5-O-(4-甲基苯基磺酰基)胸腺嘧啶脱氧核苷 | 7253-19-2

• 物质功能分类: 医药中间体 - 杂环化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 5-O-(4-甲基苯基磺酰基)胸腺嘧啶脱氧核苷
• 中文别名: 5`-对甲苯磺酯胸苷
• 英文名称: 5'-O-(p-toluenesulfonyl)thymidine
• 英文别名: 5'-O-tosylthymidine；[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl 4-methylbenzenesulfonate
• CAS: 7253-19-2
• 化学式: C₁₇H₂₀N₂O₇S
• 分子量: 396.421
• InChiKey: RSEWNGNFIIXLHN-RRFJBIMHSA-N

物化性质

• 熔点：
  >161°C (dec.)
• 密度：
  1.425±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于DMSO（少许）、甲醇（少许）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 危险品标志：
  Xi

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-O-(4-甲基苯基磺酰基)胸腺嘧啶脱氧核苷 在 氨 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 9.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  亚磷酰胺化学合成含2'-脱氧异鸟苷和2'-脱氧-5-甲基异胞苷的寡核苷酸

  摘要：

  描述了在固相寡核苷酸合成中使用亚磷酰胺化学合成包含2'-脱氧-5-甲基异胞苷和2'-脱氧异鸟苷的寡核苷酸。支持先前的观察，发现N，N-二异丁基甲am部分是对于2'-脱氧-5-甲基异胞嘧啶而言比N-苯甲酰基更好的保护基。2′-脱氧-N 2 -[（（二异丁基氨基）亚甲基] -5′-（（4,4′-二甲氧基叔丁基）-5-甲基异胞苷3′-（2-氰基乙基二异丙基磷酰胺基）（1c）根据二甲氧基三苯甲基的释放，在标准的自动合成方案中掺入了多个连续的残基，偶联效率> 99％使用2'-脱氧-N 6 -[（（二异丁基氨基）亚甲基] -5'- O-（二甲氧基三苯甲基）-O 2-（二苯基氨基甲酰基）异鸟苷，3'-（2-氰基乙基）将标准方案的偶联时间延长至≥600s根据二甲氧基三苯甲基的释放，二异丙基亚磷酰胺（7e）成功结合了多个连续的2'-脱氧异鸟苷碱，偶联效率> 97％。

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810502
• 作为产物：
  描述：

  beta-胸苷 在 吡啶 、 对甲苯磺酰氯 作用下， 生成 5-O-(4-甲基苯基磺酰基)胸腺嘧啶脱氧核苷
  参考文献：
  名称：

  Solid-phase synthesis and evaluation of TAR RNA targeted β-carboline–nucleoside conjugates

  摘要：

  我们合成了四种δ-咔啉核苷共轭物。亲和毛细管电泳分析了这些δ-咔啉核苷共轭物 4â11、13 和 15 与 TAR RNA 的结合亲和力。与 TAR RNA 的结合亲和力数据显示，轭合物 9 和 13 的结合力强于母体化合物 MC3。计算机建模表明，δ-咔啉核苷共轭物 13 能与 TAR RNA 的 UCU 三核苷酸隆起区吻合。

  DOI：

  10.1039/b809598a

文献信息

• Introduction of an alkyl group into the sugar portion of uracilnucleosides by the use of Gilman reagents.
  作者：Hiroyuki HAYAKAWA、Hiroshi ASHIZAWA、Hiromichi TANAKA、Tadashi MIYASAKA

  DOI：10.1248/cpb.38.355

  日期：——

  Substitution of a p-toluenesulfonyloxy group in the sugar portion of uracilnucleosides by an alkyl group was investigated by using Gilman reagents (R2CuLi). In the cases of 5'-O-tosyl derivatives of 2', 3'-O-isopropylideneuridine, moderate vields of 5'-alkylated products were obtained. In contrast to this, the reactions of the corresponding 2'-deoxyuridine derivatives gave higher yields of products. A similar substitution reaction at the 3'-position of 2'-deoxyuridine derivatives was also examined.

  用Gilman试剂（R2CuLi）研究了尿嘧啶核苷糖部分的p-甲苯磺酰氧基被烷基取代的反应。对于2',3'-O-异亚丙基尿苷的5'-O-甲苯磺酸衍生物，得到了中等收率的5'-烷基化产物。与此相反，相应的2'-脱氧尿苷衍生物的反应则得到了更高收率的产物。还考察了在2'-脱氧尿苷衍生物的3'位进行类似取代反应的情况。
• Design, Synthesis and Biological Evaluation of Novel Anthraniloyl-AMP Mimics as PQS Biosynthesis Inhibitors Against Pseudomonas aeruginosa Resistance
  作者：Shekh Sabir、Sujatha Subramoni、Theerthankar Das、David StC. Black、Scott A. Rice、Naresh Kumar

