overexpression. We report the design, synthesis, and structure–activity relationships of 3-(piperidin-4-ylmethoxy)pyridine containing compounds as potent LSD1 inhibitors with Ki values as low as 29 nM. These compounds exhibited high selectivity (>160×) against related monoamine oxidase A and B. Enzyme kinetics and docking studies suggested they are competitive inhibitors against a dimethylated H3K4 substrate
组蛋白赖
氨酸残基的甲基化在
基因表达调节以及癌症起始中起重要作用。赖
氨酸特异性脱甲基酶1(L
SD1)负责维持组蛋白H3赖
氨酸4(H3K4)的平衡甲基化
水平。由于甲基化的H3K4或L
SD1过表达的重要功能,L
SD1是某些癌症的药物靶标。我们报告了作为有效L
SD1
抑制剂的含有3-(
哌啶-4-基甲氧基)
吡啶的化合物(与K i的设计,合成和结构-活性关系)值低至29 nM。这些化合物对相关的单胺氧化酶A和B表现出高选择性(> 160x)。酶动力学和对接研究表明它们是针对二甲基化H3K4底物的竞争性
抑制剂,并提供了可能的结合方式。有效的L
SD1
抑制剂可以增加细胞H3K4甲基化并强烈抑制
EC 50值低至280 nM的几种白血病和实体瘤细胞的增殖,而对正常细胞的作用却微不足道。