(S-geranylgeranyl)-L-cycteine methyl ester | 136238-12-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: (S-geranylgeranyl)-L-cycteine methyl ester
• 英文别名: S-geranylgeranyl-L-cysteine methyl ester；2-amino-3-(3,7,11,15-tetramethyl-hexadeca-2,6,10,14-tetraenylsulfanyl)-propionic acid methyl ester；methyl (2R)-2-amino-3-[(2E,6E,10E)-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenyl]sulfanylpropanoate
• CAS: 136238-12-5
• 化学式: C₂₄H₄₁NO₂S
• 分子量: 407.661
• InChiKey: ACBNBVMNWGQQAZ-ZWHSGZICSA-N

物化性质

• 沸点：
  508.6±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.970±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  77.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S-geranylgeranyl)-L-cycteine methyl ester 在 1-羟基苯并三唑 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 二乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.5h， 生成 L-seryl-S-geranylgeranyl-L-cysteyl-L-seryl-S-geranylgeranyl-L-cysteine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  荧光标记的单和二异戊二烯化 Rab7 GTPase 的合成

  摘要：

  用类异戊二烯脂质修饰蛋白质是真核生物中普遍存在的现象，由于其参与了包括癌症在内的多种疾病的进展，因此受到了广泛关注。异戊二烯化蛋白质的研究进展受到与从天然或重组来源分离这些蛋白质相关的困难的阻碍。Rab 家族的小 GTP 酶是一个特别困难的例子，因为它们在 C 端双香叶基香叶基化，并且在某些情况下是甲基化的。在这里，我们报告了使用化学合成和表达的蛋白质连接的组合来合成单和二香叶基香叶基化荧光 RabGTPases 的有效且通用的策略。使用这种方法，我们生成了荧光单和二异戊二烯化 Rab7 蛋白，这些蛋白显示出近乎天然的特性，并与其天然伴侣 REP-1 形成化学计量复合物。我们证明了由半合成单异戊二烯化 Rab7 和 REP-1 形成的复合物代表了 Rab 异戊二烯化反应的真正中间体，因此为研究 Rab 异戊二烯化机制提供了独特的工具。半合成的 Rab7 蛋白被用于开发一种新型的基于荧光的体

  DOI：

  10.1021/ja046164n
• 作为产物：
  描述：

  香叶基香叶醇 在 N-氯代丁二酰亚胺 、 二甲基硫 、 氨 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 (S-geranylgeranyl)-L-cycteine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  荧光标记的单和二异戊二烯化 Rab7 GTPase 的合成

  摘要：

  用类异戊二烯脂质修饰蛋白质是真核生物中普遍存在的现象，由于其参与了包括癌症在内的多种疾病的进展，因此受到了广泛关注。异戊二烯化蛋白质的研究进展受到与从天然或重组来源分离这些蛋白质相关的困难的阻碍。Rab 家族的小 GTP 酶是一个特别困难的例子，因为它们在 C 端双香叶基香叶基化，并且在某些情况下是甲基化的。在这里，我们报告了使用化学合成和表达的蛋白质连接的组合来合成单和二香叶基香叶基化荧光 RabGTPases 的有效且通用的策略。使用这种方法，我们生成了荧光单和二异戊二烯化 Rab7 蛋白，这些蛋白显示出近乎天然的特性，并与其天然伴侣 REP-1 形成化学计量复合物。我们证明了由半合成单异戊二烯化 Rab7 和 REP-1 形成的复合物代表了 Rab 异戊二烯化反应的真正中间体，因此为研究 Rab 异戊二烯化机制提供了独特的工具。半合成的 Rab7 蛋白被用于开发一种新型的基于荧光的体

  DOI：

  10.1021/ja046164n

文献信息

• Synthesis of prenylated cysteines from serine derivatives
  作者：William W. Epstein、Zhaolin Wang

  DOI：10.1039/a700428a

  日期：——

  Prenylated cysteines are prepared by the reaction of serineβ-lactone with prenyl thiolate.

  卤代半胱氨酸是通过丝氨酸β-内酯与卤代硫酸酯反应制备的。
• Synthetic Optimization and MAPK Pathway Activation Anticancer Mechanism of Polyisoprenylated Cysteinyl Amide Inhibitors
  作者：Nada Tawfeeq、Yonghao Jin、Nazarius S. Lamango

  DOI：10.3390/cancers13225757

  日期：——

  Abnormalities of the MAPK pathway play vital roles in cancer initiation and progression. RAS GTPases that are key upstream mediators of the pathway are mutated in 30% of human cancers. Polyisoprenylated cysteinyl amide inhibitors (PCAIs) were designed as potential targeted therapies against the RAS-driven cancers. The current study reports on the optimization of the PCAIs and the determination of their mechanisms of action in KRAS-mutant cancer cells. They display ClogP values ranging from 3.01 to 6.35, suppressing the viabilities of KRAS-mutant MDA-MB-231, A549, MIA PaCa-2, and NCI-H1299 cells in 2D and 3D cultures with EC50 values of 2.2 to 6.8, 2.2 to 7.6, 2.3 to 6.5 and 5.0 to 14 µM, respectively. When A549 cells were treated with the PCAIs, NSL-YHJ-2-27, for 48 h, no significant difference was observed in the levels of total or phosphorylated B- and C-Raf proteins. However, at 5 µM, it stimulated the phosphorylation of MEK1/2, ERK1/2, and p90RSK by 84%, 59%, and 160%, respectively, relative to controls. A non-farnesylated analog, NSL-YHJ-2-62, did not elicit similar effects. These data reveal that effects on the RAS-MAPK signaling axis most likely contribute to the anticancer effects of the PCAIs, possibly through the proapoptotic isoforms of p90RSK. The PCAIs may thus have the potential to serve the unmet therapeutic needs of patients with aberrant hyperactive G-protein signaling.

