甲基-PEG3-羧酸 | 67319-28-2

• 物质功能分类: 有机原料 - 羧酸类化合物及衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 甲基-PEG3-羧酸
• 英文名称: 2,5,8,11-tetraoxatetradecan-14-oic acid
• 英文别名: 3-{2-[2-(2-methoxy-ethoxy)-ethoxy]-ethoxy}-propionic acid；4,7,10,13-tetraoxatetradecanoic acid；3-[2-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]propanoic acid；m-PEG3-acid
• CAS: 67319-28-2
• 化学式: C₁₀H₂₀O₆
• 分子量: 236.265
• InChiKey: ZMCJTXKSDDFJRG-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  352.3±32.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.105±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  溶于水

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.9
• 拓扑面积：
  74.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

制备方法与用途

生物活性

m-PEG3-CH2CH2COOH 是一种不可降解的 ADC 链接剂，用于抗体偶联药物 (ADC) 的合成。它也是一种基于 PEG 的 PROTAC 链接剂，可用于 PROTAC 的合成。

靶点

| 不可降解 | PEGs |

体外研究

ADC 由一种通过 ADC 链接剂连接到抗体上的 ADC 细胞毒性药物组成。PROTAC 包含两种不同配体，两者之间由链接剂相连；其中一种是 E3 泛素连接酶的配体，另一种是目标蛋白的配体。PROTAC 利用细胞内的泛素-蛋白质酶体系统选择性地降解目标蛋白。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  甲基-PEG3-羧酸 在 iron(III) chloride 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 potassium fluoride dihydrate 、 溴 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  具有竞争性分子内氢键控制的具有骨架构型的低聚（对苯撑乙炔）

  摘要：

  一系列共轭寡（p合成并研究了具有竞争性的分子内氢键控制的具有主链构象（即所含亚苯基单元的相对方向）的主链亚苯基亚乙炔基（OPE）分子。在这些低聚物中，羧酸根和酰胺基取代基连接到OPE主链上的交替亚苯基单元上。这些官能团能够在相邻的亚苯基单元之间形成分子内氢键。因此，主链中的所有亚苯基单元都被限制在一个共面的构象中。这种平面化结构的有效共轭长度比常规OPE具有更长的有效共轭长度，因为苯环单元的旋转能垒低，因此采用随机取向。但是，如果将三（乙二醇）（Tg）侧链附加到酰胺基上，它使Tg链折回并且所含的醚氧原子与酯羰基竞争作为氢键受体而形成另一种分子内氢键。事实证明，竞争的结果取决于将醚氧原子与酰胺基连接的亚烷基接头的长度。具体来说，如果Tg链折回以形成五元环状结构，则该氢键基序足够坚固，可以否决相邻亚苯基单元之间的氢键。因此，低聚物假定为非平面构象。但是，如果侧链通过与酰胺基NH基团的氢键形成六

  DOI：

  10.1002/chem.201003603
• 作为产物：
  描述：

  三甘醇单甲醚 在 sodium hydride 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 12.17h， 生成 甲基-PEG3-羧酸
  参考文献：
  名称：

  Investigation into the Use of Encorafenib to Develop Potential PROTACs Directed against BRAFV600E Protein

  摘要：

  BRAF是一种丝氨酸/苏氨酸激酶，在人类癌症中经常发生突变。BRAFV600E突变蛋白通过使用激酶抑制剂进行靶向治疗黑色素瘤; 然而，它们的长期疗效受到抵抗机制的限制。已经提出了通过PROTAC诱导的BRAFV600E降解作为避免抵抗发生的替代策略。在这项研究中，我们设计了一系列化合物，其中BRAF激酶抑制剂encorafenib通过不同的连接剂与pomalidomide结合。合成的化合物保持了抑制突变BRAF激酶活性的能力，IC50值在40-88 nM范围内。选择的化合物抑制了A375和Colo205肿瘤细胞系的BRAFV600E信号和细胞增殖。该系列中最活跃的化合物10和11无法诱导突变BRAF的降解。与高效的BRAF降解剂P5B进行对比的对接和分子动力学研究表明，携带pomalidomide亚结构的连接剂的不同定向，以及共轭物暴露于溶剂的部分运动性降低，可以解释这种行为。

  DOI：

  10.3390/molecules27238513

文献信息

• Live-Cell Protein Modification by Boronate-Assisted Hydroxamic Acid Catalysis
  作者：Christopher Adamson、Hidetoshi Kajino、Shigehiro A. Kawashima、Kenzo Yamatsugu、Motomu Kanai

  DOI：10.1021/jacs.1c07060

  日期：2021.9.22

  Selective methods for introducing protein post-translational modifications (PTMs) within living cells have proven valuable for interrogating their biological function. In contrast to enzymatic methods, abiotic catalysis should offer access to diverse and new-to-nature PTMs. Herein, we report the boronate-assisted hydroxamic acid (BAHA) catalyst system, which comprises a protein ligand, a hydroxamic

  在活细胞中引入蛋白质翻译后修饰 (PTM) 的选择性方法已被证明对研究其生物学功能很有价值。与酶法相比，非生物催化应该提供对各种新自然 PTM 的访问。在此，我们报道了硼酸盐辅助的异羟肟酸（BAHA）催化剂体系，该体系由蛋白质配体、异羟肟酸路易斯碱和二醇部分组成。与带有硼酸的酰基供体配合，我们的催化剂利用局部摩尔浓度效应来促进酰基转移到目标赖氨酸残基。我们的催化剂系统采用微摩尔浓度的试剂，并提供最小的脱靶蛋白反应性。至关重要的是，BAHA 对谷胱甘肽具有抗性，谷胱甘肽是一种阻碍活细胞内非生物化学的许多努力的代谢物。在人体细胞中表达的大肠杆菌二氢叶酸还原酶。我们的结果进一步确立了众所周知的硼酸-二醇络合作为真正的生物正交反应，在化学生物学和细胞内催化中的应用。
• [EN] RAPIDLY RELEASED BIOORTHOGONAL CAGING GROUPS<br/>[FR] GROUPES D'ENCAGEMENTS BIOORTHOGONAUX À LIBÉRATION RAPIDE
  申请人：UNIV UTAH RES FOUND

