[(2R,3R,3aR,9aR)-2-(3-Benzyloxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-yloxy]-acetic acid methyl ester | 581060-78-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: [(2R,3R,3aR,9aR)-2-(3-Benzyloxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-yloxy]-acetic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 2-[[(6aR,8R,9R,9aR)-8-[2,4-dioxo-3-(phenylmethoxymethyl)pyrimidin-1-yl]-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-9-yl]oxy]acetate
• CAS: 581060-78-8
• 化学式: C₃₂H₅₀N₂O₁₀Si₂
• 分子量: 678.927
• InChiKey: WNGZGWHVXUMUSY-VNWIGOPPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.66
• 拓扑面积：
  122
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3R,3aR,9aR)-2-(3-Benzyloxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-yloxy]-acetic acid methyl ester 在 palladium on activated charcoal sodium tetrahydroborate 、 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 叔丁醇 为溶剂， 生成 3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-(2-hydroxyethyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of HyBeacons and dual-labelled probes containing 2′-fluorescent groups for use in genetic analysis

  摘要：

  一种受 FMOC 保护的 2â²-羟乙基尿嘧啶磷酰胺被用于合成荧光素标记的 HyBeacon 探针和âFAM-ROXâ双标记荧光寡核苷酸。

  DOI：

  10.1039/b302855k
• 作为产物：
  描述：

  1,3二氯-1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷 在 咪唑 、 sodium hydride 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 [(2R,3R,3aR,9aR)-2-(3-Benzyloxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-yloxy]-acetic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of HyBeacons and dual-labelled probes containing 2′-fluorescent groups for use in genetic analysis

  摘要：

  一种受 FMOC 保护的 2â²-羟乙基尿嘧啶磷酰胺被用于合成荧光素标记的 HyBeacon 探针和âFAM-ROXâ双标记荧光寡核苷酸。

  DOI：

  10.1039/b302855k

文献信息

• Synthesis of HyBeacons and dual-labelled probes containing 2′-fluorescent groups for use in genetic analysis
  作者：Neil Dobson、David G. McDowell、David J. French、Lynda J. Brown、John M. Mellor、Tom Brown

  DOI：10.1039/b302855k

  日期：——

  An FMOC-protected 2′-hydroxyethyl uridine phosphoramidite has been used to synthesise fluorescein-labelled HyBeacon probes and “FAM-ROX” dual-labelled fluorogenic oligonucleotides.

  一种受 FMOC 保护的 2â²-羟乙基尿嘧啶磷酰胺被用于合成荧光素标记的 HyBeacon 探针和âFAM-ROXâ双标记荧光寡核苷酸。