N2-(1,1,4,4-四甲基二硅烷基氮杂环戊烷基)-O6-苄基-8-溴-N9-[3',5'-O-(1,1,3,3-四(异丙基)-1,3-二硅氧烷二基)-beta-D-2'-脱氧呋喃核糖基]鸟嘌呤 | 328394-28-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: N2-(1,1,4,4-四甲基二硅烷基氮杂环戊烷基)-O6-苄基-8-溴-N9-[3',5'-O-(1,1,3,3-四(异丙基)-1,3-二硅氧烷二基)-beta-D-2'-脱氧呋喃核糖基]鸟嘌呤
• 英文名称: N²-(1,1,4,4-tetramethyldisilylazacyclopentanyl)-O⁶-benzyl-8-bromo-N9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetrakis(isopropyl)-1,3-disiloxanediyl)-β-D-2'-deoxyribofuranosyl]guanine
• 英文别名: O⁶-benzyl-8-bromo-2-(2,2,5,5-tetramethyl-1-aza-2,5-disilylcyclopent-1-yl)-N9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetrakis(isopropyl)-1,3-disiloxanediyl)-β-D-2'-deoxyribofuranosyl]inosine；N2-(1,1,4,4-tetramethyldisilylazacyclopentanyl)-o6-benzyl-8-bromo-n9-[3 inverted exclamation mark,5 inverted exclamation mark-o-(1,1,3,3-tetrakis(isopropyl)-1,3-disiloxanediyl)-|A-d-2 inverted exclamation mark-deoxyribofuranosyl]guanine；1-[9-[(6aR,8R,9aS)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-8-bromo-6-phenylmethoxypurin-2-yl]-2,2,5,5-tetramethyl-1,2,5-azadisilolidine
• CAS: 328394-28-1
• 化学式: C₃₅H₅₈BrN₅O₅Si₄
• 分子量: 821.122
• InChiKey: JLNLIOWGBNVDRZ-FRXPANAUSA-N

物化性质

• 熔点：
  93-95°C
• 沸点：
  713.3±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.26±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于氯仿、DMF、DMSO、乙酸乙酯、甲醇

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.64
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  93
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-(1,1,4,4-四甲基二硅烷基氮杂环戊烷基)-O6-苄基-8-溴-N9-[3',5'-O-(1,1,3,3-四(异丙基)-1,3-二硅氧烷二基)-beta-D-2'-脱氧呋喃核糖基]鸟嘌呤 在 palladium on activated charcoal tris(dibenzylideneacetone)dipalladium (0) 、 四丁基氟化铵 、 氢气 、 R-(+)-1,1'-联萘-2,2'-双二苯膦 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 甲苯 为溶剂， 20.0~100.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 1.92h， 生成 2-氨基-9-[(2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基]-8-[(3-甲基吡啶并[3,2-e]苯并咪唑-2-基)氨基]-3H-嘌呤-6-酮
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of the C8-Deoxyguanosine Adduct of the Food Mutagen IQ

  摘要：

  [GRAPHICS]The C8-2'-deoxyguanosine adduct of the food mutagen 2-amino-3-methylimadazo[4,5-f]-quinoline (IQ) has been synthesized, The key step is a palladium catalyzed N-arylation of a suitably protected 8-bromo-2'-deoxygunaosine derivative.

  DOI：

  10.1021/ol006968h
• 作为产物：
  描述：

  8-bromo-N9-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetrakis(isopropyl)-1,3-disiloxanediyl)-β-D-2'-deoxyribofuranosyl]guanine 在 三苯基膦 、 lithium hexamethyldisilazane 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 0.58h， 生成 N2-(1,1,4,4-四甲基二硅烷基氮杂环戊烷基)-O6-苄基-8-溴-N9-[3',5'-O-(1,1,3,3-四(异丙基)-1,3-二硅氧烷二基)-beta-D-2'-脱氧呋喃核糖基]鸟嘌呤
  参考文献：
  名称：

  含有膳食诱变剂 IQ​​ 的 C8-脱氧鸟苷加合物的寡核苷酸的定点合成和特性

  摘要：

  已实现含有高致突变杂环胺2-氨基-3-甲基咪唑并[4,5-f]喹啉(IQ)的C8-脱氧鸟苷加合物的寡核苷酸的定点合成，并通过UV熔解温度表征寡核苷酸分析、圆二色性和紫外吸收光谱。对这些数据的检查表明 IQ 加合物适应于截然不同的环境。这种依赖于序列的构象偏好可能在 IQ 修饰的寡核苷酸的致突变性和修复中发挥关键作用。

  DOI：

  10.1021/ja0487022