ethyl tetra-2,3,4,6-O-benzyl-β-D-glucopyranosyl-(1→3)-2-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-1-thio-β-D-glucopyranoside

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: ethyl tetra-2,3,4,6-O-benzyl-β-D-glucopyranosyl-(1→3)-2-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-1-thio-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: (2R,4aR,6S,7R,8S,8aR)-6-ethylsulfanyl-2-phenyl-7-phenylmethoxy-8-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-tris(phenylmethoxy)-6-(phenylmethoxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxine
• 化学式: C₅₆H₆₀O₁₀S
• 分子量: 925.152
• InChiKey: IQJNDZDLBTZPSD-HVCQZKTQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9
• 重原子数：
  67
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl tetra-2,3,4,6-O-benzyl-β-D-glucopyranosyl-(1→3)-2-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-1-thio-β-D-glucopyranoside 在 吡啶 、 水 、 乙酸酐 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  基于合成寡糖的卡他莫拉菌糖复合物的形成和免疫学评价

  摘要：

  已发表的研究表明，基于通过还原端连接至载体蛋白的截短解毒脂多糖的复合糖疫苗，在小鼠免疫实验中对所有三种血清型 A、B 和 C 均提供了良好的保护。 (从非还原端开始)截短的LPS结构是从细菌糖基转移酶敲除突变体中获得的，包含去酯化的脂质A、两个Kdo残基和四个或五个葡萄糖部分。这项工作描述了相同的外部 LPS 结构的化学合成，该结构配备有间隔基并从还原端进一步截短，即没有脂质 A 部分并含有四个或五个葡萄糖部分或四个葡萄糖部分和一个 Kdo 残基，以及它们的后续通过五碳双功能间隔基与载体蛋白缀合形成糖缀合物。小鼠和兔子的免疫实验均显示出良好的抗体反应，是免疫前血清的2-7倍。然而，产生的血清仅识别免疫聚糖免疫原，无法与天然 LPS 或整个细菌细胞结合。三种替代抗原的比较分子模型表明，合成结构中不存在的额外 (2 → 4) 连接的 Kdo 残基对分子的形状和体积具有显着影响，从而对抗原结合和交叉反应性产生影响。

  DOI：

  10.1016/j.carbpol.2024.121928
• 作为产物：
  描述：

  β-D-葡萄糖五乙酸酯 在 sodium hydroxide 、 3 A molecular sieve 、 三氟化硼乙醚 、 sodium methylate 、 silver trifluoromethanesulfonate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 ethyl tetra-2,3,4,6-O-benzyl-β-D-glucopyranosyl-(1→3)-2-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-1-thio-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  高效，通用和稳定：噻唑基硫代糖苷作为糖基供体。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200454047

文献信息

• Is an acyl group at O-3 in glucosyl donors able to control α-stereoselectivity of glycosylation? The role of conformational mobility and the protecting group at O-6
  作者：Bozhena S. Komarova、Maria V. Orekhova、Yury E. Tsvetkov、Nikolay E. Nifantiev

  DOI：10.1016/j.carres.2013.11.016

  日期：2014.1

  The stereodirecting effect of a 3-O-acetyl protecting group, which is potentially capable of the remote anchimeric participation, and other protecting groups in 2-O-benzyl glucosyl donors with flexible and rigid conformations has been investigated. To this aim, an array of N-phenyltrifluoroacetimidoyl and sulfoxide donors bearing either 3-O-acetyl or 3-O-benzyl groups in combination with 4,6-di-O-benzyl, 6-O-acyl-4-O-benzyl, or 4,6-O-benzylidene protecting groups was prepared. The conformationally flexible 3-O-acetylated glucosyl donor protected at other positions with O-benzyl groups demonstrated very low or no alpha-stereoselectivity upon glycosylation of primary or secondary acceptors. On the contrary, 3,6-di-O-acylated glucosyl donors proved to be highly alpha-stereoselective as well as the donor having a single potentially participating acetyl group at O-6. The 3,6-di-O-acylated donor was shown to be the best alpha-glucosylating block for the primary acceptor, whereas the best alpha-selectivity of glycosylation of the secondary acceptor was achieved with the 6-O-acylated donor. Glycosylation of the secondary acceptor with the conformationally constrained 3-O-acetyl-4,6-O-benzylidene-protected donor displayed under standard conditions (-35 degrees C) even lower alpha-selectivity as compared to the 3-O-benzyl analogue. However, increasing the reaction temperature essentially raised the alpha-stereoselectivities of glycosylation with both 3-O-acetyl and 3-O-benzyl donors and made them almost equal. The stereodirecting effects of protecting groups observed for N-phenyltrifluoroacetimidoyl donors were also generally proven for sulfoxide donors. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Potent, Versatile, and Stable: Thiazolyl Thioglycosides as Glycosyl Donors
  作者：Alexei V. Demchenko、Papapida Pornsuriyasak、Cristina De Meo、Nelli N. Malysheva

  DOI：10.1002/anie.200454047

  日期：2004.6.7
• Formation and immunological evaluation of Moraxella catarrhalis glycoconjugates based on synthetic oligosaccharides
  作者：Taigh Anderson、Hao Jiang、Aisling Ní Cheallaigh、Dennis Bengtsson、Stefan Oscarson、Chantelle Cairns、Frank St. Michael、Andrew Cox、Michelle M. Kuttel

  DOI：10.1016/j.carbpol.2024.121928

  日期：2024.5

  that glycoconjugate vaccines, based on truncated detoxified lipopolysaccharides from attached through their reducing end to a carrier protein, gave good protection for all three serotypes A, B, and C in mice immunisation experiments. The (from the non-reducing end) truncated LPS structures were obtained from bacterial glycosyl transferase knock-out mutants and contained the de-esterified Lipid A, two

  已发表的研究表明，基于通过还原端连接至载体蛋白的截短解毒脂多糖的复合糖疫苗，在小鼠免疫实验中对所有三种血清型 A、B 和 C 均提供了良好的保护。 (从非还原端开始)截短的LPS结构是从细菌糖基转移酶敲除突变体中获得的，包含去酯化的脂质A、两个Kdo残基和四个或五个葡萄糖部分。这项工作描述了相同的外部 LPS 结构的化学合成，该结构配备有间隔基并从还原端进一步截短，即没有脂质 A 部分并含有四个或五个葡萄糖部分或四个葡萄糖部分和一个 Kdo 残基，以及它们的后续通过五碳双功能间隔基与载体蛋白缀合形成糖缀合物。小鼠和兔子的免疫实验均显示出良好的抗体反应，是免疫前血清的2-7倍。然而，产生的血清仅识别免疫聚糖免疫原，无法与天然 LPS 或整个细菌细胞结合。三种替代抗原的比较分子模型表明，合成结构中不存在的额外 (2 → 4) 连接的 Kdo 残基对分子的形状和体积具有显着影响，从而对抗原结合和交叉反应性产生影响。