synthesized compounds were determined. These highlighted a subtle interplay between the base moiety and the target enzyme in defining relative inhibitory activity. Encouraged by this data we investigated if the pyrimidine congeners could escape a natural resistance mechanism, involving acetylation of the amine of the aminoacyl group by the bacterial N-acetyltransferases RimL and YhhY. With RimL the pyrimidine
氨酰基-tRNA合成酶(aaRSs)催化
氨基酸与其同源tRNA的
ATP依赖性偶联。aaRSs对于蛋白质翻译至关重要,被认为是开发新型抗菌剂的有希望的目标。5'- O-(N-
氨基酰基)-
氨磺酰基
腺苷(aa
SA)是aaRS反应中间体的不可
水解类似物,已显示是该酶家族的有效
抑制剂,但易于
化学不稳定和酶促修饰。为了改善该支架的分子性质,我们合成了一系列碱基取代的aa
SA类似物,其包括靶向
胞嘧啶,酪
氨酰基和异亮
氨酰-tRNA合成酶的
胞嘧啶,尿
嘧啶和N 3-甲基尿
嘧啶。在体外九种
抑制剂中的七种检测结果表明K i app值在低纳摩尔范围内。为了补充
生物化学研究,淋病奈瑟氏球菌亮
氨酰tRNA合成酶和大肠杆菌的X射线晶体学结构测定了与新合成的化合物复合的酪
氨酰-tRNA合成酶。这些突显了在限定相对抑制活性中碱基部分和靶酶之间的微妙相互作用。受此数据的鼓励,我们研究了
嘧啶同源物是否可以逃避天然抗性机制,涉及通