Structure-based drug design (SBDD) has become a powerful tool utilized by medicinal chemists to rationally guide the drug discovery process. Herein, we describe the use of SPROUT, a de novo-based program, to identify an indazole-based pharmacophore for the inhibition of fibroblast growth factor receptor (FGFR) kinases, which are validated targets for cancer therapy. Hit identification using SPROUT
基于结构的药物设计(S
BDD)已成为药物
化学家用来合理指导药物发现过程的强大工具。在此,我们描述从头开始使用
SPROUT基于程序的程序,以识别基于
吲唑的药效基团来抑制成纤维细胞生长因子受体(FGFR)激酶,这是经过验证的癌症治疗靶标。使用
SPROUT进行命中鉴定可产生6-苯基
吲哚,为预计会与FGFR1结合的小片段。借助于对接模型,对
吲哚进行了几次修饰,以使片段最优化为含
吲唑的药效团,从而形成了包含23种衍
生物的化合物库。
生物学评估表明,这些含
吲唑的片段在0.8-90μM的范围内抑制FGFR1-3,具有出色的0.30-0.48
配体效率。一些化合物对单个FGFR表现出中等选择性,这表明使用S
BDD进行进一步优化可能会导致FGFR家族的有效和选择性
抑制剂。