(1R,3R,4R,7S)-3-(guanin-9-yl)-7-benzyloxy-1-benzoyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo-[2.2.1]heptane | 709641-77-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (1R,3R,4R,7S)-3-(guanin-9-yl)-7-benzyloxy-1-benzoyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo-[2.2.1]heptane
• 英文别名: (1R,3R,4R,7S)-3-(guanin-9-yl)-7-benzyloxy-1-benzoyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
• CAS: 709641-77-0
• 化学式: C₂₅H₂₃N₅O₆
• 分子量: 489.488
• InChiKey: ZCEUXHOOTCDBLN-YBWLXYFRSA-N

物化性质

• 沸点：
  754.6±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.57±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.81
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  143.58
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,3R,4R,7S)-3-(guanin-9-yl)-7-benzyloxy-1-benzoyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo-[2.2.1]heptane 在 吡啶 、 4,5-二氰基咪唑 、 甲烷磺酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-1-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)-7-(2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphinoxy)-3-[2-N-((N',N'-dimethylamino)methylidene)-guanin-9-yl]-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  LNA鸟嘌呤和2，6-二氨基嘌呤。含有LNA 2，6-二氨基嘌呤的寡核苷酸的合成，表征和杂交特性。

  摘要：

  LNA鸟嘌呤和2,6-二氨基嘌呤（D）亚磷酰胺已合成为反义寡核苷酸（ON）的构件。研究了将LNA D掺入ON的效果。不出所料，含有ON的LNA D对互补DNA（ΔTm +1.6至+3.0摄氏度）和RNA（ΔTm +2.6至+4.6摄氏度）ON表现出更高的亲和力。为了评估含有ON的LNA D与含有ON的互补LNA A相比是否具有增强的错配敏感性，进行了针对单个错配DNA和RNA ON的热变性实验。在完全LNA修饰的ON中，用LNA D取代一个LNA A残基，导致对DNA ON的错配敏感性更高（Delta Delta Tm -4至> -17摄氏度）。观察到朝向单个错配的RNA ON的相同趋势（Delta Delta Tm Da = -8.7摄氏度，Dg = -4。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.02.008
• 作为产物：
  描述：

  3-O-benzyl-1,2-O-isopropylidene-α-D-allofuranose 在 吡啶 、 sodium periodate 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 硫酸 、 sodium hydride 、 3-羟基丙腈 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 、 溶剂黄146 、 二甲基亚砜 、 1,2-二氯乙烷 、 mineral oil 为溶剂， 反应 173.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-3-(guanin-9-yl)-7-benzyloxy-1-benzoyloxymethyl-2,5-dioxabicyclo-[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 2′-O,4′-C-alkylene-bridged ribonucleosides and their evaluation as inhibitors of HCV NS5B polymerase

  摘要：

  The synthesis of 2'-O,4'-C-methylene-bridged bicyclic guanine ribonucleosides bearing 2'-C-methyl or 5'C-methyl modifications is described. Key to the successful installation of the methyl functionality in both cases was the use of a one-pot oxidation-Grignard procedure to avoid formation of the respective unreactive hydrates prior to alkylation. The 2'-C-methyl- and 5'-C-methyl-modified bicyclic guanosines were evaluated, along with the known uracil-, cytosine-, adenine-, guanine-LNA and guanine-ENA nucleosides, as potential antiviral agents and found to be inactive in the hepatitis C virus (HCV) cell-based replicon assay. Examination of the corresponding nucleoside triphosphates, however, against the purified HCV NS5B polymerase indicated that LNA-G and 2'-C-methyl-LNA-G are potent inhibitors of both 1b wild type and S282T mutant enzymes in vitro. Activity was further demonstrated for the LNA-G-triphosphate against HCV NS5B polymerase genotypes 1a, 2a, 3a and 4a. A phosphorylation by-pass prodrug strategy may be required to promote anti-HCV activity in the replicon assay. (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2014.04.050