9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1-β-D-arabinofuranosyl]adenine | 87792-02-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1-β-D-arabinofuranosyl]adenine
• 英文别名: 3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-ara-adenosine；9-[3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxan-1,3-diyl)-β-D-arabinofuranosyl]adenine；9-[3′,5′-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxyl)-β-D-arabinofuranosyl]adenine；3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxyl)arabinoadenosine；9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-arabinofurano-1-syl]adenine；(6aR,8R,9S,9aS)-8-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2,4,4-tetraisopropyltetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-9-ol；9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-arabinofuranosyl]adenine；(6aR,8R,9S,9aS)-8-(6-aminopurin-9-yl)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-9-ol
• CAS: 87792-02-7
• 化学式: C₂₂H₃₉N₅O₅Si₂
• 分子量: 509.753
• InChiKey: KHVLHRYSOPSVJR-ITBLURSFSA-N

物化性质

• 熔点：
  98-105 °C
• 沸点：
  579.2±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.31±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.62
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.77
• 拓扑面积：
  127
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1-β-D-arabinofuranosyl]adenine 在 potassium fluoride 、 四乙基溴化铵 、 三氯化磷 作用下， 以 吡啶 、 乙腈 为溶剂， 反应 83.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  9-β-D-阿拉伯呋喃糖基腺嘌呤及其相关类似物的同分异构的二核苷单磷酸酯和单甲基膦酸酯的合成和生物学评估。

  摘要：

  9-β-D-阿拉伯呋喃糖基腺嘌呤及其3'-（磷酸氢根）的3'---- 5'，3'---- 3'和5'---- 5'二核苷单磷酸酯和甲基膦酸酯）和5'-（甲基膦酸甲酯）衍生物一直是系统合成和检查其生物学（即抗病毒和抑制细胞生长）特性的主题。首先制备适当保护的单体结构单元，然后冷凝以得到完全保护的中间体。然后将后者解封，得到未保护的化合物，将其充分表征。仅3'---- 5'磷酸二酯异构体13和16，以及在较小程度上5'-（膦酸氢）衍生物21显示出显着的生物学活性。

  DOI：

  10.1021/jm00118a006
• 作为产物：
  描述：

  2'-O-triflyl-3',6'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-adenosine 在 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 六甲基磷酰三胺 为溶剂， 反应 54.0h， 生成 9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1-β-D-arabinofuranosyl]adenine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 2'-substituted derivatives of neplanocin A (Nucleosides and nucleotides. XLIV).

  摘要：

  Neplanocin A（1）和 N6-苯甲酰基eplanocin A（2）被转化为相应的 3'，6'-O-（四异丙基二硅氧烷-1，3-二基）-eplanocin A（3，4）。3 和 4 中的 2'-羟基被三氟化（5，6）。在六甲基磷酸三酰胺中，用多种亲核剂（I-、Br-、Cl-、N3-、AcO-、AcS-）对 5 和 6 进行亲核置换，可以高产率得到相应的 2' (R)-取代衍生物。用这种方法制备的阿糖胞苷 A 也以类似的方式得到了 2' (S)-叠氮衍生物。腺苷也被转化为 2' (R)-取代的衍生物，包括阿拉伯呋喃糖基腺嘌呤，以及 2' (S)-取代的腺苷。文中介绍了这些 2'-取代的肾上腺素 A 和腺苷衍生物的物理性质，包括核磁共振和圆二色光谱。

  DOI：

  10.1248/cpb.31.1582

文献信息

• 2′-Alkynylnucleotides: A Sequence- and Spin Label-Flexible Strategy for EPR Spectroscopy in DNA
  作者：Marius M. Haugland、Afaf H. El-Sagheer、Rachel J. Porter、Javier Peña、Tom Brown、Edward A. Anderson、Janet E. Lovett

  DOI：10.1021/jacs.6b05421

  日期：2016.7.27

  Electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy is a powerful method to elucidate molecular structure through the measurement of distances between conformationally well-defined spin labels. Here we report a sequence-flexible approach to the synthesis of double spin-labeled DNA duplexes, where 2'-alkynylnucleosides are incorporated at terminal and internal positions on complementary strands. Post-DNA

  电子顺磁共振 (EPR) 光谱是一种通过测量构象明确定义的自旋标记之间的距离来阐明分子结构的强大方法。在这里，我们报告了一种序列灵活的方法来合成双自旋标记的 DNA 双链体，其中 2'-炔基核苷结合在互补链的末端和内部位置。DNA 合成后铜催化的叠氮化物-炔环加成 (CuAAC) 反应与各种自旋标记物能够使用双电子-电子共振实验来测量双链体上的多个距离，提供高水平的详细结构信息。
• Adenosine Analogues as Selective Inhibitors of Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase of <i>Trypanosomatidae</i> via Structure-Based Drug Design
  作者：Jerome C. Bressi、Christophe L. M. J. Verlinde、Alex M. Aronov、My Le Shaw、Sam S. Shin、Lisa N. Nguyen、Stephen Suresh、Frederick S. Buckner、Wesley C. Van Voorhis、Irwin D. Kuntz、Wim G. J. Hol、Michael H. Gelb

  DOI：10.1021/jm000472o

  日期：2001.6.1

  N(6)-[1-(3-hydroxynaphthalene)methyl]-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (7m), N(6)-[1-(3-methoxynaphthalene)methyl]-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (9m), N(6)-(2-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine (11e), and N(6)-(2-naphthalenemethyl)-2'-deoxy-2'-(3,5-dimethoxybenzamido)adenosine (11m) demonstrated a 2- to 3-fold improvement over 6e and a 7100- to 25000-fold improvement

