3′,5′-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxan-1,3-yl)-9-(β-D-ribofuranosyl)purin-2,6-diamine | 87791-88-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 3′,5′-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxan-1,3-yl)-9-(β-D-ribofuranosyl)purin-2,6-diamine
• 英文别名: 2,6-diamino-9-[3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-ribofuranosyl]purine；9-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-ribofuranosyl]-2,6-diaminopurine；3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-aminoadenosine；2,6-diamino-9-(3,5-O-tetraisopropyldisiloxane-(1,3-diyl)-β-D-ribofuranosyl) purine；2,6-Diamino-9-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-ribofuranosyl]purine；3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisilox-1,3-diyl)-2-amino-adenosine；(6aR,8R,9R,9aS)-8-(2,6-diaminopurin-9-yl)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-9-ol
• CAS: 87791-88-6
• 化学式: C₂₂H₄₀N₆O₅Si₂
• 分子量: 524.768
• InChiKey: JDIJNOYCRWZOAA-QTQZEZTPSA-N

物化性质

• 沸点：
  634.1±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.36±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.21
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.77
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3′,5′-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxan-1,3-yl)-9-(β-D-ribofuranosyl)purin-2,6-diamine 在 caesium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 2'-O-[2-(N-methylcarbamoyl)ethyl]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-aminoadenosine
  参考文献：
  名称：

  使用Oxa-Michael反应合成寡聚核苷酸，并掺入这些修饰的核糖核苷的寡核苷酸衍生物的化学和生物学性质，合成2'- O- [2-（N-甲基氨基甲酰基）乙基]核糖核苷

  摘要：

  为了开发含有新的2'- O-修饰的核糖核苷作为核酸药物的寡核苷酸，我们合成了3种类型的在2'-羟基被2-（甲氧基羰基）乙基（MOCE），2-（N-甲基氨基甲酰基）修饰的核糖核苷衍生物。通过适当保护的核糖核苷（U，C，A和G）衍生物的oxa-Michael反应，将乙基（MCE）和2-（N，N-二甲基氨基甲酰基）乙基（DMCE）基团作为关键中间体。其中，发现2'- O- MCE核糖核苷在碱性条件下最稳定。研究2'- O-修饰对掺入2'- O的寡核苷酸的核酸酶抗性的影响修饰的核糖核苷及其对互补RNA和DNA链的杂交亲和力，成功合成了2' - O -MCE-核糖核苷亚磷酰胺衍生物，并进行了2' - O -MCE-寡核苷酸和2'- O-甲基-核苷酸的合成包含2' - O -MCE-核糖核苷的寡核苷酸。2'- Ô -MCE寡核苷酸和嵌合低聚物2'- ö -MCE和2'- ö甲基基团如此得到证实互补RNA链和高得多的核酸酶抗性比相应的2'-

  DOI：

  10.1021/jo101963z
• 作为产物：
  描述：

  1,3二氯-1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷 、 2-氨基腺嘌呤核苷 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以89%的产率得到3′,5′-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxan-1,3-yl)-9-(β-D-ribofuranosyl)purin-2,6-diamine
  参考文献：
  名称：

  合成2' - O-甲基-腺苷和鸟苷及其N-酰基衍生物的改进方法

  摘要：

  我们针对2'- O-甲基腺苷和鸟苷及其N-酰基衍生物开发了几种改进的方法。（a）用N 6 -Bz-腺嘌呤将N 4-乙酰基-5'，3'-二-O-乙酰基-2'- O-甲基胞苷进行糖基化，得到N 6-苯甲酰基-5'3'-二-O -乙酰基-2'- O-甲基腺苷，产率为50％。（b）用MeI / NaH对2-氨基-6-氯嘌呤核糖核苷进行区域选择性甲基化，然后水解，从而以高收率提供了2' - O -Me-鸟苷。相同的2' - O -Me前体被转化为2'- O-Me-腺苷，收率58％。（c）通过5'，3'- O- TIPDSi衍生物的甲基化和选择性的N 2-，将2，6-二氨基嘌呤核糖苷非常有效地转化为N 2-异丁酰基（异丙基苯氧基乙酰基）2' - O - Me-鸟苷。酰化，脱氨基和去甲硅烷基化可提供目标化合物的70％合并收率。（d）N 1 -Bzl-鸟苷的Mg 2+和Ag +定向甲基化以大于80％的产率进行，比率为2'-

