Exploration of the molecular architecture of the orthosteric binding site in the α4β2 nicotinic acetylcholine receptor with analogs of 3-(dimethylamino)butyl dimethylcarbamate (DMABC) and 1-(pyridin-3-yl)-1,4-diazepane
作者:Tinna B. Bach、Anders A. Jensen、Jette G. Petersen、Troels E. Sørensen、Serena Della Volpe、Jun Liu、Antoni R. Blaazer、Jacqueline E. van Muijlwijk-Koezen、Thomas Balle、Bente Frølund
DOI:10.1016/j.ejmech.2015.07.024
日期:2015.9
structures of acetylcholine binding proteins (AChBPs) have revealed two different possible extensions to the classical ligand binding pocket known to accommodate various nicotinic agonists. One of the pockets is limited in size while the other is of considerable dimensions and protrudes along the interfacial cleft between subunits. To probe these putative extensions in functional nicotinic acetylcholine receptors
乙酰胆碱结合蛋白(AChBPs)的X射线晶体结构揭示了对经典配体结合袋的两种不同可能的扩展,已知该配体结合袋可容纳多种烟碱激动剂。其中一个口袋的大小受到限制,而另一个口袋的大小却相当大,并沿着亚基之间的界面裂口突出。为了探测功能性烟碱乙酰胆碱受体(nAChRs)中的这些假定的扩展,制备了3-(二甲基氨基)丁基二甲基氨基甲酸酯(DMABC)和1-(吡啶-3-基)-1,4-二氮杂ze的细长类似物,并在神经元处进行了药理学表征异聚nAChRs。尽管新的类似物相对于母体化合物显示出较低的结合亲和力,但所选化合物的功能表征显示它们保留了部分α4β2nAChR激动剂活性。结构-活性关系数据并未表明取代基大小的上限,如果将配体结合在较小的口袋中,这是可以预期的。数据更好地与结合模式一致,在该结合模式中,取代基沿着受体的界面裂隙突出。通过对接至α4-β2nAChR界面的同源性模型以及通过表面等离振子共振生