可以应用于广泛的酶催化反应以设计酶
抑制剂的合理方法提供了强有力的策略,从而促进了药物和/或酶机制分子探针的开发。使用来自布氏乳杆菌的
异亮氨酸2-
表异构酶(LbIleE)作为模型酶,详细阐述了开发作为消旋酶和
差向异构酶抑制剂的底物产物类似物(
SPA)的策略。LbIleE在C-2位置催化非极性
氨基酸的PLP依赖性,可逆,消旋或差向异构化。该酶在支链d-
氨基酸的
生物合成中起重要作用,并且是开发抗微
生物剂的潜在靶标。3-乙基-3-甲基-1-正缬
氨酸(Ki = 2.9±0.2 mM)和3-乙基-3-甲基-d-正缬
氨酸(Ki = 1.5±0。基于催化过程中底物I-Ile的仲丁基侧链的运动,将2 mM)设计为
SPA,并且是竞争性
抑制剂,其结合亲和力分别比I-Ile的亲和力高1.3倍和2.5倍。令人惊讶地,这些化合物不是底物,但是缺少3-甲基的相应化合物是底物。与
丝氨酸,谷
氨酸和脯
氨酸消旋体不同,它们的活