(4,7,10-三叔丁氧羰基-1,4,7,10-四氮杂环癸-1-基)乙酸 | 247193-74-4

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: (4,7,10-三叔丁氧羰基-1,4,7,10-四氮杂环癸-1-基)乙酸
• 英文名称: 2-(4,7,10-tris(tert-butoxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-yl)acetic acid
• 英文别名: [4,7,10-tris(tert-butoxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecan-1-yl]acetic acid；1-carboxymethyl-4,7,10-tris(tert-butoxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecane；[4,7,10-tris(t-butoxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododec-1-yl]acetic acid；1,4,7-Tri-Boc-10-(carboxymethyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecane；2-[4,7,10-tris[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]-1,4,7,10-tetrazacyclododec-1-yl]acetic acid
• CAS: 247193-74-4
• 化学式: C₂₅H₄₆N₄O₈
• 分子量: 530.662
• InChiKey: NDHHFZCDHYVCTI-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  138 °C
• 沸点：
  611.6±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.126±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.84
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (4,7,10-三叔丁氧羰基-1,4,7,10-四氮杂环癸-1-基)乙酸 在 甲醇 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 tri-tert-butyl 10-(2-(((S)-3-(1H-imidazol-4-yl)-1-oxo-1-((2-oxo-2-(((R)-2,5,7,8-tetramethyl-2-((4R,8R)-4,8,12-trimethyltridecyl)chroman-6-yl)oxy)ethyl)amino)propan-2-yl)amino)-2-oxoethyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4,7-tricarboxylate
  参考文献：
  名称：

  新型咪唑官能化的周期化阳离子脂质：合成及作为非病毒基因载体的应用

  摘要：

  合成了一系列带有组氨酸咪唑基团10a - 10e的新颖的1,4,7,10-四氮杂十二烷基（环素）基阳离子脂质。这些两亲分子具有不同的疏水尾（长链，胆固醇或α-生育酚）和各种类型的连接基团（醚，氨基甲酸酯或酯）。这些分子被用作非病毒基因传递载体，并研究了它们的结构-活性关系。如预期的那样，与周期素相比，咪唑基可以大大提高缓冲能力。由10形成的脂质体且二油酰基磷脂酰乙醇胺（DOPE）可以将质粒DNA结合并浓缩成具有适当大小和ζ电位的纳米颗粒。与Lipofectamine 2000相比，形成的脂质复合物的转染细胞比例较低，但荧光强度较高，表明它们具有良好的细胞内传递能力。此外，结果表明，阳离子脂质的转染效率不仅受到疏水尾部的影响，而且还受到连接基团的影响。具有α-生育酚疏水尾部和酯键的基于cycln的阳离子脂质在血清存在下可以产生最高的转染效率。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2013.03.048
• 作为产物：
  描述：

  轮环藤宁 在 lithium hydroxide monohydrate 、 水 、 potassium carbonate 作用下， 以 氯仿 、 丙酮 、 乙腈 为溶剂， 生成 (4,7,10-三叔丁氧羰基-1,4,7,10-四氮杂环癸-1-基)乙酸
  参考文献：
  名称：

  锌（II）周期蛋白-肽共轭物与Ras的弱效应子结合状态相互作用

  摘要：

  摘要制备了锌（II）环素-肽杂合化合物和双锌（II）环素复合物，作为鸟嘌呤核苷酸结合蛋白Ras的潜在结合剂，该蛋白是细胞信号转导中的重要分子开关。化合物的设计基于先前的观察结果，即锌（II）环素络合物可作为Ras-效应子相互作用抑制剂的先导化合物，因此能够中断Ras诱导的信号转导。锌（II）环素选择性地稳定了活性Ras的构象状态1，这种构象状态与效应蛋白（如Raf激酶）的亲和力大大降低。为了实现此类Ras-Raf相互作用抑制剂的更高结合亲和力，通过固相合成方案制备了衍生自Ras-活化剂SOS序列的具有短肽的锌（II）环素共轭物。从核-叠氮化物环加成反应获得双核双锌（II）环素复合物。所制备化合物的NMR研究表明，肽结合物不会导致金属络合物-肽结合物的Ras结合亲和力增加。双核锌复合物导致蛋白质立即沉淀，从而阻止了对其结合的光谱研究。

  DOI：

  10.1016/j.ica.2010.07.067

文献信息

• [EN] ANTIBACTERIAL COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSÉS ANTIBACTÉRIENS
  申请人：UNIV SYDNEY

  公开号：WO2014153624A1

  公开（公告）日：2014-10-02

  The invention relates to antibacterial compounds, methods for synthesis and use thereof in antibacterial applications.

  这项发明涉及抗菌化合物，其合成方法以及在抗菌应用中的使用。
• Synthesis, DNA Binding, and Cleavage Studies of Novel PNA Binding Cyclen Complexes
  作者：Yu Zhang、Ming-Qi Wang、Ji Zhang、Da-Wei Zhang、Hong-Hui Lin、Xiao-Qi Yu

  DOI：10.1002/cbdv.201000084

  日期：2011.5

  A novel coumarin‐appended PNA binding cyclen derivative ligand, C1, and its copper(II) complex, C2, have been synthesized and characterized. The interaction of these compounds with DNA was systematically investigated by absorption, fluorescence, and viscometric titration, and DNA‐melting and gel‐electrophoresis experiments. DNA Melting and viscometric titration experiments indicate that the binding

