methyl (S)-4-((7-methoxy-5-oxo-2,3,5,11a-tetrahydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)butanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯二氮卓类
• 英文名称: methyl (S)-4-((7-methoxy-5-oxo-2,3,5,11a-tetrahydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)butanoate
• 英文别名: methyl 4-[[(6aS)-2-methoxy-11-oxo-6a,7,8,9-tetrahydropyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-3-yl]oxy]butanoate
• 化学式: C₁₈H₂₂N₂O₅
• 分子量: 346.383
• InChiKey: NVPXDWFXBCBRSO-LBPRGKRZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  77.4
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (S)-4-((7-methoxy-5-oxo-2,3,5,11a-tetrahydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)butanoate 、 丙酮 在 四氢吡咯 作用下， 反应 72.0h， 生成 methyl 4-(((11S,11aS)-7-methoxy-5-oxo-11-(2-oxopropyl)-2,3,5,10,11,11a-hexahydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)butanoate 、 methyl 4-(((11R,11aS)-7-methoxy-5-oxo-11-(2-oxopropyl)-2,3,5,10,11,11a-hexahydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)butanoate
  参考文献：
  名称：

  失去细胞毒性的吡咯并苯二氮卓 (PBD) 的新型 C11-丙酮加合物的形成

  摘要：

  在丙酮存在下，吡咯并苯二氮卓 (PBD) 化合物的色谱纯化过程中观察到了吡咯烷催化形成的新型非对映体 C11-丙酮加合物。探索了该反应的机理并充分表征了所获得的加合物。还发现 Talirine 是抗体-药物偶联物 (ADC) 伐达妥昔单抗 talirine 的细胞毒性有效载荷元素，在类似条件下也可形成双加合物。对修饰的 PBD 化合物的细胞毒性评估证实它们没有细胞毒性，这与 DNA 相互作用的 N10-C11 亚胺功能的丧失一致。除了这里报告的新化学，鉴于目前临床上基于 PBD 的 ADC 的数量，这一观察结果对于大规模生产基于 PBD 的产品可能很重要。

  DOI：

  10.1055/s-0036-1591552
• 作为产物：
  描述：

  4-溴丁酸甲酯 在 palladium on activated charcoal 四氢吡咯 、 吡啶 、 potassium permanganate 、 四(三苯基膦)钯 、 草酰氯 、 氢气 、 硝酸 、 乙酸酐 、 potassium carbonate 、 对甲苯磺酸 、 二甲基亚砜 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， -40.0~20.0 ℃ 、275.79 kPa 条件下， 反应 58.5h， 生成 methyl (S)-4-((7-methoxy-5-oxo-2,3,5,11a-tetrahydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepin-8-yl)oxy)butanoate
  参考文献：
  名称：

  Design, Synthesis, and Biophysical and Biological Evaluation of a Series of Pyrrolobenzodiazepine−Poly(N-methylpyrrole) Conjugates

  摘要：

  A novel series of methyl ester-terminated C8-linked pyrrolobenzodiazepine (PBD)-poly(N-methylpyrrole) conjugates (50a-f) has been synthesized and their DNA interaction evaluated by thermal denaturation, DNA footprinting, and in vitro transcription stop assays. The synergistic effect of attaching a PBD unit to a polypyrrole fragment is illustrated by the large increase in DNA binding affinity (up to 50-fold) compared to the individual PBD and pyrrole components. 50a-f were found to bind mainly to identical DNA sequences but with apparent binding site widths increasing with molecular length and the majority of sites conforming to the consensus motif 5'-XGXW(z) (z = 3 +/- 1; W = A or T; X = any base but preferably a purine). They also provided robust sequence-selective blockade of transcription at sites corresponding approximately to their DNA footprints. 50a-f were shown to have good cellular/ nuclear penetration properties, and a degree of correlation between cytotoxicity and DNA-binding affinity was observed.

  DOI：

  10.1021/jm051199z