methyl (8S)-8-(chloromethyl)-4-hydroxy-3,6,7,8-tetrahydropyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate | 760924-68-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: methyl (8S)-8-(chloromethyl)-4-hydroxy-3,6,7,8-tetrahydropyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
• CAS: 760924-68-3
• 化学式: C₁₃H₁₃ClN₂O₃
• 分子量: 280.711
• InChiKey: VYPZSHYTAJIJSA-ZCFIWIBFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  74.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (8S)-8-(chloromethyl)-4-hydroxy-3,6,7,8-tetrahydropyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate 在 碳酸氢钠 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 methyl 2-[(6-hydroxy-5-methoxyindol-2-yl)carbonyl]-1,2,8,8a-tetrahydrocyclopropa[c]-pyrrolo[3,2-e]indol-4-one-6-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  (+)-andent-(-)-Yatakemycin 和 Duocarmycin SA 的不对称全合成：评估 Yatakemycin 关键部分结构及其非天然对映异构体

  摘要：

  对提供第一次矢车菊霉素全合成导致其结构修正和绝对立体化学分配的研究的补充，本文公开了第二代不对称全合成。由于单独的 yatakemycin 亚基与 duocarmycin SA（烷基化亚基）或 CC-1065（中央和右侧亚基）的亚基相同，因此这些研究还改进了我们早期的 CC-1065 全合成，如本文所详述，已扩展到 (+)-duocarmycin SA 的不对称全合成。研究的进一步扩展为比较评估提供了关键的 yatakemycin 部分结构和类似物。这包括 DNA 选择性（五碱基对 AT 序列的中心腺嘌呤，例如 5'-AAAAA）、效率、相对速率、ent-(-)-yatakemycin 的可逆性及其与天然对映异构体的比较（相同的选择性和效率），腺嘌呤 N3 加合物的结构表征证实了 DNA 反应的性质，以及天然产物的细胞毒活性的比较（ L1210, IC50 = 5 pM) 及其非天然对映异构体

  DOI：

  10.1021/ja064228j
• 作为产物：
  描述：

  3,5-二硝基苯甲醛 在 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 palladium on activated charcoal 、 N-碘代丁二酰亚胺 、 苯甲醛肟 、 偶氮二异丁腈 、 氢气 、 三正丁基氢锡 、 甲酸铵 、 sodium methylate 、 sodium hydride 、 potassium carbonate 、 氯化铵 、 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 、 甲苯 、 xylene 、 苯 为溶剂， 反应 52.75h， 生成 methyl (8S)-8-(chloromethyl)-4-hydroxy-3,6,7,8-tetrahydropyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  (+)-andent-(-)-Yatakemycin 和 Duocarmycin SA 的不对称全合成：评估 Yatakemycin 关键部分结构及其非天然对映异构体

  摘要：

  对提供第一次矢车菊霉素全合成导致其结构修正和绝对立体化学分配的研究的补充，本文公开了第二代不对称全合成。由于单独的 yatakemycin 亚基与 duocarmycin SA（烷基化亚基）或 CC-1065（中央和右侧亚基）的亚基相同，因此这些研究还改进了我们早期的 CC-1065 全合成，如本文所详述，已扩展到 (+)-duocarmycin SA 的不对称全合成。研究的进一步扩展为比较评估提供了关键的 yatakemycin 部分结构和类似物。这包括 DNA 选择性（五碱基对 AT 序列的中心腺嘌呤，例如 5'-AAAAA）、效率、相对速率、ent-(-)-yatakemycin 的可逆性及其与天然对映异构体的比较（相同的选择性和效率），腺嘌呤 N3 加合物的结构表征证实了 DNA 反应的性质，以及天然产物的细胞毒活性的比较（ L1210, IC50 = 5 pM) 及其非天然对映异构体

  DOI：

  10.1021/ja064228j

文献信息

• A Fundamental Relationship between Hydrophobic Properties and Biological Activity for the Duocarmycin Class of DNA-Alkylating Antitumor Drugs: Hydrophobic-Binding-Driven Bonding
  作者：Amanda L. Wolfe、Katharine K. Duncan、James P. Lajiness、Kaicheng Zhu、Adam S. Duerfeldt、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/jm400665c

