5-氨基-6-核糖基氨基-2,4-(1H,3H)嘧啶二酮 | 17014-74-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 5-氨基-6-核糖基氨基-2,4-(1H,3H)嘧啶二酮
• 英文名称: 5-amino-6-(D-ribitylamino)uracil
• 英文别名: 5-amino-6-ribitylamino-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione；5-amino-6-(D-ribitylamino)-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione；5-amino-6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 17014-74-3
• 化学式: C₉H₁₆N₄O₆
• 分子量: 276.249
• InChiKey: XKQZIXVJVUPORE-RPDRRWSUSA-N

物化性质

• 密度：
  1.67±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMSO（少许）、甲醇（少许）、水（少许）
• 物理描述：
  Solid

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.2
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  177
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  8

制备方法与用途

5-氨基-6-(D-核糖酰氨基)尿嘧啶（5-A-RU）是细菌核黄素的一种前体，同时也是粘膜相关不变T（MAIT）细胞的激活剂。它通过与来自其他代谢途径的小分子（如乙二醛和甲基乙二醛）进行非酶反应，形成有效的MAIT细胞激活抗原。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-氨基-6-核糖基氨基-2,4-(1H,3H)嘧啶二酮 在 lumazine synthase 、 riboflavin synthase 、 sodium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 维生素 B2
  参考文献：
  名称：

  Lumazine 合酶和核黄素合酶的 O-核苷、S-核苷和 N-核苷探针

  摘要：

  Lumazine 合酶催化核黄素生物合成的倒数第二步，而核黄素合酶催化最后一步。O-核苷、S-核苷和N已经合成了假设的 lumazine 生物合成中间体的核苷类似物，以获得这两种酶的结构和机制探针，以及作为抗生素具有潜在价值的抑制剂。设计了在其他容易还原的官能团存在下通过在 Lindlar 催化剂上受控氢解来选择性裂解苄基保护基团的方法。脱保护反应在其他反应性官能团（包括硝基、烯烃和卤素）的存在下进行。目标化合物作为从各种微生物获得的 lumazine 合酶和核黄素合酶的抑制剂进行了测试。一般来说，S-核苷和N-核苷比相应的O-核苷更有效核苷作为 lumazine 合酶和核黄素合酶抑制剂，而C-核苷的效力最低。进行了一系列分子动力学模拟，然后使用泊松-玻尔兹曼/表面积 (MM-PBSA) 方法进行自由能计算，以使配体与 lumazine 合酶结合的结果合理化，结果提供了对配体结合以及稳定酶催化反应中的中间体的分子力。

  DOI：

  10.1021/jo3010364
• 作为产物：
  描述：

  卡培他滨杂质25 在 ammonium hydroxide 、 ammonium acetate 、 铁粉 、 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 、 sodium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 5-氨基-6-核糖基氨基-2,4-(1H,3H)嘧啶二酮
  参考文献：
  名称：

  MR1配体糖类似物对粘膜相关不变T（MAIT）细胞活化的影响。

  摘要：

  粘膜相关不变T（MAIT）细胞是最近鉴定的先天样T淋巴细胞的一个子集，它们似乎在从病毒和细菌感染到自身免疫性疾病和癌症的许多病理中起着重要作用。MAIT细胞通过MR1在MAIT T细胞受体（TCR）的抗原呈递细胞上呈递配体而被激活，但是很少有研究探索系统改变配体结构对MR1结合和MAIT细胞活化的影响。在此，我们报道了关于已知MAIT细胞激动剂7-羟基-6-甲基-8-d-ribityllumazine（RL-6-Me-7-OH）和5中糖基序变化的影响的首次研究。 （2-氧代丙基亚氨基）-6-d-核糖基氨基尿嘧啶（5-OP-RU）。MAIT细胞的四聚体染色显示缺少2' lumazines的糖主链上的-羟基基团改善了MR1-MAIT TCR结合，这可以使用计算对接研究进行合理化。尽管没有一种二嗪类化合物激活MAIT细胞，但所有5-OP-RU类似物均显示出显着的MAIT细胞激活，其中几种类似物的

  DOI：

  10.1039/c9ob01436e

文献信息

• [EN] MAIT CELL AGONISTS<br/>[FR] AGONISTES DE CELLULES MAIT
  申请人：VICTORIA LINK LTD

  公开号：WO2019058289A1

  公开（公告）日：2019-03-28

  The invention relates to peptide conjugates of Formula (I). The peptide conjugates of the invention have activity as MAIT agonists. The peptide conjugates of the invention also enhance immune responses and therefore are effective vaccines and vaccine adjuvants. The invention also relates to methods and uses of such conjugates.