  DOI：10.3390/molecules25133103

  日期：——

  therefore, it is an attractive target for the development of anti-virulence therapeutics against Pseudomonas resistance. Herein, we report the design and synthesis of novel triazole nucleoside-based anthraniloyl- adenosine monophosphate (AMP) mimics. These analogues had a major impact on the morphology of bacterial biofilms and caused significant reduction in bacterial aggregation and population density

  假单胞菌喹诺酮系统 (PQS) 是铜绿假单胞菌中三个主要相互连接的群体感应信号系统之一。毒力因子 PQS 和 HHQ 激活转录调节因子 PqsR (MvfR)，它控制细菌中的多种活动，包括生物膜形成和 PQS 生物合成的上调。邻氨基苯甲酰辅酶A合成酶（PqsA）催化喹诺酮类生物合成的第一步和关键步骤；因此，它是开发针对假单胞菌耐药性的抗毒力疗法的一个有吸引力的目标。在此，我们报告了基于三唑核苷的新型邻氨基苯甲酰腺苷单磷酸 (AMP) 模拟物的设计和合成。这些类似物对细菌生物膜的形态有重大影响，并导致细菌聚集和种群密度显着降低。然而，这些化合物对 PQS 的抑制作用有限，对绿脓素的产生没有任何影响。
• Tightly linked morpholino-nucleoside chimeras: new, compact cationic oligonucleotide analogues
  作者：Nóra Debreczeni、Miklós Bege、Mihály Herczeg、Ilona Bereczki、Gyula Batta、Pál Herczegh、Anikó Borbás

  DOI：10.1039/d1ob01174j

  日期：——

  cellular uptake and is therefore a major obstacle to the biological application of native oligonucleotides. Backbone modifications, particularly charge alterations is a proven strategy to provide artificial oligonucleotides with improved properties. Here, we describe the synthesis of a new type of oligonucleotide analogues consisting of a morpholino and a ribo- or deoxyribonucleoside in which the 5′-amino

  核酸的聚阴离子磷酸二酯主链导致高核酸酶敏感性和低细胞摄取，因此是天然寡核苷酸的生物应用的主要障碍。主链修饰，特别是电荷改变是一种经过验证的策略，可以提供具有改进特性的人工寡核苷酸。在这里，我们描述了由吗啉代和核糖或脱氧核糖核苷组成的新型寡核苷酸类似物的合成，其中核苷单元的5'-氨基提供吗啉环的氮。该合成方案与三苯甲基和二甲氧基三苯甲基保护基团和叠氮基官能团兼容，并扩展到高级低聚物的合成。由于吗啉单元的N-烷基化叔胺结构，嵌合体在水介质中带正电荷。
• Sulfonate derived phosphoramidates as active intermediates in the enzymatic primer-extension of DNA
  作者：S. De、E. Groaz、L. Margamuljana、M. Abramov、P. Marlière、P. Herdewijn

  DOI：10.1039/c5ob00157a

  日期：——

  The incorporation and extension of synthetically unprecedented nucleoside phosphoramidate sulfonates is demonstrated using thermophilic and mesophilic microbial polymerases.

  使用嗜热和中温微生物聚合酶展示了合成前所未有的核苷酸磷酸酰胺磺酸盐的合并和扩展。
• Synthesis and biological assay of new 2’-deoxyuridine dimers containing a 1,2,3-triazole linker. Part I
  作者：Lucyna Michalska、Dariusz Wawrzyniak、Agnieszka Szymańska-Michalak、Jan Barciszewski、Jerzy Boryski、Dagmara Baraniak

  DOI：10.1080/15257770.2018.1514122

  日期：2019.3.4

  Abstract We describe a simple method for the synthesis of modified dinucleosides containing pyrimidine nucleoside analogues (2’-deoxyuridine, thymidine and 5-fluoro-2’-deoxyuridine). Six different dimers with a 1,2,3-triazole linkage were obtained by azide–alkyne 1,3-dipolar cycloaddition (click reaction), starting from propargylated 2’-deoxyuridine and 5’-azido-nucleoside derivatives. Their cytotoxic

  摘要我们描述了一种简单的合成修饰的二核苷的方法，该修饰的二核苷含有嘧啶核苷类似物（2'-脱氧尿苷，胸苷和5-氟-2'-脱氧尿苷）。通过叠氮化物-炔烃1,3-偶极环加成反应（点击反应），从炔丙基化2'-脱氧尿苷和5'-叠氮基-核苷衍生物开始，获得了具有1,2,3-三唑键的六种不同的二聚体。在五种人类癌细胞系中测试了它们的细胞毒性活性：宫颈癌（HeLa），高级神经胶质瘤（U-118 MG，U-87 MG，T98G），肝脏（HepG2）和正常人类成纤维细胞系（MRC-5）使用磺基罗丹明B（SRB）分析。实验表明，所获得的具有1,2,3-三唑部分的二聚体是非常稳定的化合物，在生理样介质中也没有抗癌活性。