  日期：2013.9.12

  series of increasingly hydrophilic derivatives of duocarmycin SA that feature the incorporation of ethylene glycol units (n = 1–5) into the methoxy substituents of the trimethoxyindole subunit are described. These derivatives exhibit progressively increasing water solubility along with progressive decreases in cell growth inhibitory activity and DNA alkylation efficiency with the incremental ethylene glycol

  Duocarmycin SA 的两个系统系列越来越亲水，其特征是将乙二醇单元（n = 1-5）并入三甲氧基吲哚亚基的甲氧基取代基中。随着乙二醇单元掺入的增加，这些衍生物表现出逐渐增加的水溶性以及细胞生长抑制活性和 DNA 烷基化效率的逐渐降低。观察到 cLogP 与细胞生长抑制的-log IC 50和 -log AE（AE = 无细胞 DNA 烷基化效率）的线性关系，cLogP值跨越 2.5–0.49 的生产范围，-log IC 50值跨越11.2-6.4的范围，代表IC 50值相差 10 5 (0.008 到 370 nM)。结果量化了化合物的疏水特性在表达此类成员的生物活性（驱动本质上可逆的 DNA 烷基化反应）中所起的基本作用，并定义了其影响的惊人程度。
• Systematic Exploration of the Structural Features of Yatakemycin Impacting DNA Alkylation and Biological Activity
  作者：Mark S. Tichenor、Karen S. MacMillan、John D. Trzupek、Thomas J. Rayl、Inkyu Hwang、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/ja072777z

  日期：2007.9.1

  of the alkylation subunit within the three subunit arrangement (sandwiched vs extended and reversed analogues) indicates that it not only has a profound impact on the rate and efficiency of DNA alkylation but also controls and establishes the DNA alkylation selectivity as well, where both enantiomers of such sandwiched agents alkylate the same adenine sites exhibiting the same DNA alkylation selectivity

  对 yatakemycin 左右亚基及其取代基的影响进行了系统检查，并对其独特的三个亚基排列（夹心与扩展和反向类似物）进行了研究。约的检查。制备的 50 个类似物表明，在矢车霉素三亚基结构中，亚基取代基相对不重要，独特的夹心排列显着提高了其 DNA 烷基化反应的速率和效率。这增强了 yatakemycin 及其类似物的细胞毒活性，克服了该系列中更传统的化合物（CC-1065，duocarmycins）通常观察到的局限性。而且，
• Bifunctional alkylating agents derived from duocarmycin SA: potent antitumor activity with altered sequence selectivity
  作者：Dale L. Boger、Mark Searcey、Winston C. Tse、Qing Jin

  DOI：10.1016/s0960-894x(00)00042-1

  日期：2000.3

  The series of four dimers derived from head to tail coupling of the two enantiomers of the duocarmycin SA alkylation subunit are described. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Asymmetric Total Synthesis of (+)- and <i>ent</i>-(−)-Yatakemycin and Duocarmycin SA:  Evaluation of Yatakemycin Key Partial Structures and Its Unnatural Enantiomer
  作者：Mark S. Tichenor、John D. Trzupek、David B. Kastrinsky、Futoshi Shiga、Inkyu Hwang、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/ja064228j

  日期：2006.12.1

  an asymmetric total synthesis of (+)-duocarmycin SA. Further extensions of the studies provided key yatakemycin partial structures and analogues for comparative assessments. This included the definition of the DNA selectivity (adenine central to a five-base-pair AT sequence, e.g., 5'-AAAAA), efficiency, relative rate, and reversibility of ent-(-)-yatakemycin and its comparison with the natural enantiomer

  对提供第一次矢车菊霉素全合成导致其结构修正和绝对立体化学分配的研究的补充，本文公开了第二代不对称全合成。由于单独的 yatakemycin 亚基与 duocarmycin SA（烷基化亚基）或 CC-1065（中央和右侧亚基）的亚基相同，因此这些研究还改进了我们早期的 CC-1065 全合成，如本文所详述，已扩展到 (+)-duocarmycin SA 的不对称全合成。研究的进一步扩展为比较评估提供了关键的 yatakemycin 部分结构和类似物。这包括 DNA 选择性（五碱基对 AT 序列的中心腺嘌呤，例如 5'-AAAAA）、效率、相对速率、ent-(-)-yatakemycin 的可逆性及其与天然对映异构体的比较（相同的选择性和效率），腺嘌呤 N3 加合物的结构表征证实了 DNA 反应的性质，以及天然产物的细胞毒活性的比较（ L1210, IC50 = 5 pM) 及其非天然对映异构体