3,4-di-O-tert-butyldimethylsilyloxy-2-deoxy-D-ribose | 90344-34-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 3,4-di-O-tert-butyldimethylsilyloxy-2-deoxy-D-ribose
• 英文别名: 3',5'-bis-O-tert-butyldimethylsilyloxy-2'-deoxyribose；3,5-bis<<(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl>oxy>-2-deoxy-D-ribose；3,5-bis-O-(t-butyldimethylsilyl)-2-deoxy-D-ribofuranose；3,5-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-2-deoxy-D-ribofuranose；(4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-ol
• CAS: 90344-34-6
• 化学式: C₁₇H₃₈O₄Si₂
• 分子量: 362.657
• InChiKey: UERDSWOOHQALEH-SNTRVMSOSA-N

物化性质

• 沸点：
  365.3±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.95±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.51
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  47.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,4-di-O-tert-butyldimethylsilyloxy-2-deoxy-D-ribose 在 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 24.0h， 以62%的产率得到2-deoxy-D-ribose
  参考文献：
  名称：

  Yamamoto, Yoshihiro; Kirihata, Mitsunori; Ichimoto, Itsuo, Agricultural and Biological Chemistry, 1985, vol. 49, # 5, p. 1435 - 1440

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  2-deoxy-D-ribose 在 咪唑 、 溴 、 二异丁基氢化铝 作用下， 以 乙醚 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 89.0h， 生成 3,4-di-O-tert-butyldimethylsilyloxy-2-deoxy-D-ribose
  参考文献：
  名称：

  杂环乙烯基-直接和简易合成ç核苷为倒置的碱基对识别的DNA形成三螺旋：通过直接维蒂希航首次报告

  摘要：

  典型地识别特定基因序列的能力将为遗传干预提供精确的手段。然而，目前仍然难以确定通过三链体形成寡核苷酸（TFO）将四个可能的碱基对中的两个特异性识别为X·T-A和Y·C-G。提出了一系列的C1-乙烯基核苷，并通过分子动力学模拟对其稳定性和特异性进行了广泛的评估。由于大多数C核苷合成都是通过在C1位置进行直接取代而扩展的，因此本文介绍了通过直接Wittig偶联合成它们的更方便的策略。

  DOI：

  10.1021/jo062206+

文献信息

• A Systematic Study of the Synthesis of 2ʹ-Deoxynucleosides by Mitsunobu Reaction
  作者：Kohji Seio、Munefumi Tokugawa、Kazuhei Kaneko、Takashi Shiozawa、Yoshiaki Masaki

  DOI：10.1055/s-0036-1588445

  日期：2017.9

  preparation of synthetic 2′-deoxynucleosides, which have various biological and biotechnological applications. In this work, the Mitsunobu-based synthesis of 2′-deoxynucleosides was systematically studied. The effect of phosphine, azodicarbonyl reagent, and solvent on the product yield and α/β ratio was investigated, and the highest yield and β-selectivity were obtained using ( n -Bu) 3 P and 1,1′-(azodic

  Mitsunobu 反应已成为制备具有各种生物学和生物技术应用的合成 2'-脱氧核苷的重要替代方法。在这项工作中，系统研究了基于光信的 2'-脱氧核苷合成。考察了膦、偶氮二羰基试剂和溶剂对产物收率和α/β比的影响，使用( n -Bu) 3 P和1,1'-(偶氮二羰基)二哌啶获得了最高的收率和β-选择性在 DMF 中。该反应成功地应用于各种核碱基类似物。
• Diastereofacial selection in nitrile oxide cycloaddition reactions. The anti-directing effect of an allylic oxygen and some new results on the ring metalation of isoxazolines. A synthesis of (.+-.)-blastmycinone
  作者：Alan P. Kozikowski、Arun K. Ghosh

  DOI：10.1021/jo00189a024

  日期：1984.7

  the adducts to known γ-lactones. The stereochemistry associated with the metalation/alkylation of 5-alkoxymethyl-substituted isoxazolines has also been probed in order to further expand the use of these heterocycles as aldol equivalents in natural products total synthesis. A synthesis of (±)-blastmycinone (34) is reported which combines the two foregoing aspects of stereocontrol. The levels of regio-

  已经研究了与腈氧化物与带有烯丙基氧取代基的烯烃的反应有关的非对映选择性的程度。当3-丁烯-2-醇（5）或（+）-（S）-异亚丙基-3-丁烯-1,2-二醇（1）的叔丁基二甲基甲硅烷基醚衍生物为1时，已发现合理的非对映选择性水平。用作双极亲虫。这些环加成反应的立体化学过程已通过将加合物转化为已知的γ-内酯的方法得到严格证明。还探索了与5-烷氧基甲基取代的异恶唑啉的金属化/烷基化有关的立体化学，以进一步扩展这些杂环作为天然产物总合成中的羟醛等效物的用途。据报道，（±）-blastcincinone（34）的合成结合了立体声控制的上述两个方面。还讨论了在由异亚丙基-D-甘油醛制得的顺式和反式二取代的烯烃35和39的环加成反应中发现的区域选择性和立体选择性。给出了手性烯烃与手性腈的反应的单个例子。
• Design, synthesis, and biological evaluation of C1–phosphonamidate analogues of 2-deoxy-d-ribose-1-phosphate
  作者：Maurizio Quintiliani、Jan Balzarini、Christopher McGuigan

