N-[(9H-芴-9-基甲基)羰基]-N',N''-二[叔丁氧羰基]-D-精氨酸 | 214852-34-3

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 精氨酸类衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: N-[(9H-芴-9-基甲基)羰基]-N',N''-二[叔丁氧羰基]-D-精氨酸
• 中文别名: N-[(9H-芴-9-基甲基)羰基]-N’,N’’-二[叔丁氧羰基]-D-精氨酸
• 英文名称: 9-fluorenylmethoxycarbonyl-arginine-(tert-butyloxycarbonyl)2-OH
• 英文别名: Fmoc-D-Arg(Boc)2-OH；Fmoc-Arg(Boc)2-OH；(2R)-5-[bis[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methylideneamino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)pentanoic acid
• CAS: 214852-34-3
• 化学式: C₃₁H₄₀N₄O₈
• 分子量: 596.681
• InChiKey: WPAALELGEWGQEG-XMMPIXPASA-N

物化性质

• 密度：
  1.25

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.1
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  165
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[(9H-芴-9-基甲基)羰基]-N',N''-二[叔丁氧羰基]-D-精氨酸 在 二异丁基氢化铝 作用下， 以 甲醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 C₃₁H₄₀N₄O₇
  参考文献：
  名称：

  反原生动物Barnesin衍生物的模块化固相合成。

  摘要：

  在这里，我们应用并优化了基于固体支持物（SP）的Horner-Wadsworth-Emmons试剂，以制备与SP结合的乙烯基氨基酸。随后的基于SP的肽合成，整体脱保护和化学修饰产生了14种带有乙烯基氨基酸的脂肽，包括天然产物Barnesin A（1）。生物学评估表明，几种合成的衍生物对木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶，人组织蛋白酶L和罗德萨因表现出微摩尔至纳摩尔的抑制活性。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.0c00723
• 作为产物：
  描述：

  N,N'-bis( tert-butoxycarbonyl)-1H-pyrazole-1-carboxamidine 、 9-芴甲基-N-琥珀酰亚胺基碳酸酯 、 2ClH*2C₅H₁₁N₂O₂^(1-)*Cu⁽²⁺⁾ 在 N,N-二异丙基乙胺 、 碳酸氢钠 、 disodium ethylenediamine tetraacetic acid 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 formamide 、 水 、 丙酮 为溶剂， 反应 48.0h， 以3000 mg的产率得到N-[(9H-芴-9-基甲基)羰基]-N',N''-二[叔丁氧羰基]-D-精氨酸
  参考文献：
  名称：

  反原生动物Barnesin衍生物的模块化固相合成。

  摘要：

  在这里，我们应用并优化了基于固体支持物（SP）的Horner-Wadsworth-Emmons试剂，以制备与SP结合的乙烯基氨基酸。随后的基于SP的肽合成，整体脱保护和化学修饰产生了14种带有乙烯基氨基酸的脂肽，包括天然产物Barnesin A（1）。生物学评估表明，几种合成的衍生物对木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶，人组织蛋白酶L和罗德萨因表现出微摩尔至纳摩尔的抑制活性。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.0c00723

文献信息

• Total Synthesis of Lysobactin
  作者：Aikomari Guzman-Martinez、Ryan Lamer、Michael S. VanNieuwenhze

  DOI：10.1021/ja067648h

  日期：2007.5.1

  needed. Lysobactin, a depsipeptide antibiotic has displayed very strong antibacterial activity against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) as well as vancomycin-resistant enterococci (VRE) with minimum inhibitory concentrations (MICs) ranging from 0.39 to 0.78 μg/mL. The MIC values against VRE were more than 50-fold lower than those reported for vancomycin itself. Lysobactin was found

  抗生素耐药性已成为一个重要的公共卫生问题。迫切需要属于新结构类别并通过新机制显示其生物活性的抗生素。溶菌素是一种缩肽类抗生素，对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA) 和耐万古霉素肠球菌 (VRE) 显示出非常强的抗菌活性，最低抑菌浓度 (MIC) 为 0.39 至 0.78 μg/mL。针对 VRE 的 MIC 值比针对万古霉素本身报道的值低 50 倍以上。发现溶菌素抑制新生肽聚糖的形成；然而，在万古霉素利用的细胞壁前体上的结合域 N-酰基-1-Lys-d-Ala-d-Ala 存在的情况下，这种活性不会被拮抗。因此，溶菌素是治疗由耐药病原体引起的细菌感染的有前途的药物。我们描述了一种依赖于高效大环化的溶菌素聚合合成...
• Solid-Phase Synthesis of Lysobactin (Katanosin B): Insights into Structure and Function
  作者：Edward A. Hall、Erkin Kuru、Michael S. VanNieuwenhze

  DOI：10.1021/ol300926d

  日期：2012.6.1

  The solid phase synthesis of the cyclic depsipeptide antibiotic lysobactin is described. The natural product was synthesized via a linear approach using mostly an Fmoc-strategy solid phase peptide synthesis (SPPS) with a single purification. A lysobactin analog has also been synthesized displaying nanomolar membrane disruption activity not seen with the natural product.

