(9-{(2R,3R,3aS,9aR)-5,5,7,7-Tetraisopropyl-3-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxycarbonylamino]-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl}-9H-purin-6-yl)-carbamic acid 2-(4-nitro-phenyl)-ethyl ester | 213487-41-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (9-{(2R,3R,3aS,9aR)-5,5,7,7-Tetraisopropyl-3-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxycarbonylamino]-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl}-9H-purin-6-yl)-carbamic acid 2-(4-nitro-phenyl)-ethyl ester
• CAS: 213487-41-3
• 化学式: C₄₀H₅₄N₈O₁₂Si₂
• 分子量: 895.086
• InChiKey: BAJYPUFSQXFKJD-PXGQBAFSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.63
• 重原子数：
  62.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  243.46
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  16.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (9-{(2R,3R,3aS,9aR)-5,5,7,7-Tetraisopropyl-3-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxycarbonylamino]-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl}-9H-purin-6-yl)-carbamic acid 2-(4-nitro-phenyl)-ethyl ester 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 四丁基氟化铵 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 82.0h， 生成 N-{(2R,3R,4S,5R)-2-(6-Amino-purin-9-yl)-5-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-3-yl}-succinamic acid
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。LVII部分。2'-氨基-2'-脱氧核糖核苷的亚磷酰胺结构单元的合成：寡核苷酸合成的新化合物†

  摘要：

  化学合成的尿嘧啶，胞嘧啶，腺嘌呤，鸟嘌呤和2'-氨基-2'-脱氧核糖核苷，和其转化为适当保护的3'-亚磷酰胺构建模块35 - 40用于寡核苷酸合成进行说明。使用2-（4-硝基苯基）乙氧羰基（npeoc）基团保护糖苷配基和2'-氨基官能团。3'- O-琥珀酰基（3' - O-（3-羧基丙酰基））取代的起始核苷41的合成描述了1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯（DBU）脱保护过程中预期迁移的溶液和固相行为，并对其进行了研究。使用新的结构单元制备了寡核苷酸，并通过紫外熔融技术研究了它们的杂交特性。

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810556
• 作为产物：
  描述：

  9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1-β-D-arabinofuranosyl]adenine 在 4-二甲氨基吡啶 、 叠氮化锂 、 偶氮二异丁腈 、 4 A molecular sieve 、 三正丁基氢锡 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 76.5h， 生成 (9-{(2R,3R,3aS,9aR)-5,5,7,7-Tetraisopropyl-3-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxycarbonylamino]-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl}-9H-purin-6-yl)-carbamic acid 2-(4-nitro-phenyl)-ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。LVII部分。2'-氨基-2'-脱氧核糖核苷的亚磷酰胺结构单元的合成：寡核苷酸合成的新化合物†

  摘要：

  化学合成的尿嘧啶，胞嘧啶，腺嘌呤，鸟嘌呤和2'-氨基-2'-脱氧核糖核苷，和其转化为适当保护的3'-亚磷酰胺构建模块35 - 40用于寡核苷酸合成进行说明。使用2-（4-硝基苯基）乙氧羰基（npeoc）基团保护糖苷配基和2'-氨基官能团。3'- O-琥珀酰基（3' - O-（3-羧基丙酰基））取代的起始核苷41的合成描述了1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯（DBU）脱保护过程中预期迁移的溶液和固相行为，并对其进行了研究。使用新的结构单元制备了寡核苷酸，并通过紫外熔融技术研究了它们的杂交特性。

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810556