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00002-8

文献信息

• Synthesis and cytotoxicity of 9-(2-deoxy-2-alkyldithio-β-<scp>D</scp>-arabinofuranosyl)purine nucleosides which are stable precursors to potential mechanistic probes of ribonucleotide reductases
  作者：Stanislaw F. Wnuk、Elzbieta Lewandowska、Dania R. Companioni、Pedro I. Garcia Jr、John A. Secrist III

  DOI：10.1039/b311504f

  日期：——

  adenine 5[prime or minute]-diphosphate. The arabino 2[prime or minute]-mercapto group might interact with the crucial thiyl radical at cysteine 439 leading to the inhibition of ribonucleotide reductases via formation of a Cys439-2[prime or minute]-mercapto disulfide bridge. The 2,6-diamino-, 2-amino-6-chloro- and 2-amino-6-methoxypurine ribosides were also converted to the corresponding 2[prime or

  合成了一系列2 [prime或min] -thiothiosidesides，作为核糖核苷酸还原酶的潜在抑制剂。用硫代乙酸钾处理3 [主要或分钟]，5 [主要或分钟] -O-TPDS-2 [主要或分钟] -O-（三氟甲磺酰基）腺苷得到2 [主要或分钟] -S的阿拉伯差向异构体-乙酰基-2 [伯或分钟]-硫代腺苷被脱乙酰化，以高收率得到9-（3,5-O-TPDS-2-硫基-小β-d-呋喃糖基）腺嘌呤。用偶氮二羧酸二乙酯-C（3）H（7）SH-THF处理后者，得到2 [伯或分钟]-丙基二硫化物，其被甲硅烷基化得到9-（2-脱氧-2-丙基二硫代-[小β]- d-阿拉伯呋喃糖基）腺嘌呤。随后进行甲苯磺酸化处理（O5 [prime or minutes]），并用焦磷酸酯取代甲苯磺酸酯，以稳定的形式提供了丙基混合二硫化物5 [prime or minutes] -O-diphosphate。其在用二硫
• 2' And 3'-ketonucleosides and their arabino and xylo reduction products
  作者：Fritz Hansske、Danuta Madej、Morris J. Robins

  DOI：10.1016/0040-4020(84)85111-x

  日期：1984.1

  A number of 2',5'- or 3',5'-diprotected ribonucleosides and 5'-protected 2'- or 3'-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl nucleosides have been oxidized to the corresponding 3' or 2'-ketonucleoside derivatives using chromium trioxide/pyridine/acetic anhydride or dimethyl sulfoxide/ acetic anhydride. Reduction of the carbonyl functions with sodium borohydride gave the inverted arabino, xylo, or deoxy-threo

  许多2'，5'-或3'，5'-双保护核糖核苷和5'-保护的2'-或3'-脱氧-β-D-赤型-戊呋喃糖基核苷已被氧化为相应的3'或2使用三氧化铬/吡啶/乙酸酐或二甲基亚砜/乙酸酐的'-酮核苷衍生物。用硼氢化钠还原羰基官能团，可以通过在糖环的受阻较少的α面上进行攻击，使倒位的阿拉伯糖，木糖或脱氧苏糖异构体成为主要产物。通过证明已经发生了原始羟基的完全氧化，使用硼氢化氘化钠的平行还原证实了差向异构体比率。氘标记还有助于进行NMR 频谱分配。
• Synthesis of sugar-modified 2,6-diaminopurine and guanine nucleosides from guanosine via transformations of 2-aminoadenosine and enzymatic deamination with adenosine deaminase
  作者：Morris J. Robins、Ruiming Zou、Fritz Hansske、Stanislaw F. Wnuk