  DOI：10.1016/j.tet.2013.08.038

  日期：2013.10

  hate. A number of synthetic routes were explored for the preparation of these targets. The successful approach involved the synthesis of a protected C1–phosphonate ester 17 via Michaelis–Arbuzov reaction, which was then hydrolysed and coupled with different amino acid esters using aldrithiol. Subsequent hydrogenolysis afforded the targets 2a–g, which were isolated as a mixture of diastereoisomers.

  一种新颖的一系列苯氧基C1-磷酰胺衍生物的2-脱氧d -核糖已被合成为2-脱氧- α-的稳定类似物d -核糖-1-磷酸。许多合成路线进行了探讨这些目标的准备。成功办法涉及被保护的C1-膦酸酯的合成17经由米歇尔-阿尔布佐夫反应，然后将其水解并加上使用aldrithiol不同氨基酸的酯。随后的氢解，得到目标2A -克，将其分离为对映异构体的混合物。将化合物测定抑制胸苷磷酸化酶（TP）和尿苷磷酸化酶（UP）和用于抗病毒和细胞生长抑制活性。
• Synthesis of Oligonucleotides and Thermal Stability of Duplexes Containing the β-C-Nucleoside Analogue of Fapy·dG
  作者：Michael O. Delaney、Marc M. Greenberg

  DOI：10.1021/tx025588x

  日期：2002.11.1

  in DNA is unknown. Nonepimerizable, nonhydrolyzable analogues are useful probes for investigating the configuration of Fapy lesions in DNA and as potential enzyme inhibitors. The beta-C-nucleoside of Fapy.dG has been prepared and introduced sight-specifically into oligonucleotides via its respective beta-cyanoethyl phosphoramidite. The phosphoramidite was prepared via a Wittig reaction between a protected

  当DNA暴露于氧化应激时，会形成大量的甲酰嘧啶病灶（Fapy.dA，Fapy.dG）。这些损伤是不常见的，因为它们易于在溶液中发生差向异构。DNA中构型异构体的分布是未知的。不可融合，不可水解的类似物是用于研究DNA中Fapy损伤的构型的有用探针，并可用作潜在的酶抑制剂。已经制备了Fapy.dG的β-C-核苷，并通过其各自的β-氰乙基亚磷酰胺将其视觉特异性地引入了寡核苷酸。通过保护形式的脱氧核糖和适当官能化的嘧啶之间的Wittig反应制备亚磷酰胺。嘧啶在O4和O2位置分别含有甲基和2-丙基，在C-核苷形成后区分它们。甲酰胺衍生自C5处的硝基。通过使用四唑作为活化剂的单次15分钟偶联，以80％的产率偶联亚磷酰胺。制备了多达36个核苷酸的寡核苷酸，并通过ESI-MS进行了表征。
• Solution Structure, Mechanism of Replication, and Optimization of an Unnatural Base Pair
  作者：Denis A. Malyshev、Danielle A. Pfaff、Shannon I. Ippoliti、Gil Tae Hwang、Tammy J. Dwyer、Floyd E. Romesberg

  DOI：10.1002/chem.201000959

  日期：2010.11.8

  effort to expand the genetic alphabet for in vitro and eventual in vivo applications, we have synthesized a wide variety of predominantly hydrophobic unnatural base pairs and evaluated their replication in DNA. Collectively, the results have led us to propose that these base pairs, which lack stabilizing edge‐on interactions, are replicated by means of a unique intercalative mechanism. Here, we report

  作为为体外和最终在体内应用扩展遗传字母表的持续努力的一部分，我们合成了多种主要为疏水性的非天然碱基对，并评估了它们在 DNA 中的复制。总的来说，这些结果使我们提出，这些缺乏稳定的边缘相互作用的碱基对是通过独特的插入机制复制的。在此，我们报道了核苷酸类似物d三个新衍生物的合成和表征mmO2公司，形成人工碱基对与所述核苷酸类似物d 5SICS。用环状呋喃环替换 d MMO2的对甲基取代基（产生 d FMO) 对复制有显着的负面影响，同时用甲氧基 (d DMO ) 或硫甲基 (d TMO )代替它可以改善稳态测定和 PCR 扩增过程中的复制。因此，d TMO –d 5SICS，尤其是d DMO –d 5SICS，代表了遗传字母表扩展的重大进展。为了阐明控制非自然碱基对复制的构效关系，我们确定了含有亲本 d MMO2 –d 5SICS的双链 DNA 的溶液结构对，并且还使用这种结构来生成衍生碱基