5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil | 1610526-18-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil
• 英文别名: 5-OP-RU；5-(2-oxopropylideneamino)-6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1610526-18-5
• 化学式: C₁₂H₁₈N₄O₇
• 分子量: 330.298
• InChiKey: LXKLTDXEFFOBPT-OOZYFLPDSA-N

物化性质

• 密度：
  1.68±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  181
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 7-methyl-8-(D-ribityl)lumazine
  参考文献：
  名称：

  5-OP-RU立体化学对其稳定性和MAIT-MR1轴的影响

  摘要：

  位置、位置、位置：合成了 5-OP-RU 的所有立体异构体，以阐明其立体化学对依赖于 MR1 的 MAIT 细胞活化的影响。在立体异构体中，只有 4'-OH 差向异构体表现出强大的 MAIT 细胞活性，因此表明 2'-OH 和 3'-OH 基团的构型可能对激动活性很重要。

  DOI：

  10.1002/cbic.202000466
• 作为产物：
  描述：

  卡培他滨杂质25 在 ammonium hydroxide 、 sodium dithionite 、 ammonium acetate 、 sodium cyanoborohydride 、 potassium hydroxide 、 sodium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 5-(2-oxopropylideneamino)-6-D-ribitylaminouracil
  参考文献：
  名称：

  MR1配体糖类似物对粘膜相关不变T（MAIT）细胞活化的影响。

  摘要：

  粘膜相关不变T（MAIT）细胞是最近鉴定的先天样T淋巴细胞的一个子集，它们似乎在从病毒和细菌感染到自身免疫性疾病和癌症的许多病理中起着重要作用。MAIT细胞通过MR1在MAIT T细胞受体（TCR）的抗原呈递细胞上呈递配体而被激活，但是很少有研究探索系统改变配体结构对MR1结合和MAIT细胞活化的影响。在此，我们报道了关于已知MAIT细胞激动剂7-羟基-6-甲基-8-d-ribityllumazine（RL-6-Me-7-OH）和5中糖基序变化的影响的首次研究。 （2-氧代丙基亚氨基）-6-d-核糖基氨基尿嘧啶（5-OP-RU）。MAIT细胞的四聚体染色显示缺少2' lumazines的糖主链上的-羟基基团改善了MR1-MAIT TCR结合，这可以使用计算对接研究进行合理化。尽管没有一种二嗪类化合物激活MAIT细胞，但所有5-OP-RU类似物均显示出显着的MAIT细胞激活，其中几种类似物的

  DOI：

  10.1039/c9ob01436e

文献信息

• T-cell activation by transitory neo-antigens derived from distinct microbial pathways
  作者：Alexandra J. Corbett、Sidonia B. G. Eckle、Richard W. Birkinshaw、Ligong Liu、Onisha Patel、Jennifer Mahony、Zhenjun Chen、Rangsima Reantragoon、Bronwyn Meehan、Hanwei Cao、Nicholas A. Williamson、Richard A. Strugnell、Douwe Van Sinderen、Jeffrey Y. W. Mak、David P. Fairlie、Lars Kjer-Nielsen、Jamie Rossjohn、James McCluskey

  DOI：10.1038/nature13160

  日期：2014.5

  MAIT cells directly, it does form potent MAIT-activating antigens via non-enzymatic reactions with small molecules, such as glyoxal and methylglyoxal, which are derived from other metabolic pathways. The MAIT antigens formed by the reactions between 5-A-RU and glyoxal/methylglyoxal were simple adducts, 5-(2-oxoethylideneamino)-6-d-ribitylaminouracil (5-OE-RU) and 5-(2-oxopropylideneamino)-6-d-ribitylaminouracil