  DOI：10.1139/v97-092

  日期：1997.6.1

  of 2,6-diaminopurine riboside (2-aminoadenosine) with α-acetoxyisobutyryl bromide in acetonitrile gave mixtures of the trans 2′,3′-bromohydrin acetates 2. Treatment of 2 with zinc–copper couple effected reductive elimination, and deprotection gave 2,6-diamino-9-(2,3-dideoxy-β-D-erythro-pent-2-enofuranosyl)purine (3a). Treatment of 2 with Dowex 1 × 2 (OH−) resin in methanol gave the 2′,3′-anhydro derivative

  在乙腈中用 α-乙酰氧基异丁酰溴处理 2,6-二氨基嘌呤核苷（2-氨基腺苷）得到反式 2',3'-溴醇乙酸酯的混合物 2。用锌-铜对处理 2 实现还原消除，脱保护得到2,6-diamino-9-(2,3-dideoxy-β-D-erythro-pent-2-enofuranosyl)purine (3a)。在甲醇中用 Dowex 1 × 2 (OH-) 树脂处理 2 得到 2',3'-脱水衍生物 4。甲硅烷基自由基介导的 2 氢解和脱保护得到 2'-脱氧 6a 和 3'-脱氧 7a 核苷. 用三氟甲磺酰氯 - 4-（二甲氨基）吡啶处理 3',5'-O-（四异丙基二硅氧烷基）衍生物 (5a) 得到 2'-三氟甲磺酸酯 5c。用叠氮化锂-二甲基甲酰胺置换并脱保护得到阿拉伯 2'-叠氮衍生物 8a，将其还原为 2，6-diamino-9-(2-amino-2-deoxy-β-D-arabinofuranosyl)purine
• Oligonucleotides with “Clickable” Sugar Residues: Synthesis, Duplex Stability, and Terminal versus Central Interstrand Cross-Linking of 2′-O-Propargylated 2-Aminoadenosine with a Bifunctional Azide
  作者：Suresh S. Pujari、Peter Leonard、Frank Seela

  DOI：10.1021/jo500392j

  日期：2014.5.16

  Duplex DNA with terminal and internal sugar cross-links were synthesized by the CuAAC reaction from oligonucleotides containing 2′-O-propargyl-2-aminoadenosine as a clickable site and a bifunctional azide (4). Stepwise click chemistry was employed to introduce cross-links at internal and terminal positions. Copper turnings were used as catalyst, reducing the copper load of the reaction mixture and

  CuAAC反应通过含有2' - O-炔丙基-2-氨基腺苷作为可点击位点和双功能叠氮化物的寡核苷酸通过CuAAC反应合成了具有末端和内部糖交联的双链DNA （4）。采用逐步点击化学在内部和末端位置引入交联。铜屑被用作催化剂，减少了反应混合物的铜负荷并避免了络合剂。对于寡核苷酸构件合成，由于两个氨基的相当不同的反应性，开发了用于2' - O-炔丙基-2-氨基腺苷的保护基策略。合成了带有可点击2'- O-炔丙基残基的亚磷酰胺（14和18）以及2'-脱氧呋喃核糖基残基（10）。以2,6-二氨基嘌呤为核碱基的非交联寡核苷酸的杂交实验表明，与含有腺嘌呤的寡核苷酸相比，热稳定性没有明显变化。出人意料的是，保护2-氨基功能的异丁酰基对DNA-DNA和DNA-RNA双链体的稳定性没有负面影响。在末端位置具有交联的2'-O-炔丙基化的2-氨基腺苷（1）和2'-O-炔丙基化的腺苷（3）的寡核苷酸双链体被显着稳定（ΔT
• Robins, Morris J.; Wilson, John S.; Sawyer, Lindsay, Canadian Journal of Chemistry, 1983, vol. 61, p. 1911 - 1920
  作者：Robins, Morris J.、Wilson, John S.、Sawyer, Lindsay、James, Michael N. G.

  DOI：——

  日期：——