋酶是
化学探针和治疗的重要靶标。然而,开发解旋酶的
化学抑制剂(具有高构象动力学的酶)一直非常具有挑战性。我们设想了已用于
化学蛋白质组学研究的亲电“侦察片段”可用于开发解旋酶的共价
抑制剂。我们采用了功能优先的方法,将酶测定与对映体探针对和质谱相结合,开发了一种选择性靶向
SARS-CoV-2 nsp13(超家族 1 解旋酶)变构位点的共价
抑制剂。此外,我们证明侦查片段抑制参与
基因组维持的两种人类超家族 2 解旋酶 BLM 和 WRN 的活性。总之,我们的研究结果提出了一种在构象动态机械酶中发现共价
抑制剂起点和可成药变构位点的方法。