  在我们继续进行基于抗锥虫病药物的结构设计时，寄生虫选择性腺苷类似物被确定为低甘油三磷酸甘油醛脱氢酶（GAPDH）的抑制剂。布鲁氏锥虫，克氏锥虫，墨西哥利什曼原虫和人类GAPDH的晶体结构提供了NAD（+）的腺苷部分如何与蛋白质相互作用的详细信息，这有助于理解一系列腺苷类似物对各种氨基酸的亲和力。 GAPDH。从对铅化合物的萘甲基和苯甲酰胺取代基进行修饰的探索中，N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6e），N（6）-（研究了取代的萘甲基）-2'-脱氧-2'-（取代的苯甲酰胺基）腺苷类似物。N（6）-（1-萘甲基）-2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（6m），N（6）-[1-（3-羟基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（7m），N（6）-[1-（3-甲氧基萘）甲基] -2'-脱氧-2'-（3,5-二甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（
• [EN] S-ANTIGEN TRANSPORT INHIBITING OLIGONUCLEOTIDE POLYMERS AND METHODS<br/>[FR] POLYMÈRES OLIGONUCLÉOTIDIQUES INHIBANT LE TRANSPORT DE L'ANTIGÈNE S ET MÉTHODES
  申请人：ALIGOS THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2021119325A1

  公开（公告）日：2021-06-17

  Various embodiments provide STOPS™ polymers that are S-antigen transport inhibiting oligonucleotide polymers, processes for making them and methods of using them to treat diseases and conditions. In some embodiments the STOPS™ modified oligonucleotides include an at least partially phosphorothioated sequence of alternating A and C units having modifications as described herein. The sequence independent antiviral activity against hepatitis B of embodiments of STOPS™ modified oligonucleotides, as determined by HBsAg Secretion Assay, is an EC50 that is less than 100 nM.

  各种实施方式提供了STOPS™聚合物，这些聚合物是S-抗原转运抑制寡核苷酸聚合物，提供了制备它们的方法以及使用它们治疗疾病和症状的方法。在某些实施方式中，STOPS™修饰的寡核苷酸包括至少部分磷硫酸酯化的交替A和C单元序列，具有如本文所述的修饰。通过HBsAg分泌测定确定的STOPS™修饰的寡核苷酸对乙型肝炎的序列无关抗病毒活性，其EC50小于100 nM。
• A practical synthesis of 2′-aminoacylamino-2′-deoxyadenosines
  作者：Gavin O'Mahony、Andreas Sundgren、Sara Svensson、Morten Grøtli

  DOI：10.1016/j.tet.2007.04.038

  日期：2007.7

  A practical and efficient synthesis of 2′-aminoacylamino-2′-deoxyadenosine derivatives is reported. EDCI/HOBt-mediated coupling of a 3′,5′-diprotected 2′-amino-2′-deoxyadenosine derivative to various N-Cbz-l-amino acid derivatives followed by global deprotection affords analytically pure 2′-aminoacylamino-2′-deoxyadenosine derivatives without the necessity for preparative HPLC purification. These compounds

  报道了一种实用和有效的合成2'-氨基酰基氨基-2'-脱氧腺苷衍生物的方法。EDCI / HOBt介导的3'，5'-双保护2'-氨基-2'-脱氧腺苷衍生物与各种N -Cbz-1-氨基酸衍生物的偶联，然后整体脱保护，得到分析纯的2'-氨基酰基氨基-2' -脱氧腺苷衍生物，无需进行制备型HPLC纯化。这些化合物是2'-氨基酰基腺苷的不可水解等位基因，可用于X射线研究中阐明各种tRNA合成酶的编辑机制。
• Retinoic Acid Conjugates as Potential Antitumor Agents:  Synthesis and Biological Activity of Conjugates with Ara-A, Ara-C, 3(2<i>H</i>)-Furanone, and Aniline Mustard Moieties
  作者：Stefano Manfredini、Daniele Simoni、Roberto Ferroni、Rita Bazzanini、Silvia Vertuani、Sigrid Hatse、Jan Balzarini、Erik De Clercq

  DOI：10.1021/jm9602322

  日期：1997.11.1

  (54% and 44% differentiated HL-60 cells at 0.2 and 0.05 microgram/mL respectively). With regard to the retinoic acid conjugates of alkylating agents, compound 10 was the most cytostatic agent (IC50 < 0.32 microgram/mL) and the most potent differentiating agent (33-34% at 0.32 and 0.08 microgram/mL). These structures may also be regarded as analogs of either retinoic acid or the cytotoxic compound.

  在双重靶向方法中，为了探索维甲酸（全反式维甲酸）作为细胞毒性实体的共价载体的能力，维甲酸与一些代表性分子的结合物是抗肿瘤药效团（即核苷）的重要实例（类似物和烷基化剂），已经合成并测试了它们的细胞抑制和分化活性。所有化合物对人血浆中的体外水解都是稳定的，并且比母体化合物更具亲脂性，因此可以增加细胞的摄取。在核苷类似物中，Ara-C衍生物3和6和Ara-A衍生物7被证明具有最强的抑制细胞生长作用（IC50 <0.32微克/ mL），其结果是从25-到> 与母体核苷相比，其活性高（Ara-A衍生物）或至少具有同等活性（Ara-C衍生物）144倍。在3'和5'位置具有高度亲脂性甲硅烷基部分的化合物3表现出最高的分化活性（分别以0.2和0.05微克/ mL分别分化了54％和44％的HL-60细胞）。对于烷基化剂的视黄酸缀合物，化合物10是最强细胞生长抑制剂（IC50 <0.32微克/毫升）和最有效的分化剂（在0