  公开号：WO2019232269A1

  公开（公告）日：2019-12-05

  Bioorthogonal molecules are disclosed and described. A bioorthogonal a molecule having a structure according to: Formula (I); where R2, R3, and R4 are independently selected from H, a substituted or unsubstituted C1-C4 alkyl or alkylene group, a substituted or unsubstituted aryl, COOR9, COR9, CONR9R10, CN, CF3, SO2R9, or a tether molecule; R1 is -R5, -OCOR6, -COR7, or -R8; R5 is -R8, -OH, or tosyl; R6 is a nitrophenyl ether or -R8; R7 is -R8; R8 is a payload or a molecular linker to a payload; and R9 and R10 are independently selected from H or a substituted or unsubstituted C1-C4 alkyl or alkene group.

  生物正交分子已被披露和描述。具有以下结构的生物正交分子：化学式（I）；其中R2、R3和R4分别从H、取代或未取代的C1-C4烷基或烷基烯基、取代或未取代的芳基、COOR9、COR9、CONR9R10、CN、CF3、SO2R9或一个连接分子中独立选择；R1为-R5、-OCOR6、-COR7或-R8；R5为-R8、-OH或对甲苯磺酰基；R6为硝基苯醚或-R8；R7为-R8；R8为有效载荷或有效载荷的分子连接物；R9和R10分别从H或取代或未取代的C1-C4烷基或烯基中独立选择。
• Bioorthogonal Removal of 3-Isocyanopropyl Groups Enables the Controlled Release of Fluorophores and Drugs in Vivo
  作者：Julian Tu、Minghao Xu、Saba Parvez、Randall T. Peterson、Raphael M. Franzini

  DOI：10.1021/jacs.8b05093

  日期：2018.7.11

  Dissociative bioorthogonal reactions allow for chemically controlling the release of bioactive agents and reporter probes. Here we describe 3-isocyanopropyl substituents as masking groups that can be effectively removed in biological systems. 3-Isocyanopropyl derivatives react with tetrazines to afford 3-oxopropyl groups that eliminate diverse functionalities. The study shows that the reaction is rapid

  解离生物正交反应允许化学控制生物活性剂和报告探针的释放。在这里，我们将 3-异氰丙基取代基描述为可以在生物系统中有效去除的掩蔽基团。3-异氰丙基衍生物与四嗪反应生成 3-氧代丙基，可消除多种官能团。研究表明，该反应迅速，可以在生理条件下近乎定量地释放酚类和胺类。该反应与活生物体相容，正如在植入四嗪修饰珠的斑马鱼胚胎中释放试卤灵荧光团和美西律药物所证明的那样。合成的简易性、快速的动力学、离去基团的多样性、高释放率和结构紧凑性的综合优势，
• ONIUM SALT, LIQUID COMPOSITION CONTAINING SAID ONIUM SALT AND CELLULOSE, AND CELLULOSE RECOVERY METHOD
  申请人：KOEI CHEMICAL COMPANY, LIMITED

  公开号：US20160009669A1

  公开（公告）日：2016-01-14

  The invention relates to an onium salt, a liquid composition containing the onium salt and cellulose, and a method for recovering cellulose. The invention makes it possible to provide an onium salt having an extremely high ability to dissolve cellulose at temperatures of 100° C. or lower. It also makes it possible to provide a liquid composition containing this onium salt and cellulose, as a composition suitable for the recovery of cellulose, and a method for recovering cellulose efficiently by using such a liquid composition containing the onium salt and cellulose.

  该发明涉及一种含有onium盐和纤维素的液体组合物以及一种恢复纤维素的方法。该发明使得能够在100°C或更低温度下提供具有极高溶解纤维素能力的onium盐成为可能。它还使得能够提供一种含有该onium盐和纤维素的液体组合物，作为适用于纤维素恢复的组合物，并通过使用含有onium盐和纤维素的这种液体组合物高效地恢复纤维素的方法成为可能。
• Cross-linked peptides containing non-peptide cross-linked structure, method for synthesizing cross-linked peptides, and novel organic compound used in method
  申请人：JITSUBO Co., Ltd.

  公开号：US09365615B2

  公开（公告）日：2016-06-14

  The purpose of the present invention is to provide a cross-linked peptide containing a novel non-peptide cross-linked structure, and a method for synthesizing the same. A cross-linked peptide having a novel non-peptide cross-linked structure, a useful intermediate for synthesizing the cross-linked peptide, and a method for synthesizing the novel cross-linked peptide and the intermediate are provided. The cross-linked peptide is characterized by having an —NR— bond in the cross-linked structure. By using the method for synthesizing the cross-linked peptide, a cross-link can be freely designed and an change can be freely made to a cross-link.

  本发明的目的是提供一种含有新型非肽交联结构的交联肽，并提供其合成方法。提供了具有新型非肽交联结构的交联肽、用于合成交联肽的有用中间体，以及合成新型交联肽和中间体的方法。该交联肽的特点是具有交联结构中的—NR—键。通过使用合成交联肽的方法，可以自由设计交联，并自由改变交联。