  本发明涉及式(I)的肽偶联物。发明的肽偶联物具有作为MAIT激动剂的活性。发明的肽偶联物还能增强免疫应答，因此是有效的疫苗和疫苗佐剂。本发明还涉及这些偶联物的方法和应用。
• Design, Synthesis, and Evaluation of 6-Carboxyalkyl and 6-Phosphonoxyalkyl Derivatives of 7-Oxo-8-ribitylaminolumazines as Inhibitors of Riboflavin Synthase and Lumazine Synthase
  作者：Mark Cushman、Donglai Yang、Stefan Gerhardt、Robert Huber、Markus Fischer、Klaus Kis、Adelbert Bacher

  DOI：10.1021/jo0201631

  日期：2002.8.1

  6-carboxyalkyl and 6-phosphonoxyalkyl derivatives of 7-oxo-8-D-ribityllumazine were synthesized as inhibitors of both Escherichia coli riboflavin synthase and Bacillus subtilis lumazine synthase. The compounds were designed to bind to both the ribitylpurine binding site and the phosphate binding site of lumazine synthase. In the carboxyalkyl series, maximum activity against both enzymes was observed with the

  合成了一系列7-氧代-8-D-ribityllumazine的6-羧基烷基和6-膦氧基烷基衍生物，作为大肠杆菌核黄素合酶和枯草芽孢杆菌lumazine合酶的抑制剂。这些化合物被设计为既与核苷嘌呤结合位点结合，又与鲁嗪合酶的磷酸结合位点结合。在羧烷基系列中，对于3'-羧丙基化合物22，观察到了对两种酶的最大活性。延长或缩短一个碳原子连接羧基与lumazine的链会导致活性降低。在膦酰氧烷基系列中，3'-膦酰氧丙基化合物33对4'-膦酰氧丁基衍生物39对lumazine合酶的效力更高，但对核黄素合酶的效力较弱。分子模型表明6-（3'-羧丙基）-7-oxo-8-D-核黄素（22）的末端羧基可能与酶的Arg127和Lys135的侧链结合。还建立了一个假想的分子模型，用于在大肠杆菌核黄素合酶的活性位点结合6-（2'-羧乙基）-7-恶唑嗪（15），证明该活性位点可以容易地容纳两个分子。抑制剂。
• The effects of 5‐OP‐RU stereochemistry on its stability and MAIT‐MR1 axis
  作者：Takuro Matsuoka、Chihiro Motozono、Akira Hattori、Hideaki Kakeya、Sho Yamasaki、Shinya Oishi、Hiroaki Ohno、Shinsuke Inuki

  DOI：10.1002/cbic.202000466

  日期：2021.2.15

  Location, location, location: All the stereoisomers of 5‐OP‐RU were synthesized to elucidate the effects of its stereochemistry on MR1‐dependent MAIT cell activation. Of the stereoisomers, only the 4’‐OH epimer demonstrated potent MAIT cell activity, thus indicating that the configuration of the 2’‐OH and 3’‐OH group could be important for agonistic activity.

  位置、位置、位置：合成了 5-OP-RU 的所有立体异构体，以阐明其立体化学对依赖于 MR1 的 MAIT 细胞活化的影响。在立体异构体中，只有 4'-OH 差向异构体表现出强大的 MAIT 细胞活性，因此表明 2'-OH 和 3'-OH 基团的构型可能对激动活性很重要。
• T-cell activation by transitory neo-antigens derived from distinct microbial pathways
  作者：Alexandra J. Corbett、Sidonia B. G. Eckle、Richard W. Birkinshaw、Ligong Liu、Onisha Patel、Jennifer Mahony、Zhenjun Chen、Rangsima Reantragoon、Bronwyn Meehan、Hanwei Cao、Nicholas A. Williamson、Richard A. Strugnell、Douwe Van Sinderen、Jeffrey Y. W. Mak、David P. Fairlie、Lars Kjer-Nielsen、Jamie Rossjohn、James McCluskey

  DOI：10.1038/nature13160

  日期：2014.5

  MAIT cells directly, it does form potent MAIT-activating antigens via non-enzymatic reactions with small molecules, such as glyoxal and methylglyoxal, which are derived from other metabolic pathways. The MAIT antigens formed by the reactions between 5-A-RU and glyoxal/methylglyoxal were simple adducts, 5-(2-oxoethylideneamino)-6-d-ribitylaminouracil (5-OE-RU) and 5-(2-oxopropylideneamino)-6-d-ribitylaminouracil

  T 细胞通过识别不同的微生物分子（主要是肽和脂质）来区分外来分子和宿主分子。在许多细菌和酵母中发现的核黄素前体也选择性地激活黏膜相关不变 T (MAIT) 细胞，这是人类先天样 T 细胞的丰富群体。然而，这些有机小分子的起源及其通过主要组织相容性复合体 (MHC) 相关蛋白 MR1（参考文献 8）向 MAIT 细胞呈递的方式尚不清楚。在这里，我们表明 MAIT 细胞激活需要关键基因编码形成 5-amino-6-d-ribitylaminouracil (5-A-RU) 的酶，这是细菌核黄素合成的早期中间体。虽然 5-A-RU 不直接结合 MR1 或激活 MAIT 细胞，它确实通过与来自其他代谢途径的小分子（如乙二醛和甲基乙二醛）的非酶促反应形成有效的 MAIT 激活抗原。由 5-A-RU 和乙二醛/甲基乙二醛之间的反应形成的 MAIT 抗原是简单的加合物，5-(2-氧代亚乙基氨基)-6-d-ribitylaminouracil
• Isolierung und Struktur von Pteridinen (Lumazinen) aus<i>Russula sp.</i>(Täublinge;<i>Basidiomycetes</i>)
  作者：Peter Xaver Iten、Hana Märki-Danzig、Herbert Koch、Conrad Hans Eugster

  DOI：10.1002/hlca.19840670223

  日期：1984.3.14

  Isolation and Structure Elucidation of Pteridines (Lumazines) from Russula sp. (Basidiomycetes)

  芸苔属（Russula sp。）蝶啶（Lumazines）的分离和结构鉴定。（担子菌）