  MAPK通路异常在癌症的发生和发展中起着至关重要的作用。作为该通路的关键上游介质，RAS GTP酶在30%的人类癌症中发生突变。聚异戊二烯基半胱氨酸酰胺抑制剂（PCAIs）被设计为针对RAS驱动的癌症的潜在靶向治疗。当前研究报告了PCAIs的优化以及确定它们在KRAS突变癌细胞中的作用机制。它们的ClogP值范围从3.01到6.35，抑制了KRAS突变的MDA-MB-231、A549、MIA PaCa-2和NCI-H1299细胞在2D和3D培养中的存活率，相应的EC50值分别为2.2至6.8、2.2至7.6、2.3至6.5和5.0至14微米。当A549细胞用PCAIs NSL-YHJ-2-27处理48小时时，总体或磷酸化的B-和C-Raf蛋白水平没有显著差异。然而，在5微米时，相对于对照组，它分别刺激了MEK1/2、ERK1/2和p90RSK的磷酸化分别增加了84%、59%和160%。一种非法尼醇化的类似物NSL-YHJ-2-62没有产生类似效果。这些数据揭示了PCAIs对RAS-MAPK信号通路的影响很可能是其抗癌作用的原因，可能是通过p90RSK的凋亡诱导亚型。因此，PCAIs可能有潜力满足患有异常高活性G蛋白信号的患者的治疗需求。
• Synthesis of characteristic lipopeptides of lipid modified proteins employing the allyl ester as protecting group
  作者：Thierry Schmittberger、Alain Cotté

  DOI：10.1039/a708749g

  日期：——

  Lipidated peptides which represent characteristic lipid modified substructures of lipidated human GαO protein and the human N- and R-Ras proteins were built up efficiently by employing the selective Pd0-mediated removal of allyl esters under very mild conditions as the key step.

  在非常温和的条件下，通过选择性 Pd0 介导的烯丙基酯去除作为关键步骤，有效地构建了代表脂质化人类 GαO 蛋白、人类 N- 和 R-Ras 蛋白脂质化修饰亚结构的脂质化肽。
• Intein-Mediated Synthesis of Geranylgeranylated Rab7 Protein in Vitro
  作者：Kirill Alexandrov、Ines Heinemann、Thomas Durek、Vadim Sidorovitch、Roger S. Goody、Herbert Waldmann

  DOI：10.1021/ja017799e

  日期：2002.5.1

  recombinant proteins is an important prerequisite for biotechnology and life sciences in general. However, there is a paucity of methods for production of posttranslationally modified recombinant proteins or proteins with non-native functional groups, such as fluorophores, spin labels, and so forth. In this work we have used a combination of organic synthesis and in vitro protein ligation to construct

  重组蛋白的生产通常是生物技术和生命科学的重要先决条件。然而，生产翻译后修饰的重组蛋白或具有非天然官能团（如荧光团、自旋标记等）的蛋白质的方法很少。在这项工作中，我们使用有机合成和体外蛋白质连接的组合来构建单异戊二烯化 Rab7 GTPase。该蛋白质是从重组 N 端部分和模拟 Rab7 C 端的肽制备的。为了构建合成的六个氨基酸长的荧光单异戊二烯化肽，我们使用了块缩合策略。以>70% 的产率实现连接。通过有机萃取和相分配和重折叠的组合，从未连接的肽中纯化所得蛋白质。重折叠的单异戊二烯化半合成 Rab7 蛋白 (Rab7GG) 与其天然伴侣 REP-1（Rab 护送蛋白 1）形成稳定的复合物，并可作为酶促异戊二烯化反应中第二个异戊二烯基团的受体。使用荧光光谱，我们表征了 Rab7GG:REP-1 复合物与 Rab 香叶基香叶基转移酶的相互作用，并得出结论，它是异戊二烯化反应的真正中间体。因此
• Degradation of Rat Sarcoma Proteins Targeting the Post-Translational Prenyl Modifications via Cascade Azidation/Fluorination and Click Reaction
  作者：Hongling Zhou、Youfang Gan、Yuanyuan Li、Xiaoqian Chen、Yuyang Guo、Rui Wang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.2c01721

  日期：2023.6.8

  Protein degradation is emerging as a powerful strategy to modulate protein functions and alter cellular signaling pathways. Proteolysis-targeting chimeras (PROTACs) have been used to degrade a range of “undruggable” proteins in cells. Here, we present a type of chemically catalyzed PROTAC to induce rat sarcoma (RAS) degradation based on the chemistry of post-translational prenyl modification. Trimethylsilyl

  蛋白质降解正在成为调节蛋白质功能和改变细胞信号传导途径的强大策略。蛋白水解靶向嵌合体（PROTAC）已被用来降解细胞中一系列“不可成药”的蛋白质。在这里，我们提出了一种基于翻译后异戊二烯基修饰的化学催化 PROTAC 来诱导大鼠肉瘤 (RAS) 降解。使用三甲基硅基叠氮化物和 Selectflor 对 RAS 蛋白 Caax 基序上的异戊二烯基修饰进行化学标记，并使用炔丙基泊马度胺探针进行连续点击反应，以降解多个细胞中异戊二烯化的 RAS。因此，该方法成功应用于降解多种癌细胞系中的 RAS，包括 HeLa、HEK 293T、A549、MCF-7 和 HT-29。