  T 细胞通过识别不同的微生物分子（主要是肽和脂质）来区分外来分子和宿主分子。在许多细菌和酵母中发现的核黄素前体也选择性地激活黏膜相关不变 T (MAIT) 细胞，这是人类先天样 T 细胞的丰富群体。然而，这些有机小分子的起源及其通过主要组织相容性复合体 (MHC) 相关蛋白 MR1（参考文献 8）向 MAIT 细胞呈递的方式尚不清楚。在这里，我们表明 MAIT 细胞激活需要关键基因编码形成 5-amino-6-d-ribitylaminouracil (5-A-RU) 的酶，这是细菌核黄素合成的早期中间体。虽然 5-A-RU 不直接结合 MR1 或激活 MAIT 细胞，它确实通过与来自其他代谢途径的小分子（如乙二醛和甲基乙二醛）的非酶促反应形成有效的 MAIT 激活抗原。由 5-A-RU 和乙二醛/甲基乙二醛之间的反应形成的 MAIT 抗原是简单的加合物，5-(2-氧代亚乙基氨基)-6-d-ribitylaminouracil
• The effect of MR1 ligand glyco-analogues on mucosal-associated invariant T (MAIT) cell activation
  作者：Chriselle D. Braganza、Kensuke Shibata、Aisa Fujiwara、Chihiro Motozono、Koh-Hei Sonoda、Sho Yamasaki、Bridget L. Stocker、Mattie S. M. Timmer

  DOI：10.1039/c9ob01436e

  日期：——

  MAIT cells revealed that the absence of the 2'-hydroxy group on the sugar backbone of lumazines improved MR1-MAIT TCR binding, which could be rationalised using computational docking studies. Although none of the lumazines activated MAIT cells, all 5-OP-RU analogues showed significant MAIT cell activation, with several analogues exhibiting comparable activity to 5-OP-RU. Docking studies with the 5-OP-RU

  粘膜相关不变T（MAIT）细胞是最近鉴定的先天样T淋巴细胞的一个子集，它们似乎在从病毒和细菌感染到自身免疫性疾病和癌症的许多病理中起着重要作用。MAIT细胞通过MR1在MAIT T细胞受体（TCR）的抗原呈递细胞上呈递配体而被激活，但是很少有研究探索系统改变配体结构对MR1结合和MAIT细胞活化的影响。在此，我们报道了关于已知MAIT细胞激动剂7-羟基-6-甲基-8-d-ribityllumazine（RL-6-Me-7-OH）和5中糖基序变化的影响的首次研究。 （2-氧代丙基亚氨基）-6-d-核糖基氨基尿嘧啶（5-OP-RU）。MAIT细胞的四聚体染色显示缺少2' lumazines的糖主链上的-羟基基团改善了MR1-MAIT TCR结合，这可以使用计算对接研究进行合理化。尽管没有一种二嗪类化合物激活MAIT细胞，但所有5-OP-RU类似物均显示出显着的MAIT细胞激活，其中几种类似物的
• The effects of 5‐OP‐RU stereochemistry on its stability and MAIT‐MR1 axis
  作者：Takuro Matsuoka、Chihiro Motozono、Akira Hattori、Hideaki Kakeya、Sho Yamasaki、Shinya Oishi、Hiroaki Ohno、Shinsuke Inuki

  DOI：10.1002/cbic.202000466

  日期：2021.2.15

  Location, location, location: All the stereoisomers of 5‐OP‐RU were synthesized to elucidate the effects of its stereochemistry on MR1‐dependent MAIT cell activation. Of the stereoisomers, only the 4’‐OH epimer demonstrated potent MAIT cell activity, thus indicating that the configuration of the 2’‐OH and 3’‐OH group could be important for agonistic activity.

  位置、位置、位置：合成了 5-OP-RU 的所有立体异构体，以阐明其立体化学对依赖于 MR1 的 MAIT 细胞活化的影响。在立体异构体中，只有 4'-OH 差向异构体表现出强大的 MAIT 细胞活性，因此表明 2'-OH 和 3'-OH 基团的构型可能对激动活性很重要。