  已经合成并表征了一种新型的附加香豆素的 PNA 结合循环衍生物配体 C1 及其铜 (II) 复合物 C2。这些化合物与 DNA 的相互作用通过吸收、荧光和粘度滴定以及 DNA 熔化和凝胶电泳实验进行了系统研究。DNA熔解和粘度滴定实验表明，C1的结合方式为沟结合，C2为多重结合方式，包括沟结合和静电结合。从吸收滴定数据，我们可以说 CT DNA 和两种化合物之间的主要相互作用可能是核碱基之间的 H 键。荧光研究表明，C1 与 d(A)9 的结合能力是其他寡脱氧核苷酸的两倍或三倍。
• Neomycin B-cyclen conjugates and their Zn(II) complexes as RNA-binding agents
  作者：Bopha Kong、Tanmaya Joshi、Matthew J. Belousoff、Yitzhak Tor、Bim Graham、Leone Spiccia

  DOI：10.1016/j.jinorgbio.2015.11.029

  日期：2016.9

  ribosomal A-site RNA revealed that they bind to the A-site with slightly higher affinities than the parent aminoglycoside (e.g., IC50 at pH 7 = 1.42–2.30 μM vs. 2.35 μM for neomycin B). This is attributed to the higher overall positive charge of the conjugates, resulting from protonation of the macrocylic amines. Consistent with a predominantly electrostatic mode of interaction, the binding affinities of

  通过常规肽偶联方案，由这些前体的适当保护的衍生物合成了三种新的偶联物，其特征在于氨基糖苷类抗生素新霉素B通过不同长度的烷基链连接到1,4,7,10-四氮杂环十二烷（环素）大环上。最终产物通过1 H NMR光谱，质谱和元素分析进行表征。基于FRET的测量方法检查了化合物从Dy547标记的原核糖体A位点RNA置换香豆素标记的卡那霉素A或新霉素B的能力，发现它们以比亲代氨基糖苷稍高的亲和力与A位点结合（例如，pH值7时的IC 50 = 1.42–2.30μM，相对于。新霉素B为2.35μM）。这归因于由大环胺的质子化导致的结合物的更高的总正电荷。与主要的静电相互作用方式一致，发现缀合物的结合亲和力随pH降低而增加，反映出在较低pH下质子化程度更高。发现新霉素B-细胞周期蛋白缀合物的锌（II）配合物以更高的亲和力与A位点RNA结合（IC 50 = 0.85-1.32μM），这是因为Zn（II）-周
• Structure–activity relationship studies of symmetrical cationic bolasomes as non-viral gene vectors
  作者：Zheng Huang、Yi-Mei Zhang、Qian Cheng、Ji Zhang、Yan-Hong Liu、Bing Wang、Xiao-Qi Yu

  DOI：10.1039/c6tb00870d

  日期：——

  Compared to traditional cationic lipids, bola-type lipids have received much less attention despite their advantages including the ability to form more stable and regular-shaped liposomes. In this report, a series of novel symmetric cationic bolalipids based on lysine or cyclen headgroups were designed and synthesized. Structure-activity relationships including the effect of the hydrophobic chain length

  与传统的阳离子脂质相比，硼酸型脂质尽管具有优势，包括能够形成更稳定和规则形状的脂质体，但受到的关注却少得多。在此报告中，设计并合成了一系列基于赖氨酸或cycln头基的新型对称阳离子玻利班脂。系统地研究了结构活性关系，包括疏水链长度和阳离子头基对脂质体形成，DNA结合，脂质体的物理性质和基因转染的影响。结果表明，适当的疏水链长度对于形成具有良好DNA结合和缩合能力的纳米级酒体至关重要。基于MTS的细胞生存力分析表明这些bolosome / DNA复合物的细胞毒性较低。Lys-14-10具有36个原子长度的疏水链，在两种细胞系中表现出最佳的转染效率。流式细胞仪和共聚焦激光显微镜分析表明，由具有这种链的bolalipids形成的双链体可能诱导最高的细胞摄取。对于阳离子头基，赖氨酸比cyclon更适合于这种bola型载体。尽管这些bolalipids的TEs仍低于市售的非博拉脂质脂质转染胺2000
• Cationic lipids containing protonated cyclen and different hydrophobic groups linked by uracil-PNA monomer: Synthesis and application for gene delivery
  作者：Jun-Liang Liu、Qing-Ping Ma、Qing-Dong Huang、Wei-Han Yang、Ji Zhang、Jing-Yi Wang、Wen Zhu、Xiao-Qi Yu

  DOI：10.1016/j.ejmech.2011.06.015

  日期：2011.9

  In this report, as candidates for non-viral gene vectors, cationic lipids L1, L2 and L3 based on protonated cyclen and different hydrophobic groups (cholesterol, dodecanol or diosgenin) linked by PNA monomer were designed and synthesized. Their liposomes were easily prepared by mixing the synthesized lipids with dioleoylphosphatidyl ethanolamine (DOPE) under appropriate mole ratios. Agarose gel retardation

  在此报告中，作为非病毒基因载体的候选对象，设计并合成了基于质子化的细胞周期蛋白和通过PNA单体连接的不同疏水基团（胆固醇，十二烷醇或薯os皂苷元）的阳离子脂质L1，L2和L3。通过将合成的脂质与二油酰基磷脂酰乙醇胺（DOPE）在适当的摩尔比下混合，可以轻松地制备它们的脂质体。琼脂糖凝胶阻滞和荧光滴定通过溴化乙锭（EB）显示出与K个强DNA结合能力SV为1.21×10的值7，3.76×10 6和2.90×10 6 中号-1用于从所形成的脂质体L1 - L3， 分别。这些脂质体可以在一个延缓的pDNA ñ / P 3个脂质复合物形式与周围200-300纳米尺寸和+ 20-50毫伏的ζ电位值在比ñ / P比为4〜10此外，的细胞毒性MTT检测到的三种脂质复合物是完全不同的。HEK 293T和A549细胞系体外转染的结果表明，在N / P比为6，脂质/ DOPE摩尔比为1：2的情况下，L3 / DOPE