  描述了环缩肽抗生素溶菌素的固相合成。天然产物是通过线性方法合成的，主要使用 Fmoc 策略固相肽合成 (SPPS) 和单一纯化。还合成了一种溶菌素类似物，显示出天然产物所没有的纳摩尔膜破坏活性。
• <scp>L</scp> -Arginyl-3,4-Spermidine is neuroprotective in several <i>in vitro</i> models of neurodegeneration and <i>in vivo</i> ischaemia without suppressing synaptic transmission
  作者：Barclay Morrison、Ashley K Pringle、Terence McManus、John Ellard、Mark Bradley、Francesco Signorelli、Fausto Iannotti、Lars E Sundstrom

  DOI：10.1038/sj.bjp.0704986

  日期：2002.12

  Stroke is the third most common cause of death in the world, and there is a clear need to develop new therapeutics for the stroke victim. To address this need, we generated a combinatorial library of polyamine compounds based on sFTX‐3.3 toxin from which L‐Arginyl‐3,4‐Spermidine (L‐Arg‐3,4) emerged as a lead neuroprotective compound. In the present study, we have extended earlier results to examine the compound's neuroprotective actions in greater detail. In an in vitro ischaemia model, L‐Arg‐3,4 significantly reduced CA1 cell death when administered prior to induction of 60 min of ischaemia as well as when administered immediately after ischaemia. Surprisingly, L‐Arg‐3,4 continued to prevent cell death significantly when administration was delayed for as long as 60 min after ischaemia. L‐Arg‐3,4 significantly reduced cell death in excitotoxicity models mediated by glutamate, NMDA, AMPA, or kainate. Unlike glutamate receptor antagonists, 300 μM L‐Arg‐3,4 did not suppress synaptic transmission as measured by evoked responses in acute hippocampal slices. L‐Arg‐3,4 provided significant protection, in vitro, in a superoxide mediated injury model and prevented an increase of superoxide production after AMPA or NMDA stimulation. It also decreased nitric oxide production after in vitro ischaemia and NMDA stimulation, but did so without inhibiting nitric oxide synthase directly. Furthermore, L‐Arg‐3,4 was significantly neuroprotective in an in vivo model of global forebrain ischaemia, without any apparent neurological side‐effects. Taken together, these results demonstrate that L‐Arg‐3,4 is protective in several models of neurodegeneration and may have potential as a new therapeutic compound for the treatment of stroke, trauma, and other neurodegenerative diseases. British Journal of Pharmacology (2002) 137, 1255–1268. doi:10.1038/sj.bjp.0704986

  中风是全球第三大致死原因，迫切需要开发新的治疗方法来帮助中风患者。为此，我们基于sFTX-3.3毒素生成了一个聚胺化合物组合库，从中筛选出了一种有潜力的神经营养化合物——L-精氨酰-3,4-亚精胺（L-Arg-3,4）。在本研究中，我们进一步扩展了早期研究结果，对这种化合物的神经营养作用进行了更详细的探讨。 在一个体外缺血模型中，无论是预先给予还是在缺血后立即给予L-Arg-3,4，均能显著减少缺血60分钟后CA1神经元的死亡。令人惊讶的是，即使在缺血后延迟60分钟给予，L-Arg-3,4仍能显著防止细胞死亡。 在由谷氨酸、NMDA、AMPA或kainate引起的兴奋性毒性模型中，L-Arg-3,4均可显著减少神经元死亡。与谷氨酸受体拮抗剂不同，300 μM的L-Arg-3,4并未抑制急性海马切片中测量到的突触传递。 L-Arg-3,4在体外超氧诱导的损伤模型中提供了显著的保护作用，防止AMPA或NMDA刺激后超氧产生增加。它还减少了体外缺血和NMDA刺激后的NO生成，但并未直接抑制NO合酶。 此外，在一个活体模型中，L-Arg-3,4对全脑缺血提供了显著的神经保护作用，且未出现明显的神经副作用。 综上所述，这些结果表明，L-Arg-3,4在多种神经退行性疾病模型中具有保护作用，可能作为一种新的治疗化合物用于中风、创伤和其他神经退行性疾病的治疗。 英国药理学杂志（2002）137, 1255–1268。 doi:10.1038/sj.bjp.0704986
• Modular Solid-Phase Synthesis of Antiprotozoal Barnesin Derivatives
  作者：Dávid Roman、Luka Raguž、François Keiff、Florian Meyer、Fabian Barthels、Tanja Schirmeister、Florian Kloss、Christine Beemelmanns

  DOI：10.1021/acs.orglett.0c00723

  日期：2020.5.15

  ons reagent to prepare SP-bound vinylogous amino acids. Subsequent SP-based peptide synthesis, global deprotection, and chemical modifications yielded 14 lipodipeptides carrying vinylogous amino acids, including the natural product barnesin A (1). Biological evaluation revealed that several synthesized derivatives show micromolar to nanomolar inhibitory activity against papain-like cysteine proteases

  在这里，我们应用并优化了基于固体支持物（SP）的Horner-Wadsworth-Emmons试剂，以制备与SP结合的乙烯基氨基酸。随后的基于SP的肽合成，整体脱保护和化学修饰产生了14种带有乙烯基氨基酸的脂肽，包括天然产物Barnesin A（1）。生物学评估表明，几种合成的衍生物对木瓜蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶，人组织蛋白酶L和罗德萨因表现出微摩尔至纳摩尔的抑制活性。