3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-deoxy-5'-methylthymidine | 129802-02-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-deoxy-5'-methylthymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-ethyloxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 129802-02-4
• 化学式: C₁₇H₃₀N₂O₄Si
• 分子量: 354.522
• InChiKey: RDDPDVHATDCZNZ-HZSPNIEDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.93
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.76
• 拓扑面积：
  67.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-deoxy-5'-methylthymidine 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 3.0h， 以89%的产率得到5'-deoxy-5'-methylthymidine
  参考文献：
  名称：

  Introduction of an alkyl group into the sugar portion of uracilnucleosides by the use of Gilman reagents.

  摘要：

  用Gilman试剂（R2CuLi）研究了尿嘧啶核苷糖部分的p-甲苯磺酰氧基被烷基取代的反应。对于2',3'-O-异亚丙基尿苷的5'-O-甲苯磺酸衍生物，得到了中等收率的5'-烷基化产物。与此相反，相应的2'-脱氧尿苷衍生物的反应则得到了更高收率的产物。还考察了在2'-脱氧尿苷衍生物的3'位进行类似取代反应的情况。

  DOI：

  10.1248/cpb.38.355
• 作为产物：
  描述：

  5-O-(4-甲基苯基磺酰基)胸腺嘧啶脱氧核苷 在 咪唑 、 copper(l) iodide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-deoxy-5'-methylthymidine
  参考文献：
  名称：

  Introduction of an alkyl group into the sugar portion of uracilnucleosides by the use of Gilman reagents.

  摘要：

  用Gilman试剂（R2CuLi）研究了尿嘧啶核苷糖部分的p-甲苯磺酰氧基被烷基取代的反应。对于2',3'-O-异亚丙基尿苷的5'-O-甲苯磺酸衍生物，得到了中等收率的5'-烷基化产物。与此相反，相应的2'-脱氧尿苷衍生物的反应则得到了更高收率的产物。还考察了在2'-脱氧尿苷衍生物的3'位进行类似取代反应的情况。

  DOI：

  10.1248/cpb.38.355

文献信息

• Synthesis, Dynamic Combinatorial Chemistry, and PCR Amplification of 3′-5′ and 3′-6′ Disulfide-linked Oligonucleotides
  作者：Dennis Jul Hansen、Ilenia Manuguerra、Michael Brøndum Kjelstrup、Kurt Vesterager Gothelf

  DOI：10.1002/anie.201405761

  日期：2014.12.22

  Disulfide dithymidines linked 3′–5′ or 3′–6′ were synthesized and incorporated into oligonucleotides through a combined phosphotriester and phosphoramidite solid‐phase oligonucleotide synthesis approach. The disulfide links are cleaved and formed reversibly in the presence of thiols and oligonucleotides. This link was shown to be sequence‐adaptive in response to given templates in the presence of mercaptoethanol

  合成了通过3'-5'或3'-6'连接的二硫二胸苷，并通过磷酸三酯和亚磷酰胺固相寡核苷酸合成方法将其掺入寡核苷酸。在硫醇和寡核苷酸的存在下，二硫键被裂解并可逆地形成。在存在巯基乙醇的情况下，该链接显示出对指定模板的序列适应性。在聚合酶链反应（PCR）中，聚合酶可以耐受人工的3'-5'和3'-6'二硫键。通过使用测序分析，我们显示了单个突变经常在PCR的扩增产物中随机发生。
• HAYAKAWA, HIROYUKI;ASHIZAWA, HIROSHI;TANAKA, HIROMICHI;MIYASAKA, TADASHI, CHEM. AND PHARM. BULL., 38,(1990) N, C. 355-360
  作者：HAYAKAWA, HIROYUKI、ASHIZAWA, HIROSHI、TANAKA, HIROMICHI、MIYASAKA, TADASHI

  DOI：——

  日期：——